Resolver el asesinato de una corredora adquiere aún mayor urgencia cuando Jane se da cuenta de que el motivo fue el robo... del bebé de la mujer. Cuando se pone en marcha la investigación, Jane intenta ocultar su embarazo a su madre aunque ella empieza a sospechar, y Maura y Frankie se enfrentan a las consecuencias de su beso.

Una joven de 25 años entra en la comisaria cubierta de sangre, con una pistola, y asegurando que ha matado a alguien. Por desgracia, el trauma ha provocado que no recuerde nada de los hechos y ni sabe quién es o ni quién es la víctima. El equipo trata de desentrañar este extraño caso enfrentándose de paso a la pérdida de un amigo y colega, el detective Barry Frost.

Un asesino está usando anuncios ofertando trabajo en una granja para encontrar el candidato perfecto para el asesinato: hombres a los que nadie echará en falta. Mientras tanto, Jane descubre que mantenerse tranquila durante su embarazo será una tarea difícil.

Cuando un hombre es encontrado asesinado dentro de su supuestamente impenetrable bunker con el que esperaba sobrevivir al fin del mundo, el equipo debe averiguar cómo y por qué fue atacado. A Jane le resulta difícil concentrarse en el caso cuando descubre que Korsak está pensando en la jubilación cuando descubre una solicitud para la pensión y Frankie tiene un secreto que interesa mucho a su madre y hermana.

Maura recibe la llamada del gobernador para que haga el favor de acudir a la residencia de una mujer rica con cáncer terminal de ovarios para certificar su fallecimiento pero una vez allí pronto se da cuenta que está ante un asesinato y el equipo se pone investigar porque alguien quería deshacerse de una persona a la que le quedaban pocos meses de vida. Además Maura conoce al que podría ser su hombre perfecto mientras da una clase en la universidad, pero ella se debate entre las dudas de su mente científica y los instintos de su corazón.

Jane solicita ayuda a Susie para resolver un complicado asesinato de una mujer que habia conseguido adelgazar muchos kilos con ejercicio mientras Maura Isles se encuentra de viaje en una convención.

Durante el transcurso de la investigación del asesinato de un librero especializado en obras poco comunes, Jane y Maura se ven envueltas en el mundo de los escritos celtas.

Los agentes tratan de averiguar el paradero de una persona que ha sido testigo de cómo alguien encargaba el asesinato de una mujer cuyo cadáver ha aparecido cerca de un club nocturno.

Los policías tratan de descubrir qué le sucedió a una mujer cuyos restos han aparecido momificados. Entre tanto, Jane sufre un grave problema personal.

Los agentes colaboran con Korsak en el intento de resolver un caso del pasado que nunca llegó a ser archivado.

Un hombre fallece en una bañera llena de hielo durante una ola de calor; los agentes sospechan que no se trata de una muerte accidental.

Un fiscal es detenido acusado de asesinato pero Jane Rizzoli decide ayudarle cuando llega a la conclusión de que él no cometió el crimen. Entre tanto, Angela le explica a Maura cómo se comportan actualmente,

Después de que Jane salte de un puente para salvar a un sospechoso a la fuga, acusado de matar a su amante, Maura teme haber perdido a su mejor amiga. Mientras tanto, Angela pide ayuda a Frankie porque está buscando trabajo.

Las chicas deben investigar el caso de un pie humano encontrado en la playa. A medida que aparecen más partes humanas, deben tratar de identificar a la víctima.

El equipo debe trabajar con un investigador privado cuando un exitoso diseñador de moda es encontrado envenenado. Además, su mujer ha desaparecido.

Después de que un hombre haya sido encontrado muerto a golpes al lado de la carretera, Jane y el equipo trabaja junto a otro detective que cree estar dando caza al mismo asesino.

El equipo lucha contra corriente para dar caza a un asesino en serie. Maura, por su parte, entabla amistad con un testigo de uno de los crímenes.