Admiral Nelson und Captain Crane erhalten den Auftrag, einen Vulkanausbruch zu verhindern. Der Geologe Dr. Turner soll die beiden unterstützen. Doch der Wissenschaftler hat eigene Pläne und versucht, die Mission zu sabotieren.

Der Puppenspieler Multiple versetzt die Besatzung der Seaview in Tiefschlaf und ersetzt sie durch seine Puppen. Er nimmt Captain Crabe sowie Admiral Nelson gefangen und entführt die Seaview. Das Schiff soll einem außerirdischen Maschinenwesen als neuer Körper dienen.

"Diejenigen, die den Fliegenden Holländer sehen, erreichen niemals das Ufer." Als Nelson den Verlust von Marineschiffen untersucht, findet er in einer Höhle auf einer unbekannten Insel einen uralten Dolch und wird von einem seltsamen Fluch heimgesucht. Er wird von Visionen von Skeletten und einem anachronistischen Schiff heimgesucht und hat Mühe, die Besatzung von seinem Verstand zu überzeugen. In der Zwischenzeit fährt die Seaview im Kreis, und der zu Besuch weilende Commander Van Wyck scheint verschwunden zu sein.

Eine Raumkapsel mit Commander Morton an Bord verschwindet spurlos im All. Crane will mit einer zweiten Kapsel zu einer Rettungsmission starten. Doch auch die zweite Raumkapsel verschwindet, noch während des Countdowns. Morton und Crane finden sich auf der Venus wieder.

Nelson soll eine Neutronenbombe mit der Seaview zu einem Versuchsgelände transportieren. Schon bald nach dem Start entdeckt Chief Sharkey ein Strahlungsleck an der Bombe. Die Seaview gerät in höchste Gefahr.

Der Wissenschaftler Mason will mit seiner neuen Erfindung riesige Mengen Strom erzeugen. Doch Admiral Nelson hält das Projekt für gefährlich. Um Nelson kalt zu stellen, fasst Mason einen perfiden Plan. Er lässt einen Doppelgänger Nelsons einen Mord begehen.

Der Wissenschaftler Dr. Blanchard hat ein Gerät entwickelt, mit dem man das Verhalten eines Riesen-Gorillas steuern kann. Er will seinem Freund Admiral Nelson die bahnbrechende Erfindung demonstrieren. Doch der Gorilla wird urplötzlich aggressiv und bricht aus.

Admiral Nelson wird von zwei Androiden durch eine Zeitschleuse in die Zukunft entführt. Dort gerät er in die Gefangenschaft des Sammlers Alpha. Er will Nelson in seine Soldatensammlung einreihen, in der sich bereits Alexander der Große und Napoleon befinden.

Die Seaview hat den Auftrag, eine feindliche U-Boot-Basis aufzuspüren und zu zerstören. Als Nelson den Angriff befiehlt, kommt es zu rätselhaften Fehlzündungen der Torpedos. Offenbar befindet sich ein Saboteur an Bord.

Die Seaview fängt einen Notruf von Dr. Thompson auf, der auf einer Insel mit Pflanzen experimentiert. Doch Admiral Nelson kommt zu spät, Thompson stirbt. Ahnungslos nimmt der Admiral eine von Thompsons Orchideen mit an Bord. Die Pflanze entpuppt sich als Alien.

Dem Erfinder Mr. Pem gelingt es, mit Hilfe eines Energieverstärkers die Zeit beliebig zu manipulieren. Er schickt die Seaview eine Million Jahre in die Vergangenheit. Admiral Nelson versucht den skrupellosen Pem zu überlisten, um die Seaview zu retten.

Admiral Nelson leidet unter Wahnvorstellungen. Diese werden durch ein neuartiges Atemgerät hervorgerufen. Schnell wird er zur Bedrohung für die eigenen Leute.

Die Seaview wird von Amphibienwesen angegriffen. Diese wollen mit Hilfe Nelsons die Weltherrschaft erlangen. Doch Nelson und Crane gelingt es, die Anführer der Amphibien zu vernichten.

Durch das Einwirken geheimnisvoller Kräfte materialisiert sich an Bord der Seaview ein Pirat aus dem 18. Jahrhundert. Doch dieser hat nichts Gutes im Sinn.

Auf der Seaview passiert mal wieder Unglaubliches: Zwei Kobold-Geschwister versuchen, die Mannschaft von der Durchführung eines wichtigen Auftrags abzuhalten.

Die Seaview birgt ein UFO. Diesem entsteigt ein krebsähnlicher Außerirdischer, der behauptet, in friedlicher Mission gekommen zu sein. Doch das fremde Wesen hat einen teuflischen Plan: Mit dem Reaktor der Seaview will er eine Superbombe bauen.

Ein Außerirdischer schleicht sich an Bord der Seaview ein. Er will an Captain Crane einen Versuch durchführen, um zu erfahren, ob die Erdbewohner einer Invasion widerstehen würden. Als Crane an Bord zurückkehrt, wird er von grauenhaften Halluzinationen geplagt.

Die Seaview ist auf der Suche nach einer vermissten Polar-Expedition. Schließlich findet sie die beiden bewusstlosen Überlebenden, Professor Paulsen und seinen Assistenten, und nimmt sie an Bord. Bald darauf beginnt auf der Seaview eine mysteriöse Mordserie.

Eine Gruppe skrupelloser Wissenschaftler erpresst die Vereinigten Staaten. Nelson erhält den Auftrag, die Verbrecher mit der Seaview aufzuspüren und unschädlich zu machen. Der Geheimdienst stellt ihm Agent Hendrix zur Seite. Aber Hendrix ist der Kopf der Erpresserorganisation.

Der Wissenschaftler Braddock hat eine künstliche Atmosphäre für extrem tiefe Tauchgänge entwickelt. Captain Crane soll einen ersten Test wagen. Nach dem Tauchgang kehrt er anscheinend gesund zurück. Doch kurz darauf verwandelt er sich in eine rasende Bestie.

Italien droht von tropischen Gewächsen überwuchert zu werden. Admiral Nelson soll versuchen, die Pflanzen zu stoppen. Unterdessen schleicht sich ein Alien an Bord der Seaview. Mit Hilfe der Raketen des Schiffs will es die Pflanzen über die ganze Erde zu verteilen.

Die Erde wird von Überschwemmungen heimgesucht. Wissenschaftler vermuten, dass ein Hitzeherd das Eis der Arktis zum Schmelzen bringt. Admiral Nelson soll mit der Seaview der Sache auf den Grund gehen. In der Arktis trifft er auf außerirdische Eismenschen.

Die Seaview bringt ein neuartiges Waffensystem nach Pearl Harbor. Da erfährt Admiral Nelson, dass sich ein Spion an Bord befinden soll. Offenbar handelt es sich um Captain Crane höchstpersönlich. Nelson versucht, Crane zu überführen.

Der wahnsinnige Wissenschaftler Mallory versetzt Captain Crane mit Hilfe einer Zeitschleuse in die Zukunft. Dort hat ein Doppelgänger soeben Admiral Nelson erschossen. Nun wird Crane von der gesamten Besatzung gejagt.

Die Seaview wird durch eine Explosion zerstört. Der zwielichtige Mr. Pem soll mit einer Zeitmaschine die Seaview retten. Doch insgeheim hat Pem einen anderen Plan: Er will im amerikanischen Unabhängigkeitskrieg mit der Seaview den Königstreuen zum Sieg verhelfen.