La Five-0 indaga su un hacker di classe mondiale, che altri non è che il fratello dell'hacker seriale Ian Wright, dopo che ha hackerato la prigione di stato delle Hawaii per liberare l'omicida ed incendiario seriale Jason DuClair. Comincia così una caccia all'uomo che termina in uno scontro a fuoco.

In seguito ad un fallito blitz antidroga, la Five-0 fa squadra con la DEA per risolvere il caso. Nel frattempo Junior Reigns si presenta da McGarrett chiedendogli un lavoro.

La Five-0 con l'aiuto dell'ex agente del MI6 Harry Langford investiga l'omicidio del mafioso Jimmy Okada e di 9 membri della sua famiglia criminale.

L'informatore della Five-0 Toast viene assassinato durante una telefonata tra lui e McGarrett.

Ad Halloween la Five-0, con l'aiuto di Alicia Brown, indaga sull'omicidio di Tyler Riggins che è stato trovato morto nel suo camion.

Quando un uomo con un disordine multiplo della personalità, in uno diventa violento mentre nell'altro un bambino, commette una serie di omicidi, la 5-0 deve fare di tutto per trovarlo.

Dopo aver preso Adam dall'aeroporto, McGarrett riceve una chiamata da Junior che lo informa che è in corso un furto in una banca. In seguito i 3 entrano nella banca che i criminali sono scappati attraverso un tunnel. Ha quindi inizio una caccia all'uomo per catturarli.

La Five-0 è chiamata ad indagare su uno schianto aereo che ha ucciso il famoso stuntman Jason Sachs.

La Five-0 indaga su una donna che è stata trovata alla deriva incosciente. McGarrett, Danny, Tani e Junior scoprono uno yacht abbandonato e 11 cadaveri.

McGarrett, Danny, Tani e Junior si stanno recuperando dagli eventi, si trovano in quarantena in ospedale. Ad un certo punto una persona irrompe nella stanza e spara a Danny. Il team non può lasciare la stanza in quanto un esplosivo è stato piazzato sulla porta.

Nel giorno della vigilia di Natale, Danny racconta la favola della buonanotte a Charlie. Si tratta di una storia vera dove alcuni veterani di guerra feriti aiutano la squadra Five-0 ad arrestare e incriminare un gruppo di ladri travestiti da Babbo Natale. Nel frattempo, Junior ottiene il distintivo entrando ufficialmente nella squadra.

Il governo decide di affrontare le violenze delle gang inviando una squadra, ma un membro viene ucciso a causa di una bomba. La squadra Five-0, insieme alla squadra governativa e alla guardia nazionale cercheranno di risolvere l’omicidio.

Mentre sono in auto Lou Grover e suo figlio vedono un uomo deciso a suicidarsi. Grover cercerà di parlargli per tentare di farlo desistere, mentre il resto della squadra indaga sul suo caso.

Nel ristorante di McGarret e Danny avviene una rapina, così i due si chiedono a Pua Kai, della polizia di Honolulu, di occuparsi del caso e recuperare gli attrezzi rubati.

Lo zio di Danny, Vito arriva sull'isola per aiutare a finire i lavori al ristorante.Tuttavia, mente lo zio dispensa i suoi non utili consigli,Danny e McGarrett ricevono l'informazione sul ritrovamento di un cadavere nella laguna di Waimano Falls.

La squadra della Five-0 si trova a indagare sulla scomparsa del preside Waller della scuola Lawrence Academy.

Adam aiuta Jessie a rubare delle bombole di gas cloro chieste da Hideki, usate nella produzione di metanfetamina. Kazuya Nimoto, uno degli uomini del clan, rivende due bombole all'insaputa di Hideki,acquistate da un gruppo di persone comuni solo in apparenza.

Per una soffiata anonima, Adam viene arrestato in auto dalla polizia e nel bagagliaio viene trovato il corpo di Hideki Tashiro. La squadra lavora per scagionare Adam e trovare chi l’ha incastrato.

Un uomo anziano si reca alla Five-0. Si rivela essere un sicario legato al crimine organizzato. Non fu mai arrestato dal padre di McGarrett. L'uomo chiede del comandante Steve per costituirsi e confessare gli omicidi commessi. Inoltre rivela dove ha seppellito i corpi. Intanto Adam vede la sua sorellastra che gli concede solo sei ore per consegnarle i 20 milioni di Shioma.

Alle Hawaii ritorna Catherine, ha bisogno dell'aiuto della Five-0 per cercate e trovare una partita di uranio impoverito che potrebbe portare alla cattura del capo di una cellula terroristica somala che tenta di trovare da mesi. Intanto, Junior durante una corsa con il cane cade in un burrone e ha bisogno di soccorsi. Adam, scosso dalla morte di Jessie, informa McGarrett che vuole lasciare l'incarico.

Alla Five-O viene consegnato un pacchetto anonimo che contiene una videocassetta che documenta un omicidio avvenuto vent’anni fà. Tani, Grover e Junior capiscono che, a riprendere l'omicidio di nascosto e in diretta, fu l’ex inserviente Arthur Dubbins,un voyer che lavorava proprio nel motel in cui avvenne l'omicidio.

Ben Pollard, paziente dell’ospedale psichiatrico di Kanehoe, viene rinvenuto morto in un dirupo. La Five-O invia Hector, sotto copertura all’ospedale, che scopre che fra i pazienti si nasconde un criminale ricercato perché fuggito dall’FBI, nonche assassino di Ben Pollard.

Tommy Boyle,ex boss mafioso, viene ucciso e Cammy Lin è la testimone del delitto visto che era in casa, per aiutare la madre in una seduta di agopuntura, quando avviene l'omicidio. Cammy scappa con la madre Mei che a causa di una gamba rotta non riesce a proseguire e viene uccisa. La Five-0 indaga sulle morti sapendo che i federali stavano già indagando su Conor Boyle, il figlio di Tommy nonché erede dell'impero criminale del padre.

Mentre fanno una grigliata a casa di McGarrett, Junior sparisce misteriosamente. Tramite una telefonata, Junior avverte McGarrett che è stato richiamato dai Seal per una missione segreta in Nigeria. Anche McGarrett si unisce alla missione che consiste nel salvare un ex ufficiale dei Navy SEAL preso in ostaggio.