Alors que Danny et Baez se lancent sur la piste d'un potentiel tueur en série, Frank devient la cible d'accusations de corruption, et Erin hésite à se porter candidate à un poste de juge. De son côté, Eddie doit affronter les fantômes de son passé lorsque son père, qu'elle n'a pas vu depuis des années, se retrouve à l'hôpital.

Danny et Baez poursuivent un tueur en série qui envoie un message effrayant à Danny. Pendant ce temps, Erin se voit proposer un poste de juge. De son côté, Frank est accusé par une candidate à la mairie d'enquêter secrètement sur son mari et Eddie apprend que son père est à l'hôpital.

Quand le journaliste de presse Lorenzo Colt est visé en suivant Jamie et Eddie pendant leur patrouille, Frank met Danny et Baez à la recherche du tireur qui peut être dehors, à la recherche d'autres cibles. Pendant ce temps, Garrett envisage de prendre un autre travail.

Erin enquête sur un chef de la mafia et compte bien le faire tomber. Mais son entreprise est compromise lorsque Vincent Rella, un de ses anciens informateurs, décide de quitter le programme de protection des témoins pour fournir un alibi au chef de la pègre. Frank, de son côté, se retrouve au centre d'une guerre des services, en conflit avec le chef des pompiers de New York.

Danny se lance à la poursuite de deux évadées quand il apprend qu'il a mis sous les verrous l'une des deux par erreur, quelques années auparavant. Pendant ce temps, Gormley critique le plan de Trey Delgado, un sergent du NYPD qu'il soupçonne d'être l'amant de son épouse...

Jamie fait l'objet d'une enquête des affaires internes. En effet, il semble compromis dans une affaire de brutalité à l'égard d'un manifestant. La situation se complique lorsque l'affaire recoupe celle de Danny et Baez : un cas de viol impliquant un des avocats de la défense…

La dernière Mustang conduite par Steve McQueen dans le film "Bullitt" a été dérobée ; Danny et Maria sont désignés pour enquêter sur ce vol. Pendant ce temps, l'affaire sur laquelle travaille Erin l'oppose à son père : elle prend le parti de son patron lorsque des policiers semblent impliqués dans un trafic de faux billets…

Thomas Wilder, un tueur en série qui a échappé à Danny, menace ce dernier ainsi que sa famille. Cette situation amplifie l'inquiétude et les doutes de Linda quant au travail de son mari et surtout leur mariage. De son côté, Jamie défie son supérieur hiérarchique, le sergent William Mulvey, pendant une prise d'otages…

Danny est interrogé par le bureau du procureur car son ancien partenaire est suspecté d'avoir manipulé des preuves dans le but de clore une affaire d'homicide. Frank, lui, est confronté à un groupe d'activistes anti-gouvernement qui, pour se faire entendre, menace de brûler le drapeau national. Pris en étau entre devoir et liberté d'expression, il cherche la façon la plus appropriée pour négocier avec eux…

Frank apprend que son premier coéquipier est sur le point de publier un livre racontant leurs débuts dans la police. Très vite, il s'inquiète des révélations qui pourraient y être faites, tant professionnelles que personnelles… Jamie et Eddie répondent à l'appel d'un de leurs collègues qui réclame assistance : sur place, des choix doivent être faits et ils ne seront pas sans conséquence pour eux…

Un malfrat local est assassiné dans sa voiture. Danny et Baez enquêtent pour obtenir des réponses rapidement avant qu´une guerre des gangs ne se déclenche. De son côté, Frank est embarrassé : un jeune officier du NYPD demande, pour honorer la mémoire de son père, un numéro de badge bien particulier. Or, il s´agit aussi de celui de Joe, le défunt fils de Frank…

Un lieutenant du NYPD, fraichement retraité, est suspecté d'avoir tiré sur des voleurs dans le métro et prend la fuite. Frank doit faire face aux retombées de cette affaire ! Par ailleurs, Baez se met en tête d'arrêter un trafiquant de drogue pour un meurtre qu'il a commis quand elle n'était qu'une enfant et dont elle fut alors témoin…

Le patron d'une maison de passes est retrouvé mort et quatre de ses employées avouent en être l'auteur. Danny, en charge de l´enquête, doit rétablir la vérité et identifier la coupable. Frank, lui, est en désaccord avec son prêtre au sujet d'un jeune garçon pris en flagrant délit de vol au sein même de l'église… Pendant ce temps, Nicky et ses amies sont aux arrêts : la police a trouvé de la drogue dans leur voiture.

Erin est accablée par la culpabilité et le ressentiment de ses collègues : elle a libéré un homme qui aurait ensuite abattu un policier de la ville de New York. Danny et Baez enquêtent sur la disparition suspecte d´un policier : à la vue des premiers éléments de l´enquête, Danny a un a priori négatif sur le policier disparu, Baez en revanche lui est plus favorable…

Linda se tourne vers Danny et Baez et sollicite leur aide : un de ses collègues connait des difficultés avec son ex pour le moins furieuse. Erin est embarrassée car elle souhaite venir en aide à son ancien mentor, condamné de façon injuste selon elle. Frank, de son côté, s'oppose à la nouvelle porte-parole de la mairie qui dénonce certains agissements de la police…

Jamie et Danny sont en désaccord sur l´attitude à adopter face à Marcus, une nouvelle recrue téméraire. Or, Marcus est aussi le fils d'un ami de Danny… Au bureau du procureur, Anthony, l'enquêteur d'Erin, connaît des revers financiers à cause de mauvais placements réalisés par son cousin. Erin lui propose son aide et décide de clarifier la situation…

Frank et Danny travaillent conjointement pout aider Nick Constantine, un ancien détenu désormais réhabilité. Mais les choses se corsent lorsque Nick se retrouve impliqué dans le meurtre de l'un de ses anciens ennemis. Erin, quant à elle, prépare son dossier dans un procès pour meurtre. Elle découvre que l'ancien procureur en charge de l'affaire ne veut pas dévoiler la planque du tueur présumé…

Danny et Baez sont sur les traces d'un gang de voleurs qualifiés et dangereux. Ils acceptent de collaborer avec Jimmy Mosley, un détective qui brisa le coeur de Baez bien des années auparavant… Frank, de son côté, s'interroge : doit-il décorer ce policier qui a été acquitté dans une affaire de meurtre sur un jeune garçon au risque de provoquer la colère publique ?

La police de New York recherche activement Thomas Wilder, un tueur en série. Sur le corps de sa dernière victime, celui-ci laisse un message dans lequel il nargue Danny. Le jeu du chat et de la souris auquel se livraient Wilder et les forces de l'ordre prend soudain un aspect très personnel pour Danny !

Erin et Anthony se démènent pour mettre la main sur leur témoin clé dans l'affaire de meurtre en cours. En effet, celui-ci a pris la fuite, refusant de témoigner par peur d'éventuelles représailles. Pendant ce temps, Garett tente de convaincre Frank d'assister au gala de l'Union de la Police tandis que Danny et Baez s'intéressent à une étrange affaire de cambriolage dans un magasin de dépannage…

Un policier est accusé d'avoir tiré sur un mineur dans des circonstances controversées. Bien que la scène ait été filmée par un passant, le jury ne parvient pas à prouver la culpabilité de l'agent. Frank, le maire Poole ainsi qu'Erin et le bureau du procureur doivent alors faire face à l'indignation qui gagne la population de New York…