Ryan se ujímá vedení Divize s Nikitou po svém boku. Jejich první mise v novém režimu má přivést zpět „Třicítku špinavců“, tuláky, kteří po Percyho smrti nereagovali na odvolání z Divize. Jejich první mise bohužel nejde tak, jak bylo plánováno, a Michael je zatčen, což nutí Nikitu, aby pro něj vymyslela únikový plán. Alex reprízuje své alter ego, zkaženou ruskou princeznu Alexandru Udinovovou, a to velmi unikátním způsobem. Mezitím se Birkhoff snaží, navzdory rostoucímu zájmu o ni, udržet pracovní vztah se Sonyou.

Nikita, Michael a tým extrahují mladou dívku jménem Liza, kterou držel zběhlý agent Divize Wade. Wade ji školil a trénoval jako agentku Divize, aby mu pomohla v jeho osobní misi. Nikita se zoufale snaží proniknout k Lize, ale ta využívá zmatku a z Divize unikne. Tým spěchá, aby ji našel dřív, než dokončí svou misi - vypuštění smrtící chemické látky v budově OSN během zvláštního jednání. Mezitím Lizin únos vyvolá v Alex bolestivé staré vzpomínky.

Ryan řekne Nikitě o zatčení tajného agenta, kterého potřebují vytáhnout z vězení, Nikita se ptá, proč Divize stále pokračuje v Percyho starých misích. Nikita, Michael a Sean se pokoušejí zastavit teroristický útok, ale jeden muž při tom zastřelí Alex. Mezitím Birkhoff a Sonya pokračují v hašteření.

Amanda posílá zběhlého agenta Divize, Anne (SARAH ALLEN), aby Owena dostala z ruského vězení, ale Owen unikne a vrátí se do Divize s Nikitou. Mohou Michael a Ryan Owenovi věřit?

Ryan připouští, že Divize je v potížích, a Nikita a Michael jsou vzteky bez sebe, že to před nimi tajil. Alex a Owen jsou v ohrožení při výbuchu a domnívají se, že byl naplánován zasvěceným zrádcem.

Když je zajat obchodník se zbraněmi Cyrus (ISAIAH MUSTAFA), je využit jako návnada k nalákání Amandy. Mezitím se Birkhoff vydává po horké Amandině stopě.

Birkhoff oznámí Nikitě, že Sonya je Amandin krtek. Nejen, že Amanda reaktivovala Sonyin vražedný čip, ale také nasadila do Divize druhého krtka, aby na ni dohlížel. Nikita, Michael a Ryan vymýšlejí plán, jak využít Sonyu k odhalení Amandina úkrytu a Birkhoff nastaví pasti na druhého krtka. Mezitím Michael konfrontuje Alex ohledně užívání drog a ho žádá, aby to neříkal Nikitě.

Nikita a Owen čelí nepoctivému „čističi“ jménem Liam, zatímco Michael zaujímá nové místo v divizi. Vztah Michaela a Nikity se stává napjatým, když sleduje její práci s Owenem.

Ray (Matt Bushell), zběhlý agent, unese svou přítelkyni Kate (Anna Hopkins), takže Ryan vysílá tým, aby ji zachránil. Nikita je zmatená, když Michael pošle Owena do terénu místo sebe. Mezitím Sean rozhodne o Alex.

Michael se vzdává své role terénního agenta a pokračuje uvnitř Divize v roli šéfa probíhajících operací. Po prostudování klíčové Birkhoffovy informace začne Nikita připravovat tajnou misi, která ji zavede na nebezpečné území. Když to Michael, Alex a Ryan zjistí, následují ji do Kosova, ale výsledek má pro Divizi dalekosáhlé důsledky.

Agentka CIA jménem Naomi narazí na spis, který podrobně popisuje spojení Madeline Pierceové s Divizí, a předá jej řediteli CIA, Morganu Kendrickovi. Když je Kendrick krátce nato zabit, Amanda zaútočí na Seana a CIA ho bere do vazby kvůli podezření z bombového útoku. Nikita slibuje Alex, že Seana osvobodí a přichází s plánem, který by ho mohl buď zachránit, nebo ho stát život.

Když Birkhoff dostane tip od Shadowbota, že Ari je v NY, Nikita a Owen se ho chystají vyzvednout dřív, než to udělá FBI. Ari však prozradí, že si vše naplánoval, aby měl šanci promluvit si s Nikitou. Oznamuje jí, že Amanda zašla příliš daleko a pracuje s teroristou, který plánuje útok na americké půdě. Ari požaduje padesát milionů dolarů za informace, které by mohly vést k zajetí teroristy. Nikita a Michael jsou ohromeni, když Ryan zvažuje zaplacení. Sean žárlí na vztah Alex a Owena.

Aby získala kontrolu nad černou skříňkou, Amanda plánuje unést Ariho syna Stefana (Dylan Minnette), aby ho použila jako páku. Ari je stále v ochranné vazbě Divize a prosí Nikitu o pomoc. Stefanův bodyguard Krieg (Andrew Divoff) však dokáže zajmout Nikitu i Amandu a obě musí spolupracovat při útěku. Owen má vztek na Michaela za to, že místo něho určil jako Nikitinu zálohu Alex.

Amanda drží Alex jako rukojmí a informuje Nikitu, že Alex propustí výměnou za Ariho. Michael pověří Nikitu a Seana, aby se postarali o výměnu vězňů, ale Ryan přidal na poslední chvíli Owena do týmu, což připadá Michaelovi podezřelé. Zatímco je v zajetí, Alex se spřátelí s vězeňkyní jménem Larissa a slíbí jí útěk z vězení, což je v konečném důsledku v rozporu s Nikitiným plánem, a tak nutí Alex vybrat si mezi ní a jejím slibem Larisse.

Když Nikita rozhodne, že Divize by měla přijmout vládní misi na odstranění prezidenta Čadu během jeho návštěvy Paříže, Alex zaujímá stanoviska a odmítá se účastnit. Naštvaná, že Nikita má před všemi tajemství, stejně jako Percy, najme Alex Birkoffa, aby vykopal tajemství Danforthu, které by využila jako pákový efekt pro případ, že by se něco stalo s vládou. Alex a Birkhoff jsou šokováni, když narazí na tajemství tak velké, že by to mohlo doslova vyhodit Divizi do povětří.

Nikita a Michael se dozvědí o nové protetické ruce, která by mohla Michaela přimět vrátit se zpět ke svému starému já, ale cena je obrovská. Alex a Sean jsou pověření pověřeni vyšetřováním, kdo uvnitř Divize stojí za vzpourou, která končí krveprolitím.

Alex přiznává Birkhoffovi svou touhu opustit Divizi. Amanda mezitím začne Owenovi poskytovat něco, co nikdy nedokázal najít - vzpomínky na svoji skutečnou minulost. Navzdory Nikitiným pokusům o pomoc, začíná Owen konfrontovat události ze své minulosti.

Na základě strašlivého procesu Amandy v oblasti duševního kondicionování je Nikita poslán na hrůznou cestu do vzpomínek. Během tohoto procesu objevuje Nikita nejhlubší a nejstřeženější Amandino tajemství. Alex, která je odhalena jako vůdce povstání, usiluje o záchranu všech, protože události prudce eskalují. Michael je zamčen spiklenci Divize, Birkhoff a Sean musí jednat, aby zachránili ženy, které milují. Během uzavření Divize přivedly nově objevené vzpomínky Owena ke znepokojujícím akcím.

Pošpiněna krví a ničením Divize, vrací se emocionální Alex do starých kolejí a násilně udeří. Protože většina jejich personálu je mrtvá, zlomená nebo rozptýlena, musí Nikita a Michael Divizi pozvednout z popela, aby zjistili, kdo a co může být zachráněno - a to rychle, než si prezidentka uvědomí hloubku škod. Pronásledují je vzpomínky na slavné dny Divize. Birkhoff bojuje se svými vlastními ztrátami.

V troskách Divize padne černá skříňka do rukou vzbouřeného agenta vedeného Amandou. Bez podpůrného personálu, s úzkým vedením a s nedostatkem času. V té chvíli se vrací obchodník se zbraněmi, napravený zběhlý agent Cyrus, aby udělal správnou věc. S jeho pomocí Nikita, Michael a Alex spustí odvážnou operaci na silně zabezpečeném ekonomickém summitu G-20, aby znovu získali kontrolu nad skříňkou a budoucností všech.

Michael zpochybňuje Nikitin závazek života mimo Divizi - a není jediný, kdo má pochybnosti. Stále však nad týmem visí hrozba Amandy, zvláště proto, že se nyní spojila se záhadnými novými partnery, kteří ji vybavili děsivou novou zbraní. Alex zvažuje zajímavou nabídku od nositele Nobelovy ceny.

Amanda nutí Nikitu do život ohrožující situace, kdy si musí vybrat mezi zachráněním Michaela nebo záchranou sama sebe. Tým se snaží najít způsob, jak Amandu zastavit, ale se zmenšenou divizí mohou být ve výsledku zastřeleni.