Nu Kono en Chin uit Hawaï zijn vertrokken, gaan McGarrett en Danny op zoek naar versterking voor hun team. Ze rekruteren de strandwacht en voormalig politieagente Tani Rey. Ondertussen gaan ze op zoek naar een moordzuchtige brandstichter, die met de hulp van een hacker uit de gevangenis is ontsnapt.

McGarrett en zijn team werken samen met een gewonde politiehond in een drugszaak. De voormalige Navy-SEAL Junior Reigns doet een open sollicitatie bij Five-0. McGarrett wil dat hij eerst naar de politieacademie gaat.

De moord op het hoofd van een machtige misdaadfamilie is het begin van een reeks vergeldingsmoorden. Five-0 roept de hulp in van een oude vriend om het geweld te stoppen.

Tijdens Halloween ontdekt Five-0 dat twee recente moorden gebaseerd zijn op klassieke Hawaïaanse volksverhalen. Grover bezoekt een terdoodveroordeelde die vlak voor zijn executie informatie wil geven over een oude moordzaak.

Five-0 is op zoek naar een man die al twee toeristen heeft vermoord. Hij lijdt aan een meervoudig persoonlijkheidsstoornis waardoor hij erg onberekenbaar is. Danny heeft een stresscoach ingehuurd voor McGarrett.

Net nadat McGarrett Adam heeft opgehaald van het vliegveld, krijgt hij een melding van Junior over een bankoverval. De daders zijn ontsnapt via een tunnel. McGarrett, Adam en Junior zetten de achtervolging in.

Een stuntpiloot komt om het leven als zijn vliegtuigje crasht. Five-0 ontdekt dat het geen ongeluk was. Ook blijkt het slachtoffer iemand anders te zijn dan iedereen dacht.

Een jacht dobbert stuurloos op zee. Five-0 treft er meerdere doden aan. McGarrett vermoedt dat ze om het leven zijn gekomen door een biowapen. McGarrett, Danny, Junior en Tani lopen nu zelf ook gevaar en hebben nog 8 uur de tijd om een tegengif te vinden.

Nadat Five-0 in aanraking is gekomen met een biowapen, liggen de teamleden in quarantaine in het ziekenhuis. Daar wordt Danny neergeschoten. Terwijl artsen vechten voor zijn leven, droomt Danny over de toekomst van zijn familie en collega’s.

Op kerstavond vertelt Danny Charlie over een recente zaak van Five-0, waarin overvallers zich hadden verkleed als kerstman. Junior wordt officieel lid van het team.

Een FBI-agent die hard optrad tegen de georganiseerde misdaad op Hawaï is vermoord. McGarrett houdt ieder bendelid op het eiland aan om de dader te vinden. McGarrett wil dat Adam een nieuwe afdeling binnen Five-0 opzet die zich richt op de georganiseerde misdaad.

Een man die wordt beschuldigd van moord op zijn vrouw wil zelfmoord plegen. Grover probeert hem van zijn plan te weerhouden, terwijl het team uitzoekt of de man misschien onschuldig is.

Als het lijk van een diamantsmokkelaar van een kerkhof wordt gestolen, gaat Five-0 op zoek naar zijn partner. Adam rekruteert de eerste informant voor zijn nieuwe team. Er is ingebroken in het restaurant van McGarrett en Danny.

Een privédetective is op dezelfde manier om het leven gebracht als zijn cliënt. Adam geeft Jessie een gevaarlijke opdracht, met desastreuze gevolgen. Danny’s oom Vito komt op bezoek om te helpen met het restaurant.

Tani en Junior gaan undercover als toekomstige ouders in een privéschool waar de directeur is vermoord. De ontvoerder van Adam is uit op een grote som geld, die Adam ergens verstopt zou hebben.

Een missie van Adam loopt helemaal mis als een lading dodelijk chloorgas in verkeerde handen valt. Ook begint Adam te twijfelen aan de loyaliteit van Jessie.

Er wordt een lijk aangetroffen in de kofferbak van Adam. Hij wordt erin geluisd en Five-0 gaat aan de slag om zijn onschuld te bewijzen. Tani en Junior gaan een dagje in uniform de straat op.

Een huurmoordenaar die werd gezocht door McGarretts vader, maar nooit is opgepakt, biecht zijn daden op aan McGarrett. Jessie neemt een gevaarlijke beslissing die Adams leven kapot kan maken.

De CIA roept de hulp in van Five-0 om een vermeende terrorist op te pakken, die bezig is een vuile bom te maken. Junior denkt na over de relatie met zijn vader als hij in een ravijn valt. Adam neemt een ingrijpende beslissing.

Harry Langford is terug op Hawaï. Hij regelt de beveiliging van een aantal leden van de Britse koninklijke familie. Als de tienerdochter wegloopt, schakelt Harry de hulp in van Five-0. Grover, Tani en Junior proberen een oude moord op te lossen, die is vastgelegd op video.

Dukes kleindochter is ontvoerd. De kidnappers willen dat Duke bewijsmateriaal van de politie steelt. Als Duke vervolgens zelf bestolen wordt, moet Five-0 hem helpen. Jerry gaat undercover in een psychiatrische instelling om een moord op te lossen.

Een vriend van Junior is op de vlucht geslagen, nadat hij getuige was van de moord op een maffiabaas. Five-0 ontdekt dat de FBI de zoon van de maffiabaas in de gaten hield.

Junior reist met de Navy SEALs naar Nigeria om een Amerikaanse gijzelaar te bevrijden. McGarrett besluit mee te gaan. Gerard Hirsch en Kamekona helpen Grover en Tani bij een moordzaak die te maken heeft met een door de nazi’s geroofd kunstwerk.

Er duikt een Russische onderzeeër op voor de kust van Waikiki. Five-0 moet uitzoeken wat de boot daar doet. Kamekona en Flippa bemoeien zich met het restaurant van Danny en McGarrett. Tani doet een verontrustende ontdekking in Adams huis.