Vänskapen mellan Maura och Angie sätts på prov när Mauras biologiske far, gangstern Paddy Doyle, blir skjuten. Jane hamnar i en internutredning och hennes affär med specialagent Dean avslöjas.

Spänningen fortsätter att byggas upp mellan Jane och Maura men de måste lägga meningsskiljaktigheterna åt sidan när de utreder ett fall med en student som hittades död i en tunnel. Frankie Sr återvänder med nyheter som upprör Angela.

Maura möter en ny kille som heter Dennis på ett mycket ovanligt sätt, och han öppnar upp en annan sida av henne. Det är blandade känslor för Jane när en person från hennes förflutna återvänder.

Unga kvinnor utklädda till dockor dyker upp döda i kollektivtrafiksystemet och Jane och Maura försöker pussla ihop ledtrådarna. Angela kommer med nya idéer för caféet. Jane får veta mer om hur Casey blev skadad.

Jane försöker hjälpa Maura att träffa sin biologiska mor, Dr Hope Davis. Angela blir indragen i en politisk kampanj. En nunna från Janes och Frankies förflutna kommer tillbaka.

En rik finansiär hittas död, iklädd kappa och mask, i en papperskorg och Jane och Maura tar sig an fallet. Maura får djupare kontakt med sin biologiska mor och sin halvsyster, som fortfarande inte vet att Maura är släkt med dem.

Rizzoli och Isles utreder mordet på ett äkta par som båda var psykiatriker. På hemmaplan upptäcker Rizzolis familj att de kan ha kopplingar till en gravid främling.

En brud dödas mitt under ett bröllop och Jane och Maura försöker ta reda på om brudgummens före detta flickvän är inblandad, eller om det finns en koppling till brudens europeiska rötter.

pojkbandsstjärna återvänder till sina rötter för att uppträda men det slutar med att han blir mördad. Jane och Frankie växte upp med offret. Samtidigt måste Jane och Maura avgöra om det är dags att säga sanningen till Angela om Lydias...

En man förgiftas till döds på Division 1 Café och teamet måste snabbt hitta källan eftersom Angela och den argsinte Stanley blir misstänkta. Tommy vill ha bevis på att han är den biologiska fadern till Lydias bebis.

Jane och Maura utreder det som verkar vara en ung författares självmord. Samtidigt blir Frost besatt ett gammalt fall, och Jane får information om en hemlig romans med Angela inblandad.

Angela försöker att gå vidare från en misslyckad romans genom att träffa en ny kille. Jane och teamet hjälper utsatta tonåringar, men det håller på att sluta i katastrof.

Jane och Maura försöker lösa mordet på en man som blir dödad på en välgörenhetstillställning för sin gamla skola. Oväntade nyheter leder till ett besök av Frosts mamma, och Casey träffar Jane.

Hope ber Maura om ursäkt och Jane oroar sig över Tommys operation. Tommy kommer för att visa lille TJ men fokus ändras fort när en byggnad rasar och människor blir fast i det kollapsade huset.