Önceki sezon finalinde, McGarrett'in annesinin beklenmedik dönüşü ve Chin'in verdiği zor kararın ardından ekip, ailenin önemli bir üyesini öldüren Wo Fat'in izini bulmaya kararlıdır.

McGarrett Catherine'den annesinin yerini bulmasına yardım etmesini ister ve ekip, bir sanat soygununun cinayetle bitmesinin ardından, August March’tan yardım ister.

McGarrett ve Danny, denizde dinlendirici bir gün geçirmektedir. Ancak teknelerinin kaçırılması ve okyanusun ortasında ölüme terk edilmeleri üzerine ölüm tehlikesi yaşarlar.

Ekip, kelimenin tam anlamıyla kafasını kaybeden bir polo oyuncusunun ölümünü soruştururken, Doris McGarrett oğluna beklenmedik bir ziyarette bulunur.

Hawaii'de Cadılar Bayramı zamanıdır. Ekibimiz, işlenen korkunç bir cinayetin bir öldürme ayini ile bağını fark eder ve kanıtlar katilin yakın zamanda tekrar saldırabileceğini göstermektedir. Zamanları giderek azalmaktadır.

Ekibimiz genç bir bilgisayar korsanının cinayetini araştırırken, McGarrett da uzun süredir birbiriyle görüşmeyen annesiyle kız kardeşini bir araya getirmek için bir plan yapar.

McGarrett, bir hastasını öldürdüğünü düşündüğü çekici ve zeki bir terapistle kedi fare oyunu oynamaktadır. Bu arada Catherine, Doris'in intikam almak isteyen eski hedeflerinden birini bulmak zorundadır.

Kötü giden bir banka soygunu sırasında, Max ve kız arkadaşının hayatı tehlikeye girer. Ekibimiz, suçluların beklenmedik bir sebebi olduğunu öğrenir.

Grace'in Aloha Girls kamp gezisi, silahlı bir adamın McGarrett'ı ve küçük bir kız çocuğunu rehin almasıyla tehlikeli bir hale gelir. Bu arada Adam, hapishaneden yeni serbest bırakılan tehlikeli erkek kardeşini Kono ile tanıştırır.

Birileri aptalca bir şekilde McGarrett'ın arabasını kaçırmaya çalıştıktan sonra O ve Catherine, küçük bir çocukla tanışırlar. Çocuğun babası kaybolmuştur ve Oahu'nun ormanlık bölgesinde ölüm tehlikesi içinde olması muhtemeldir.

Ekibimiz bir O'ahu Eyalet Üniversitesi profesörünün ölümünü soruşturmaktadır. Profsörün patronu, asistanı ve kopya çekerken yakaladığı bir öğrenci olası şüphelilerdir.

Chin bir gece kaçırılır ve mahkum kıyafetleri giydirilerek Halawa Cezaevinin ortasına bırakılır. Diğer mahkumlar onun Five-0’dan olduğunu fark etmeden önce hayatını kurtarmak için oradan kaçmalıdır.

Vali kayıp bir Kongre üyesinin yatağında bulunan bir fahişe cinayetini gizlice incelemeleri için , seçimlerin arefesinde, Five-0’ya ricada bulunur.

Gizemli bir adam seçtiği polisleri intikam için öldürmeye başlar ve infaz listesindeki sonraki isim McGarrett’dır. Five-0, olayı soruşturmaya başlar.

Five-0, bir Lua (eski bir Hawaii dövüş sporu) ustasının cinayetini araştırır ve McGarrett annesini takip etmesi için bir özel bir dedektif tutar.

Hawaii'de bir yıldızlar takımı futbol hafta sonudur ve Danny bu büyük oyuna odaklanmış haldeyken Five-0, bir futbol oyuncusu yardımıyla bir teknoloji yöneticisinin öldürülmesini araştırmaktadır.

Bir cinayet kurbanı, Ödül Avcısı Dog’un kamyonetine düşer. Five-0, suçluyu bulmak için Catherine'i gizlice yerel paten turnuvasına gönderir.

Yerel köpekbalığı nüfusunu tehlikeye atan bir tur şirketine yapılan tehditler ölümcül bir hale gelmiştir ve Five-0, şüpheli listesini daraltmak gibi zor bir görevle karşı karşıyadır.

McGarrett ve Catherine hayatını kaybeden bir dostlarından geriye kalanları almak üzere Kuzey Kore'ye giderler. McGarrett gezi boyunca oradaki son ölümcül görevini hatırlar.

Five-0, bir talk-show sunucusu ve ekibinin gün boyunca kendilerini takip etmesine izin verir, ancak Wo Fat ile karşılaştıklarında soruşturma tehlikeli bir hale gelir.

10 yıl önce kaçırılan genç bir kızın cesedi bulunur ve Five-0, şimdi yeni bir kurbanı daha kaçırmış olan suçluları yakalamalıdır.

McGarrett, annesinin çalınan bir mikrofişi geri almak için yürüteceği gizli bir operasyona yardım etmelidir. Bu arada Kono, Adam’ın sırlarını keşfetmeye yaklaşırken hayatı tehlikeye girer.

CIA, Five-0’ya adada bulunan tehlikeli bir katili yakalama görevi vermiştir. Bu sırada Kono, işlemediği bir cinayet yüzünden firar eder. McGarrett’ın Wo Fat’in bulunduğu cezaevine yaptığı ziyaret, üçüncü sezon finalinin şok edici bir keşifle sona ermesine yol açar.