בפתח העונה החמישית, השוטרים יוצאים לגלות מי חטף מזל"ט והשתמש בו לתקוף אזרחים, ומה היה המניע לכך.

בתו הצעירה של לוחם יחידת אריות הים באפגניסטן נחטפה, אבל צוות השוטרים מגלה שהחוטפים טעו בילדה שחטפו ומנהלים משא ומתן עם המשפחה הלא נכונה.

שלוש גולשות צעירות שודדות אוטובוס תיירים והורגות תייר. בנוסף, ג'רי חוקר מוכר ספרים עתיקים וחושד שהוא מזייף כספים ודני חושד שאחיו מוחזק בידי קרטל סמים בקולומביה.

צוות השוטרים מתמודד עם רוצח שכיר של המאפיה. דני מוצא את הכסף של אחיו אבל חסרים לו חמישה וחצי מיליון דולרים וחייו של אחיו תלויים על הכף.

מקגארט פוגש מכר ותיק של אביו ליד הקבר שלו, שמעודד אותו לחקור תיק ישן שאביו עבד עליו טרם מותו.

ליל כל הקדושים הגיע וצוות השוטרים צריך לאתר רוצח סדרתי שמחקה רציחות מתוך סרט אימה. בינתיים, מקגארט צריך לעזור לג'רי שנחטף על ידי הזייפן שאחריו עקב.

פאט חוטף את מקגארט כדי להשיג תשובות לגבי אביו. הוא מסמם את מקגארט במהלך החקירה, והדבר גורם לו להזות שאביו עדיין חי.

אדם שסיבך אנשים עם השקעות גרועות נרצח יחד עם אשתו, וילדיהם חשודים במעשה. בינתיים, דב, דודתו של מקגארט, חוזרת להוואי עם חדשות מפתיעות.

חג המולד הגיע והצוות מנסה לפתור תעלומת רצח של בוקר.

בעזרת חוקר משטרת הוואי לשעבר שהפך לחוקר פרטי, הצוות מנסה לפתור תעלומת רצח של אישה שעבדה בחברת ריקודי הולה שהיא למעשה חברת שירותי ליווי.

רצח מפתיע של תייר תמים שולח את אנשי "5-0" למרדף אחרי שודד של יצירות אמנות חשובות ויקרות.

רצח של רופאה בכירה בבית החולים גורם לאנשי 5-0 לחשוף תקרית רצח מזעזעת שהתרחשה בעבר הרחוק.

אמריקני שחלה בנגיף מדבק במיוחד מגיע להוואי בפיקוחו של ג'ו. הוא נחטף וב-"הוואי 5-0" חושדים שארגון טרור רוצה להפוך את הנגיף לנשק יום הדין.

פושע ששוחרר מהכלא מנסה לפרוץ אליו חזרה. אנשי "הוואי 5-0" חושפים מבצע רחב היקף לעצור אדם מסתורי החשוד בפשעים בקנה מידה בין לאומי.

כאשר עיתונאי נהרג, 5-0 חייבים לצוד איש צבא קונגוליאזי. עם יום האהבה הקרב, דני מגיב בהגזמה לאחר שהודעות שגרייס שולחת לילד מגיעים בטעות לטלפון הנייד שלו.

מצית סדרתי מגיע לאי ומשאיר אחריו גחלים וקורבנות. סוד מעברה של אמבר, חברתו של דני, מאיים על הקשר ביניהם.

שוד יהלומים שהסתיים במותו של שוטר לשעבר שולח את סטיב ואת דני למעקב בדירה של אישה שיצאה לחופשה.

דני נעצר על ידי הסי-איי-איי בגין רצח סוחר סמים קולומביאני שרצח את אחיו. צ'ין נעצר על ידי קופלין בגין עזרה ושיתוף פעולה. סטיב וג'ו יוצאים למשימה לשחרר את דני ואת צ'ין.

סטיב פוגש במספרה המקומית צעיר שנורה ברגלו ומבקש מחסה.

במהלך טיול בטבע, אשת חברו הטוב של המפקד לו נופלת מצוק ונהרגת. לו פוצח בחקירת רצח כיוון שתחושת הבטן שלו מאותתת לו שאין מדובר בתאונה.

במהלך מופע מחווה לאלביס, הזמר הראשי מתמוטט ומת על הבמה. לאחר שהרוצח נמצא ומתוודה, מתברר שלחליפתו של הזמר יש ערך נוסף והגופה נגנבת.

קונו יוצאת למסע סביב האי בסירה שאמה בנתה. בעקבות סופה חזקה, סירתה של קונו מתהפכת והיא נותרת לשוט בלב ים על גלשן בלבד. בשל פריצות לבתי מרקחת צ'ין וסטיב מגלים סוחר סמים חדש.

סטיב ודני מוצאים שוטר פצוע וגופה של נהג בצד הכביש. הדבר מוביל לחיפוש אחר אסיר נמלט שרצח שלוש צעירות בארה"ב ולהיתקלות עם כמה ציידי ראשים שמחפשים אותו גם הם.

בפרק האחרון לעונה, מטוס ננטש בנמל תעופה קרבי ועליו סימנים של קרינה גרעינית. הצוות מגלה שאדם בארה"ב תקף שיירה צבאית, גנב פצצה גרעינית והטיס אותה לאיי הוואי כדי להפעיל אותה.