Liên minh ninja đối mặt với bạch Zetsu cải trang thành ninja. Đội bảo vệ Daimyo tiếp tục chiến đấu với hắc Zetsu.

Kabuto kiểm soát Mu và nói với Madara rằng sức mạnh triệu hồi của hắn mạnh hơn so với thời kỳ đỉnh cao. Madara tấn công sư đoàn thứ tư.

Cửu Vĩ truyền sức mạnh cho Naruto để giúp cậu đẩy lui cuộc tấn công của Madara. Trong khi đó, đội bảo vệ Daimyo cuối cùng cũng đánh bại hắc Zetsu.

Trong khi Killer Bee bị các vật chủ tái sinh tấn công, Naruto nhận ra Utakata và bắt đầu trò chuyện bằng cách đi vào tiềm thức của anh.

Killer Bee và Naruto chiến đấu chống lại vật chủ đang khống chế Rinnegan và Sharingan, Kakashi và Guy cũng tham gia.

Naruto và Killer Bee tiếp tục chống lại Tobi và những vật chủ tái sinh khác.

Cửu Vĩ nhớ lại diễn biến mối quan hệ của mình với Naruto và những cuộc chiến giữa họ.

Vĩ thú đẩy Kakashi, Killer Bee và Naruto vào tình thế tiến thoái lưỡng nan. Naruto quyết định sử dụng sức mạnh toàn năng của Cửu Vĩ để đánh bại chúng.

Kakashi, Guy, Naruto và Killer Bee tiếp tục cuộc chiến chống lại những vĩ thú do Tobi điều khiển.

Trận chiến giữa năm Kage và Madara tiếp tục.

Cuối cùng cũng tỉnh lại, Sasuke đánh thức Mangekyou thôi miên và chuẩn bị rời hang ổ của Tobi. Cuộc chiến giữa ngũ Kage và Madara vẫn tiếp tục.

Madara quyết định sử dụng một kỹ thuật mạnh chống lại các Kage và giải phóng một loại phấn hoa có độc. Oonoki nhớ lại cuộc chiến đầu tiên của mình với Madara.

Itachi nói với Kabuto rằng anh muốn loại bỏ Kabuto để ngăn chặn quá trình Chuyển sinh linh hồn. Sasuke hợp lực cùng anh trai để giúp anh mình đánh bại Kabuto.

Kabuto cố gắng thuyết phục Sasuke hợp lực với mình để tiêu diệt làng Lá nhưng lợi ích của hai người lại xung đột với nhau.

Kabuto khám phá ký ức thời thơ ấu của mình.

Trong khi Kabuto cố gắng kết hợp các kỹ thuật của Âm tứ nhân với các kỹ thuật của Orochimaru, Itachi đã bẫy được anh ta bằng một cấm thuật.

Sau khi phong ấn Kabuto vào một vòng lặp thời gian, Itachi kể cho Sasuke về lịch sử của kỹ thuật này. Trong khi đó, Kabuto tuyệt vọng tìm cách thoát ra.

Itachi chào tạm biệt Sasuke. Ngũ Kage chiến đấu với Madara và các bản sao của hắn.

Dưới thần chú của Itachi, Kabuto thực hiện ấn tay để hủy bỏ Uế Thổ Chuyển Sinh.

Với sự giúp đỡ của Suigetsu và Jugo, Sasuke cố gắng giúp Orochimaru tỉnh lại bằng cách sử dụng nguyền ấn trên cổ Anko.

Với sự giúp đỡ của Guy, Naruto và Killer Bee, Kakashi cố gắng tìm ra lỗ hổng trong thuật phi vật chất hóa của Tobi.

Sau khi thành công phá vỡ mặt nạ của Tobi, Kakashi và Guy phải giải quyết hậu quả khi phát hiện ra thân phận thật của hắn.

Bí mật của Tobi bại lộ, Madara – người đã giải thoát bản thân khỏi Uế Thổ Chuyển Sinh và đánh bại ngũ Kage – nhập hội cùng hắn.

Những cảnh hồi tưởng về cái chết của Uchiha Obito, từ lần được cho là đã chết trong Đại chiến ninja lần thứ ba cho đến khi gặp Uchiha Madara.

Trước khi được cho là đã chết, Obito giao Sharingan của mình cho Kakashi và yêu cầu cậu bảo vệ Lin. Khi được hồi sinh, cậu sững sờ trước cái chết của Lin.

Số phận của Kakashi, Obito, Nagato và Danzo dường như đã đan xen từ nhiều năm về trước. Madara phát triển một mạng lưới ngày càng nguy hiểm.

Được hy vọng và ước mơ thúc đẩy, các thủ lĩnh trẻ lập ra tổ chức Akatsuki. Nhưng với Danzo và kẻ đeo mặt nạ, tất cả chỉ là ảo tưởng.