Trong khi dọn dẹp những gì còn sót lại của Học viện Ninja, Iruka tìm thấy một cây cột cũ và nhận ra đó là cuốn hồi ký từ những năm đầu còn là học sinh của Naruto.

Ngày này qua ngày khác, Naruto cạnh tranh với Sasuke, học sinh xuất sắc của học viện, nhưng chỉ chuốc lấy thất bại và trở thành trò cười cho cả lớp.

Bạn cùng lớp của Naruto nói với cậu rằng một trận chiến đã nổ ra trong rừng Lá và thách cậu lấy một món đồ từ kẻ địch ninja đã chết.

Tại hội đồng khẩn cấp được tổ chức để thảo luận về kế hoạch tái thiết Làng Lá, Danzo hăng hái thúc giục hội đồng chọn một Hokage mới thay thế Tsunade.

Ninja Làng Lá bắt tay vào xây dựng lại Làng Lá. Trong khi hỗ trợ công việc tái thiết, Naruto và Sakura tái ngộ hai người bạn cũ.

Khi Naruto và Sakura kỷ niệm cuộc hội ngộ với Inari và Tazuna, họ nhớ lại một sự cố xảy ra sau nhiệm vụ của họ ở Sóng Quốc.

Tin tức về sự hủy diệt của Làng Lá lan tới Làng Cát. Kankuro và Temari lo lắng về tình trạng của quốc gia đồng minh.

Naruto đến thăm Sakura khi cô đang chăm sóc cho Tsunade. Sakura nhớ lại khoảng thời gian cô gặp các triệu chứng tương tự như căn bệnh do một loại vi-rút bí ẩn gây ra.

Tenten và Neji đến Phòng thí nghiệm Nghiên cứu Công cụ Ninja Làng Lá để lấy dụng cụ xây dựng lại Làng Lá và nhớ lại chuyến thăm lần trước của họ.

Condor tự rèn luyện để trở thành một ninja đà điểu có thể nói tiếng người. Condor kể cho những chú đà điểu con trong rừng về những lần chạm trán Naruto.

Naruto biết rằng một thành phần quan trọng trong thức uống thanh xuân của Lee đã hết và lên kế hoạch lấy thêm trong nhiệm vụ tiếp theo của họ.

Để đưa Sasuke trở lại và học cách tự vệ trước Akatsuki, Naruto bắt đầu hành trình tập luyện dưới sự hướng dẫn của Jiraiya.

Naruto và Jiraiya cố gắng cứu một ngôi làng khỏi Kandachi, cánh tay phải trước đây của Hanzo. Kandachi tức giận triệu hồi Vua Xà cừ.

Bà Mèo yêu cầu Sasuke và Đội 7 thu thập bản in chân mèo cuối cùng cho Bách khoa toàn thư Chân mèo. Cả đội lên đường mà không có Kakashi.

Naruto được phân công tuần tra biên giới phía bắc của Làng Lá. Một đồng đội của cậu là Kosuke, người đã là genin hơn 50 năm.

Bộ phận Tình báo Làng Lá thẩm vấn một nữ ninja điệp viên xinh đẹp tên là Hanare. Trong khi đó, Inoichi phát hiện ra một hình ảnh bất ngờ khi quét tâm trí Hanare.

Trong Kỳ thi Chunin, Neji nghỉ trong phòng y tế. Khi Tenten đến xem tình hình của cậu, họ chứng kiến Làng Lá bị người của Orochimaru tấn công.

Bắt gặp một tảng đá dán một lá bùa kì dị, Naruto bóc ra không đắn đo. Đêm đó, cậu nhìn thấy một con ma mất trí nhớ đứng bên cạnh giường.

Đội 7 và Đội 10 được giao nhiệm vụ giúp đỡ một ngôi làng có kẻ cướp hoành hành. Kakashi và Asuma tìm kiếm một lối đi an toàn để đột nhập nơi ẩn náu của bọn cướp.

Xích mích nảy sinh khi Sasuke đố kị với sức mạnh gia tăng của Naruto. Tsunade quyết định tách hai người ra và giao cho họ những nhiệm vụ riêng biệt.