Altıncı sezonun ilk bölümünde Aria, Emily, Hanna, Spencer ve Mona işkencecileri Charles'ın "bebek evinin" dışında, kaçabilecekleri bir yer olmadan kapana kısılır.

Aria, Emily, Hanna ve Spencer bebek evinden kurtulur ama orada tutsakken yaşadıkları, hayatlarında uzun süre etkili olacaktır. Alison ise geçmişte düşünmeden hareket ettiği olayların üstesinden gelmek zorundadır.

Kızlar, hayatlarını yeniden düzene sokmaya çalışır. Spencer, Ali ve Jason'dan (DREW VAN ACKER) Charles hakkında bilgi almaya çalışır. Emily de yeni bir dostla yakınlaşmayı dener.

Alison ve Jason'a (DREW VAN ACKER) Charles hakkında yalan söyledikten sonra Kenneth Dilaurentis (JIM ABELE) ailenin çocukla olan ilişkisi hakkındaki gerçeği açıklar. Her yolun sonu Radley'ye çıkmaktadır.

Mona hassas bir durumdayken Rosewood'a döner ve polise, kendini neden ölü olarak gösterdiğini açıklamak zorunda kalır. Mona, Lesli'nin (ELIZABETH McLAUGHLIN) olayla ilişkisi hakkında sorgulandığında, her şey daha da kötü bir hal alır.

Kızlar, Lesli'nin (ELIZABETH McLAUGHLIN) "A" olduğuna dair kanıt arar fakat araştırmalarında ilerledikçe önlerine çıkan tehditler artar. Emily şaşırtıcı bir teklif alır.

Charles doğum günü için eve döneceğini söyler. Spencer ve Hanna, Charles'ı yakalamak için ellerine fırsat geçtiğini düşünürken Emily ve Aria ise olabildiğince uzak kalmak ister.

Mezuniyet balosuna katılmaları "güvenlik endişesi" nedeniyle yasaklanan Alison, Aria, Emily, Hanna ve Spencer bu durumun keyiflerini kaçırmasına izin vermez ve Spencer'ın ambarında kendi mezuniyet balolarını düzenler.

Eziyet dolu yıllardan sonra Alison, Aria, Emily, Hanna ve Spencer nihayet işkencecileriyle yüz yüze gelir ve Charles'ın "A"ya nasıl ve neden dönüştüğünü öğrenir.

"A" gizeminin çözülmesinden beş yıl sonra, kızlar Rosewood'a geri döner. Her şeyin başladığı yere dönmelerini gerektiren olayla nasıl başa çıkacaklar?

Kızlar Rosewood'da kalırken yeni bir gizem hakkındaki sorular yüzeye çıkar. Huzursuz olan Aria şüpheli görünmeye başlar ve Emily Kaliforniya'daki hayatı hakkında yalan söylemeye devam eder.

Annesinin işini kaybetmesi söz konusu olduğunda Hanna, liseden eski arkadaşı Lucas'ın (BRENDAN ROBINSON) da yardımı ile dördünü de kurtaracak bir gerekçe bulmaya çalışır. Emily gerçeği söyler.

Hanna gerçeği itiraf eder. Aria ve Emily, Ezra hakkında cevaplar arar. Spencer ve Caleb yeni bir tehdidin izine düşer. Bu sırada yeni aşklar ufukta görünürken eskileri yeniden ortaya çıkar.

Yeni tehditlerin arkasındaki kişinin Sara Harvey (DRE DAVIS) olduğuna inanan kızlar cevap bulmak için işbirliği yapar. Caleb ve Hanna yeni takipçi sapıkla mücadele etmek için bir plan yapar.

Kızların kişisel hayatları hakkındaki gerçekler su yüzüne çıkarken, sakladıkları sırlar ortaya çıkmaya başlar. Mona aslında kimin tarafında olduğunu gösterir. Ayrıca Emily ve Hanna şok edici tehditler alır.

Kızlar cinayet vakasındaki yeni bir şüpheliyi soruşturmaktadır. Ezra'nın Rosewood'a dönmesiyle Aria, Ezra'nın kitabı ile ilgili olan bağlantısını ona açıklamak zorunda kalır. Bu sırada düğün yaklaşmaktadır.

Artık tehditleri daha ciddiye almaya başlayan kızlar, daha fazla zararı önlemek için sessiz olmaya çalışır. Caleb yıkım ile ilgilenir. Emily, peşine düşen kişinin kim olduğunu bulmaya çalışır.

Sürekli maruz kaldıkları taciz yüzünden öfkeden çılgına dönen kızlar intikam planı yapar. Emily ve Spencer Mona'nın konu ile bağlantısını incelerken Hanna ve Caleb bir plan hazırlamak için birlikte çalışır.

With the stalker threatening to kill all of them if they don’t divulge Charlotte’s killer by the election, the PLLs and company, at wit’s end, must boldly fight back. As Spencer and Toby work together to catch Sara Harvey, Yvonne wonders where Toby’s true affections lie. Ezra finishes the last chapter of his book, finally ready to say goodbye to Nicole; Aria comforts him during this emotional time and old feelings bubble to the surface. While Caleb works intently on his plan to protect Hanna, they reflect on what could have been.

Meanwhile, Alison experiences strange visions and starts to question her sanity; Emily keeps tabs on her to make sure she’s okay.