Tras iniciarse un incendio a bordo del avión, Sean trata de evacuar a los pasajeros. Michael es el último en salir, caminando como si estuviera en trance.

Cuatro días antes, en una bodega, un hombre de aspecto amenazante tiene a Michael retenido y le exige que estrelle un avión contra el complejo presidencial. Cuando el piloto se resiste, su secuestrador amenaza con matar a su hija Leila; tal y como él sus colegas asesinaron a Val, la esposa de Michael. Éste se da cuenta del alcance de su problema y de que tiene que hacer lo necesario para salvar la vida de su hija.

De regreso en el desierto, Sean le pregunta a Michael qué sucedió; y Michael le explica que, tras ser testigo del asesinato de su esposa, fue obligado a participar en un complot para asesinar al Presidente Martínez o se arriesgaba a perder a Leila.

Was hat eine mysteriöse Gruppe von 97 Häftlingen, die auf einer geheimen Militärbasis in Alaska eingesperrt sind, mit Leilas Verschwinden zu tun? Auch Seans undurchsichtiger Schwiegervater in spe, Michael Buchanan, scheint nicht das zu sein, was er vorgibt.

Martinez elnök azonnal munkát ad az alkalmazottainak, hogy reagálni tudjon a hirtelen eltűnt gép ügyéről. Kiderül, hogy a Nemzeti Hírszerzés által fogva tartottak nem földi lények, ezért tartják őket bezárva. Közben egy sötét alak jelenik meg, aki nem más, mint Thomas. Ő mindent tud az összeesküvés-elméletről és azt is tudja, hogy hol vannak az utasok, valamint a gép...

L'avion de Michael Buchanan a finalement atterri dans le désert d'Arizona. Sauf, Sean Walker apprend que son beau-père a été contraint de le piloter sous peine de voir sa famille massacrée. Le jeune homme prend alors la fuite pour retrouver Leila mais perd connaissance en chemin. Il se réveille quelques heures plus tard à l'hôpital de Yuma, avant d'être appréhendé par le FBI. Hélas, personne ne veut croire à son histoire d'enlèvement et de crash. A Washington, Blake Sterling demande à l'agent de FBI Simon Lee de retrouver l'avion, sans savoir qu'il fait partie des extraterrestres de Mount Inostranka...

Nakon pokušaja atentata na predsjednika, osoblje Bijele kuće procjenjuje što je pošlo po zlu u osiguranju. Blake Sterling optuži Sophiju za sudjelovanje u atentatu i ispituje je u pritvoru. Zavjera se širi, a agenti FBI-a, Collier i Carter, postaju plaćenici sa sumnjivim vezama. U međuvremenu, tajanstveni Thomas dozna gdje se nalaze zatočeni izvanzemaljci i koji im je plan.

Samolot z pasażerami, który w tajemniczych okolicznościach zniknął tuż przed zamachem na prezydenta, pojawia się na pustyni w Arizonie. Pilot Michael Buchanan, ojciec porwanej dziewczyny Seana, na widok nadjeżdżających pojazdów rządowych, nakłania chłopaka do ucieczki. Seanowi udaje się dotrzeć do szpitala, skąd próbują go przejąć pod zarzutem morderstwa agenci FBI. Tymczasem prezydent Martinez zdaje sobie sprawę, że Sophia go okłamała, nie wspominając o pozostałych obcych, którym 60 lat wcześniej udało się uciec. Blake Szef wywiadu Blake Sterling nakazuje swojemu najlepszemu agentowi wykrycie wszystkich "uśpionych". Nie wie, że Simon jest jednym z nich.

Оправившись от ударной волны, команда президента пытается разработать план дальнейших действий. Блейк Стерлинг арестует Софию для допроса. Тем временем на сцене появляется новая фигура – загадочный Томас, которому известны намерения задержанных…

The president's staff grapples with a new reality; the conspiracy engulfs an FBI agent and a mercenary with questionable ties; a shadowy figure emerges with knowledge of the detainees.