Janes und Mauras Freundschaft bekommt einen Dämpfer, als Mauras leiblicher Vater angeschossen wird.

Als die gereizte Atmosphäre zwischen Jane und Maura eskaliert, müssen ihre Angehörigen darunter leiden. Die beiden überwinden jedoch ihre Differenzen, um einen Fall im College-Milieu zu lösen, als eine Leiche in einem Tunnel entdeckt wird. Unterdessen taucht Janes Vater Frankie Sr. wieder auf - was er berichtet, beunruhigt Angela.

Als Maura auf ungewöhnliche Weise Dennis kennen lernt, bringt er ganz neue Saiten in ihr zum Klingen. Jane hat widersprüchliche Gefühle, als sie eine Begegnung hat, die ihre Vergangenheit in Erinnerung ruft.

In der U-Bahn werden tote Prostituierte gefunden, die wie Puppen gekleidet sind. Jane und Maura müssen die Indizien kombinieren. Angela entwickelt neue Ideen für das Café. Und Jane erfährt mehr über Caseys Verletzung.

Jane versucht ein Treffen zwischen Maura und ihrer leiblichen Mutter Dr. Hope Davis zu arrangieren. Angela engagiert sich für einen politischen Wahlkampf. Eine Nonne aus Janes und Frankie juniors Vergangenheit taucht wieder auf.

Als ein wohlhabender Mann ermordet wird, müssen Jane und Maura herausbekommen, wie das Verbrechen mit seiner Firma zusammenhängt. Unterdessen nimmt Maura Kontakt zu ihrer leiblichen Mutter Dr. Hope Davis und ihrer Halbschwester auf. Angela flirtet weiterhin mit Lt. Detective Cavanaugh.

Die Detectives müssen lückenhafte Indizien kombinieren, um dem Mörder eines Psychiater-Ehepaars auf die Spur zu kommen.

Der Star einer Boyband kehrt wegen eines Auftritts in seine Bostoner Heimat zurück und wird ermordet. Jane und Frankie sind mit dem Opfer aufgewachsen und wollen den Fall unbedingt aufklären. Gleichzeitig müssen Jane und Maura entscheiden, ob Angela endlich die Wahrheit über Lydias Schwangerschaft erfahren soll, während Angela schon die Babyparty vorbereitet.

Eine Statue zerbricht - zum Vorschein kommt eine weibliche Leiche. Jane und Maura müssen den Mörder schnell finden, denn der tötet ständig neue Opfer. Im Morddezernat wird dem Team ein neuer Detective zugeteilt. Unterdessen kehrt Dennis Rockmond nach Boston zurück, nachdem er Maura versetzt hat: Er möchte sie wieder für sich gewinnen. Bei Lydia setzen die Wehen ein.

Als im Café der 1. Abteilung ein Mann beim Frühstück vergiftet wird, müssen Jane und ihr Team den Fall schnell analysieren, weil sowohl Angela als auch der aufbrausende Stanley unter Verdacht geraten.

Ein berühmter junger Memoirenautor wird tot aufgefunden - offenbar Selbstmord. Doch Jane und Maura entdecken bald, dass mehr dahinter steckt. Gleichzeitig verbeißt sich Frost in den alten Fall eines jungen Afro-Amerikaners, dessen letzte Berufungsmöglichkeit erschöpft ist. Und Jane merkt, dass Angela eine heimliche Affäre hat.

Die virtuelle und die reale Welt kollidieren, als ein Bierbrauer ermordet wird. Angela versucht ihre gescheiterte Romanze zu vergessen, indem sie mit einem neuen Mann ausgeht. Jane und ihr Team beginnen sich um Teenager aus Problembezirken zu kümmern - was fast in einer Katastrophe endet.

Ein Ex-Football-Spieler wird während einer Wohltätigkeitsveranstaltung in seinem früheren College in einer Autowaschanlage erstochen. Jane, Maura und das Team müssen das Indizien-Puzzle zusammensetzen, um dem Mörder auf die Spur zu kommen. Unterdessen trifft Frosts Mutter mit unerwarteten Neuigkeiten in Boston ein. Lt. Col. Casey Jones begegnet Jane und muss seinerseits Alarmierendes berichten.

Dr. Hope Martin kehrt zurück und bittet Maura um einen Gefallen, der ihr Leben verändert. Jane macht sich Sorgen wegen Lt. Col. Casey Jones' Rückgratoperation, und Tommy präsentiert stolz sein Baby T.J. Doch all das wird zur Nebensache, als ein Haus zusammenstürzt und Angehörige unter sich begräbt.