Trở lại Konoha, khi Kakashi nghỉ ngơi trong bệnh viện, Naruto tìm kiếm một thành viên khác trong đội trước khi họ gặp gián điệp của Sasori.

Naruto ngán ngẩm khi Sai – chàng trai tấn công cậu – được chỉ định vào Đội Kakashi và một thành viên ANBU tên là Yamato đảm nhận vai trò thủ lĩnh.

Jiraiya tóm tắt sơ lược cho Yamato về Cửu Vĩ Hồ bị phong ấn trong người Naruto. Sau khởi đầu trắc trở, Đội Kakashi mới bắt đầu thực hiện nhiệm vụ đầu tiên.

Bất chấp nỗ lực của Yamato nhằm giảm bớt căng thẳng và vun đắp tinh thần đồng đội trong nhóm, Naruto vẫn tiếp tục khinh thường Sai.

Sai hé lộ một khía cạnh dịu dàng. Cả đội lập kế hoạch bắt giữ gián điệp của Sasori.

Yamato tạo ra một bài kiểm tra thử để đánh giá mức độ phối hợp và làm việc cùng nhau của cả đội. Sai tiết lộ một số thông tin bất ngờ về bản thân.

Yamato cải trang thành Sasori và gặp tay gián điệp trên cầu Tenchi. Cả đội ngạc nhiên khi phát hiện ra danh tính thực sự của tay gián điệp.

Nổi giận khi bị Orochimaru trêu tức, Naruto giải phóng chiếc đuôi thứ ba của Cửu Vĩ Hồ trong trận đấu.

Ở hình dạng bốn đuôi, Naruto tỏ ra là một đối thủ đáng gờm đối với Orochimaru. Trong khi đó, Kabuto suy luận rằng Sasori đã chết.

Sau khi Naruto mất kiểm soát và tấn công Sakura, Yamoto buộc phải trói Naruto lại trước khi cậu gây hại thêm. Sai đối đầu với Orochimaru.

Sau khi cử bản sao gỗ đi theo Sai, Orochimaru và Kabuto đến nơi ẩn náu, Yamato kết luận rằng Danzo đang tìm cách tiêu diệt Konoha.

Hồi phục vết thương, Naruto và Sakura cùng Yamato truy đuổi Sai. Naruto ngỡ ngàng khi biết mình đã gây ra thương tích cho Sakura.

Để tìm hiểu thêm về Sai, đội Konoha quyết định xem cuốn sách ảnh của cậu. Tại nơi ẩn náu, Sai đối mặt với Sasuke trong bóng tối.

Orochimaru đưa phong bì của Danzo chứa thông tin về ANBU của Konoha cho Kabuto. Yamato, Naruto và Sakura đến nơi ẩn náu.

Sai tiết lộ mệnh lệnh thực sự của mình khi đội Konoha chất vấn cậu. Naruto cho Sai biết về mối quan hệ anh em với Sasuke.

Kabuto tấn công đội và giải thoát Sai, nhưng sau đó Sai lại phản bội anh ta. Cả đội chia nhau đi tìm Sasuke trong nơi ẩn náu của Orochimaru.

Khi Sai tiết lộ với Naruto rằng cậu ta thực sự có cảm xúc, Orochimaru tấn công họ, buộc Sakura và Yamato phải tới hỗ trợ.

Naruto và Sakura cuối cùng cũng đoàn tụ với Sasuke, còn Sasuke vẫn kiên định với quyết tâm trả thù anh trai Itachi.

Sasuke dũng mãnh bất ngờ chạm trán Cửu Vĩ Hồ và tấn công Naruto.

Bất chấp sự phản đối của Naruto, khao khát trả thù của Sasuke ngày càng lớn dần. Chỉ có sự can thiệp của Orochimaru mới ngăn cản Yamato cướp Sasuke bằng vũ lực.