Le bibliche piaghe d'Egitto si abbattono su Haven, mentre Audrey è alle prese con una donna che sostiene di essere Audrey Parker, Nathan affronta la morte di suo padre.

La gente di Haven comincia ad avere visioni delle proprio paure e Nathan e Audrey cercano di capire se le visioni sono collegate a un ladro che potrebbe distruggere Haven.

Audrey sta indagando sul caso del falso agente Howard; Nathan e Audrey affrontano un'orda di apparecchi elettrici assassini.

Un residente di Haven potrebbe aiutare Nathan e Audrey a fermare una serie di elettrocuzioni. Nel frattempo Duke accetta l'aiuto della sua ex moglie per proteggersi dall'uomo tatuato.

Audrey e Duke invitano Chris ed Evi a un matrimonio e scoprono che uno degli invitati ha la capacità di governare le piante.

Audrey si ritrova intrappolata in un loop temporale dove un incidente d'auto provoca la morte dei suoi cari.

Mentre indagano su un annegamento, Nathan e Audrey investigano la comunità dalla quale il bambino è scomparso. Intanto Duke chiede a Evi di aiutarlo a scoprire cosa sa Driscoll sulla morte di suo padre.

Un banchiere sta nascondendo un oscuro segreto che lo connette a un killer che si nasconde a Haven. Duke da' una mano a un ragazzo scappato di casa mentre Nathan scopre che il suo lavoro è a rischio.

Uno dei Troubled rilascia una piaga dentro una stazione di polizia e il nuovo Capo ordina una quarantena. Audrey e gli altri sono rimasti intrappolanti nella zona di quarantena. Duke affronta Evi sul suo tradimento.

Audrey e Nathan sono alla ricerca di un bimbo scompare nei boschi, la cui sparizione potrebbe essere collegata ai Troubles.

Con l'aiuto di Nathan, Audrey scopre dove si trova Lucy Ripley e va ad affrontarle. Duke e Dwight uniscono le forze per scoprire cosa il padre di Duke ha lasciato in eredità al figlio.

I morti di Haven si risvegliano per svelare i propri segreti, e quelli di Nathan, Audrey e Duke.

Audrey comincia a vedere decorazioni natalizie comparire stranamente in Luglio, solo che lei è l'unica che riesce a rendersene conto, nemmeno Nathan si accorge che c'è qualcosa fuori dall'ordinario. Intanto i residenti di Haven cominciano a sparire senza lasciare traccia.