Отряд 5.0 продолжает расследовать дело, связанное с группировкой, торгующей людьми. Это дело становится для Коно всё более личным. Тем временем Макгарретт рискует своей жизнью, чтобы спасти девочек, а Дэнни раздражается из-за его походов к врачам насчёт пересаженной печени. Чин раздумывает над предложением переехать в Сан-Франциско.

Команда 5.0 неохотно верит Макгарретту, когда он получает сообщение о крупном теракте на Гавайях от экс-террориста, которого захватил 10 лет назад. Между тем, Чин получает предложение запустить свою собственную целевую группу в Сан-Франциско. Кроме того, Коно и Адам помогают Хиршу в расширении бизнеса по уборке мест преступлений.

Дэнни должен защитить свидетеля, находящегося в коме, который проходил по его последнему делу в полиции Гавайев семилетней давности. Он должен работать вместе со своим бывшим капитаном, а Стив и команда 5.0, тем временем, делают для их спасения всё возможное. Во флешбэках показывается работа Дэнни над этим делом семь лет назад и обстоятельства, приведшие его к знакомству с Макгарреттом.

Отряд 5.0 расследует смерть в результате автокатастрофы одного из последних оставшихся в живых после гибели линкора «Аризона» 7 декабря 1941 года. Макгаррет вскоре обнаруживает, что погибший служил вместе с его дедушкой, и прилагает все усилия, чтобы поймать виновных. Между тем, Адам приступает к новой работе в качестве строителя и после того, как обнаруживает фрагмент кости и думает, что это может быть место захоронения, просит помочь Джерри разобраться в деле.

Расследование гибели сотрудников береговой охраны выводит Отряд 5.0 на след Мишель Шиомы; вскоре она и её люди захватывает Макгарретта, Коно, Чина и Дэнни в джунглях. Джерри бьёт тревогу и в попытке спасти друзей обращается за помощью к полиции. Тем временем Гровер и его сын отправляются в Чикаго, чтобы Ли мог дать показания против своего бывшего друга и напарника Клэя Максвелла.

Отряд 5.0 помогает частному детективу Гарри Брауну в возвращении заложника — богатой женщины, чей муж, подозревая измену, установил за ней слежку. Вскоре становится ясно, что у самого мужа похищенной была любовница и мотив для похищения жены. Тем временем Дэнни узнаёт, что его бывшая жена разводится.

Макгарретт и Коно расследуют исчезновение девушки-подростка, которая, возможно, попала в руки группировки, занимающейся детской проституцией. Коно видит в поимке преступников свою личную миссию. Тем временем Чин и Лу расследуют убийство одного из членов центра помощи алкоголикам. В то же время Дэнни навещает свою сестру в Нью-Джерси.

Макгарретт и Дэнно отправляются в джунгли и там им удаётся найти украденный уран, с использованием которого была создана грязная бомба. Им приходится преодолеть препятствия джунглей и не допустить детонации взрывного устройства.

Команда 5.0 снова оказываются втянуты в игру серийной убийцы Мэдисон Грей — вся в крови, она заявляется в отделение полиции и заявляет, что у неё амнезия. Анализ ДНК показывает, что кровь принадлежит Алисии Браун...

Стив и Дэнни планируют провести День всех влюблённых со своими девушками, а остальная часть команды занимается расследованием довольно необычного убийства.

Отдел 5.0 расследует дело об убийстве, связанное с незаконной охотой на акул. В ходе расследования выясняется, что за убийством может стоять нацист, который скрывается в поселении для прокажённых.

Отдел 5.0 оказывается в сложной ситуации, когда подозреваемый сбегает на суверенную территорию, принадлежащую коренному народу Гавайев. Он должны найти убийцу не нарушая местных обычаев, чтобы не вызвать кризиса.

Макс с женой решили уехать с Гавайев, и Макс прощается со своими друзьями из команды 5.0. Однако прощальную вечеринку приходится на время отложить, чтобы поймать убийцу полицейского.

Чин спасает Сару, однако его самого похищает картель. Команда ищет способ спасти его до того, как он будет предан казни. Тем временем Лу идёт под прикрытие как менеджер по продаже автомобилей — ему нужно расследовать на первый взгляд простое убийство, которое оказывается намного более запутанным.

Команда 5.0 едет в Мексику, чтобы спасти племянницу Чина, Сару, которую похитили неизвестные. Жизни членов команды находятся в опасности...

Команда 5.0 начинает расследование десятилетней давности, после того, как подросток с посттравматическим синдромом подвергается гипнозу. Под гипнозом парень вспоминает, что в детстве был свидетелем убийства. Сестра Дэнни, Бриджет, прилетает на Гавайи, чтобы принять участие в конференции.

К Джерри обращается его подруга-конспиролог, у которой есть весьма убедительные доказательства того, что за убийством Джона Кеннеди стоит один из работников её администрации. После убийства подруги Джерри, отряд 5.0 берётся за это дело.

Грейс и сопровождающий её Дэнни отправляются на школьный Зимний бал. На вечеринке школу захватывают с целью похитить сына дипломата и берут всех учеников в заложники. Дэнни и Лу шокированы, когда выясняется, кем является парень дочери Дэнни.

Кэтрин возвращается и сообщает, что мать Макгаррета была взята в плен в результате провалившейся попытки вытащить заключённого и её собираются казнить. Тем временем апелляция Чина по опеке над Сарой проиграна, и он вынужден смириться с тем, что Сара в скором времени переедет в Мексику.

Во время Хэллоуина команда 5.0 расследует убийство медиума, у которого обнаруживается уголовное прошлое. По всей видимости, медиум умер от страха. Тем временем Адам и Коно оказываются в плену у адептов некоего ордена смерти, которые собираются принести их в жертву.

Отряд 5.0 ищет оружие, которое было украдено из тайника в тире, пока преступник не воспользовался им. Коно наконец-то воссоединяется с мужем Адамом, которого выпускают досрочно из тюрьмы.

Хотя Алисии и удаётся понять, кем является мститель, она и Макгаррет оказываются в плену у преступника. Команда 5.0 делает всё возможное, чтобы спасти Алисию и Стива из смертельной ловушки.

Проснувшись утром, Алисия обнаруживает труп с шахматной фигурой во рту в собственной постели. Тем временем отряду 5.0 нужно арестовать преступника, чьи подручные охотятся на членов их команды.

Отряд 5.0 вместе с агентом МИ-6 Гарри Лангфордом пытаются предотвратить планирующийся теракт в Европе, обезвредив террористов. Чтобы вычислить серийного убийцу, охотящегося за убийцами, Макгаррет и Дэнни обращаются к бывшему аналитику ФБР Алисии Браун.

Пока Стив и Дэнни восстанавливаются после операций, на островах обнаруживают два тела с шахматными фигурами во рту. В городе начинает действовать мститель, что приводит к росту беспокойства отдыхающих на Гавайях. Макгаррет восстанавливается после трансплантации печени, а Чин Хо должен принять сложное решение относительно племянницы.