İşlenen bir cinayet sebebiyle Five-0, bir Oahu sarayına yüzlerce yıl önce yapılan bir baskını inceler. Davaya korsanlar, gömülü bir hazine ve çalınan bir tabloyu harita olarak kullanan bir katil de dahil olur. Ayrıca, düğünlerinden sonraki sabah Gabriel, Kono ve Adam’ı tehdit eder ve onlara işkence yapar. Danny, Catherine'in adaya dönmesi nedeniyle McGarrett için endişe duymaktadır.

Five-0 bir bomba imha ekibine yapılan saldırıyı incelemektedir ve suçlu, hapisteki kundakçı Jason Sinclair serbest bırakılmazsa, diğer gizli patlayıcıları da patlatmakla tehdit etmektedir. Ayrıca Adam hastaneden döndükten sonra Kono, izlendiklerini fark eder ve McGarrett Catharine ile ilişkisini bir üst seviyeye taşımaya hazırlanır.

Tüplü dalış yapan biri, yakın zamanda başka bir cinayette kullanılan bir silahla öldürülmüştür. Five-0 bu olayı araştırmaktadır. McGarrett ise Catherine'e evlenme teklif etmeye hazırlanmaktadır.

Five-0, zengin bir münzevinin yanında yaklaşık bir milyon dolar tutarında sahte para ile boş bir arazide ölü bulunmasını incelemektedir. Ayrıca, Adam Yakuza tarafından kaçırılır ve Gabriel'in adamlarından birine işkence yapmaya mecbur bırakılır.

Five-0, motosikletle çatıdan çatıya atlayarak kaçan bir katili bulmak için bir dublör bisikletçileri çetesinin üyelerini sorgulamak zorundadır. Ayrıca, ekip bir zorlu bir doğa sporları turnuvasına katılmaya hazırlanmaktadır.

McGarrett'in Lynn (Sarah Carter) ile ıssız bir adadaki ilk randevusu, orada saklanan bir mafya patronunun, yerini gizli tutmak için onları öldürmeye çalışmasıyla tehlikeli bir hal alır. Ayrıca Chin, Kono ve Grover, yerel bir futbol yıldızının babasını aramaktadır. Baba, oğlu oyunu kasıtlı olarak kaybetmezse yerel bir kumarbaz tarafından öldürülecektir. Ekibimiz, oyun süresince zamanla yarışır.

Çekici bir dolandırıcı olan Hank Weber’in (Kristoffer Polaha) kadın ortağı öldürülür ve Five-0 katili bulmak için onunla çalışmak zorunda kalır. Ayrıca, San Francisco Polis Müfettişi Abby Dunn Oahu'ya gelir ve Çinli beş silah tüccarının cinayet soruşturmasında Chin'le birlikte çalışır.

Bir üniveriste hocasının öldürülmesi üzerine Five-0, okul günlerine geri döner ve Danny de geçici öğretmen kılığında onun derslerine girer.

Gelecek vaat eden yerel boksör Luke Nakano’nun (Lewis Tan) kardeşi öldürülmüştür ve ana şüpheli, şampiyonluk için yarışacağı anakaralı boksör, Devon Haynes’tir (Harold House Moore).

McGarrett ve Danny, ortaklık sorunlarını çözebilmek için Maui'de bir çift inzivasına katılmıştır, bu sırada Kamekona'nın tehlikeli geçmişi tekrar karşısına çıkar.

McGarrett'ın Teyzesi Deb, özel bir kişisel görevle Oahu'yu ziyaret eder. Five-0 ise adadaki İkinci Dünya Savaşı’ndan kalma Japon bombalarını kimin çaldığını ortaya çıkarmaya çalışır.

Grover, Clay Maxwell'den eşini öldürdüğüne ilişkin bir itiraf almak için Chicago'ya gider. Chin ve Kono polis oldukları hakkında hiçbir fikri olmayan iki katil tarafından silah zoruyla alıkonulur.

Five-0’nun soruşturmakta olduğu ikili cinayette, sadakatsizlik söz konusudur. McGarrett ve ekibi birbirlerine talihsiz sevgililer günü deneyimlerini anlatır.

Danny'nin annesi FBI tarafından sorgulanırken, McGarrett, tek arkadaşının öldürülmesine ilişkin bilgi sahibi olması muhtemel otistik bir genç bir adamla işbirliği yapar.

Five-0'nun gizli muhbiri cinayetle suçlandığında, McGarrett eski arkadaşı Odell Martin'den onu savunmasını ister.

McGarrett ve Five-0, NSA’ya gizli bilgileri içeren bir flash belleği çalan bir Rus ajanının peşindedir. Bellekte, NSA’nın Ohana’daki bir mensubunun hayatını tehlikeye atacak bilgiler bulunmaktadır. Ayrıca, McGarrett nihayet Catherine'in onu neden terk ettiğini öğrenir ve Abby gerçek görevini Chin ve Five-0'dan gizlemeye devam eder.

Oahu kıyılarında bir adamın ölü bulunması, Five-0’nun yasadışı bir balıkçı gemisindeki ölümcül köle ticaretini açığa çıkarmasına yol açar. Ayrıca Danny çocuklarıyla birlikte dışarıdayken arabası çalınır ve hırsızları kovalamak için bir otobüse el koyar.

15 yıl önce meydana gelen bir davanın intikamını almak isteyen bir mafya patronu yüzünden Grover, ailesi ile birlikte saklanıp izlerini kaybettirmeye mecbur kalır.

Five-0, ABD ordusu için üretilmiş, yüksek teknolojiye sahip, yok edilemez bir giysinin çalınmasını soruştururken, Jerry de kız kardeşinin tutsak bir fili kurtarmaya çalışmasına yardımcı olmaktadır.

Kasıtlı bir kimyasal madde sızıntısının, Kono'nun kocası Adam (Ian Anthony Dale) da dahil olmak üzere altı tehlikeli mahkumun kaçmasına yol açması üzerine Five-0 devreye girer.

Five-0 kaçırılmış bir üniversite öğrencisini tehlikeli bir suçludan karşı korumalıdır. Ayrıca Max, Kamekona ve Flippa bir gemi kazası geçirir ve hayatta kalmaya çalışırlar.

Bir kadın kendi evinde öldürülmüştür ve Five-0 maktulün kızının içlerinden biriyle derin bir bağlantısı olduğunu öğrenir.

Oahu’daki Çin Mahallesi'ndeki harap bir binanın içine masur kalan Five-0, altıncı sezon finalinin ilk saatinde, yaralı Gabriel'i (Christopher Sean) korumalıdır ve silahlı saldırganlar Gabriel’i ve önlerine çıkan herkesi öldürmek amacıyla binayı kurşun yağmuruna tutarken bir kaçış planı yapmalıdır.

6. sezon finalinin ikinci saatinde McGarret ve Danny, adadaki bir uyuşturucu salgınına engel olmak için pilot kılığına girer, ama McGarret'ın ağır yaralanması üzerine Danny ortağının hayatını kurtarmak amacıyla kimliklerini açıklamak zorunda kalır.