Lupin décide de voler la monnaie numérique de Marco Polo sur le Dark Web et demande l'aide du développeur du système de sécurité de la banque: Ami. Elle vit dans les tours jumelles, l'une au-dessus du sol et l'autre sous l'eau, mais est faible à cause d'une mauvaise alimentation. Avec l'aide d'Ami, ils transfèrent avec succès une fortune sur le compte de Lupin. Cependant, presque immédiatement après leur retour dans leur repaire, Zenigata et ses hommes entourent les lieux. Ils découvrent que Zenigata les a facilement trouvés grâce à un nouveau jeu en ligne, "Lupin Game".

La chasse se poursuit, avec Lupin, Daisuke, Goemon et Ami arrivant à un aéroport. Ils volent une voiture électrique, mais se retrouvent pris au piège dans un hangar par Zenigata et sont encerclés par la police. Dans le hangar se trouve un avion AW609 et, grâce aux compétences de Ami en matière de piratage informatique et à l'énergie de la batterie de la voiture électrique, l'avion démarre et s'échappe. Ils montent ensuite à bord d'un navire de croisière à destination de Bwanda, qui n'est pas membre de l'Interpol, de sorte que Zenigata ne peut les atteindre. Là-bas, Ami s’égare et est attaquée par des voyous, mais est sauvée par Lupin. Lupin pense qu'elle devrait rester avec eux pour se protéger de Marco Polo. Soudain, ils sont attaqués par des chasseurs de primes. Il y a maintenant un nouveau jeu en ligne, pariant sur le jour où Lupin va mourir.

hinpei Mayama, le Clan des Rats, Union Mama …la fine fleur des assassins du monde entier sont soudainement à la poursuite de Lupin. Tous participent à un jeu lancé par les dirigeants de Marco Polo le " Happy Deathday ". Ami utilise ses talents de hacker pour tirer Lupin hors du danger, mais en cours de route elle est blessée. Pendant que Jigen et Goemon sont attaqués, Lupin conçoit un plan pour simultanément éliminer tous les assassins.

Alors que Fujiko tient Lupin en joue avec un sourire narquois, Zenigata arrive à la rescousse. Lupin et Ami montent à bord du véhicule de l'inspecteur mais ils sont rapidement la proie de soldats appâtés par la prime pour la tête de Lupin. Ayant abandonné leur voiture, les trois compagnons de fortune doivent traverser le désert à pied, une tâche rendue d'autant plus difficile par la présence de Zenigata.

Lupin est abattu d'une balle en pleine tête. Le décès de la cible met fin au jeu de Lupin. Le temps passe et les gens finissent par oublier le jeu. N'ayant plus à poursuivre Lupin, Zenigata assure la protection d'Ami. Un jour, Goemon rend visite à celle-ci avec une lettre. Après l'avoir lue Ami décide d'avoir une confrontation avec les responsables de Marco Polo.

La banque Générale de Tokyo s'est dotée du " coffre malin ". Ce coffre-fort créé par les frères Hirameki analyse les facultés cérébrales de quiconque tente de l'ouvrir et attribue un score à cette personne. Qui plus est, le coffre ne s'ouvre qu'à la condition que ce score atteigne zéro. Lupin, dont le score est évalué à 300, est mis au défi par Fujiko et Jigen de réussir à ouvrir le coffre. Comment va-t-il s'y prendre ?

Gaston était autrefois un maître faussaire dans la pègre. Un tableau de son petit-fils sur lequel il a apposé la signature de Picasso est acheté par le millionnaire Monsieur B. Gaston engage Lupin afin qu'il récupère le tableau ce à quoi il parvient sans grande difficulté, si ce n'est que le tableau ressemble étrangement à un vrai Picasso. Lupin doit alors découvrir pourquoi il a réellement été engagé.

Lupin se rend sur la tombe de Gaston. Il y rencontre un vieil homme, Camille, avec qui il va boire un verre lorsque le téléphone de l'établissement se met à sonner. À l'autre bout du fil le supposé décédé Gaston lui parle. Lupin comprend qu'il s'agit en fait d'Albert alors que le bistrot est attaqué par la DGSE. Camille aide Lupin à s'échapper. En quoi les événements récents sont-ils liés ? Qui est donc Albert ? Le mystère du carnet noir se dévoile.

Lupin est blessé et Albert obtient le cahier noir. Mais celui-ci se fait coiffer au poteau par José. Lupin est secouru par Jigen et Goemon et parvient à survivre à ses blessures. Il raconte son passé avec Albert à ses comparses. Pendant ce temps, José commence à entreprendre des actions douteuses dans l'Hexagone...

Lupin fait face à Albert qui déclare que la France est sa cible. Après avoir interrogé Guillaume, ils apprennent la nature des terribles desseins de José. Avec son vieux complice Albert, Lupin se rend au QG de José. Jigen et Goemon affrontent de redoutables adversaires tandis que Lupin et Albert se dirigent vers le coeur de la base ennemie...

Lupin et sa bande passent le nouvel an au calme quand ce dernier retrouve une médaille qui ramène de vieux souvenirs d'une aventure passée. Pour dérober la fortune du baron de la drogue, Pablo Escobar, la bande se dirige vers l'Amérique du Sud en compagnie de Fujiko. Sur place ils font face au cartel pour finalement parvenir à la collection laissée par Pablo, mais ils sont surpris par ce qu'ils y trouvent...

Sur demande de Lupin, Goemon se rend dans une petite ville française en plein festival de cosplay. Il est venu assurer la surveillance et la protection de Chloé. Celle-ci a repris le bistrot familial après avoir quitté la Belgique. En effet, à la mort d'un ami fortuné, la jeune femme a hérité d'un bijou inestimable et depuis, elle est prise pour cible par des malfaiteurs...

Ami intègre le pensionnat pour jeunes filles d’Annecy où elle rencontre une fille étrange qui chasse le corbeau à l’arc. Il s’agit de Dolma, la princesse du royaume de Padar. Les deux jeunes filles se lient d’amitié tandis que Lupin a des vues sur le collier de la princesse, « La Larme de sang ».

"Princesse Dolma, sauvez Padar." C’est sur ces mots que Dolma est emmenée chez elle. Lupin la poursuit et Ami décide d’accompagner Fujiko à Padar pour sauver son amie. Le pays est divisé entre les conservateurs menés par le grand maître, et les réformistes dirigés par le roi. Lupin découvre que les conservateurs fomentent un coup d’état.

Lupin est transpercé par la flèche de Dolma. Ami et Fujiko s’enfuient avec Lupin et se cachent dans un bâtiment abandonné. En voyant Fujiko risquer sa vie pour Lupin, Ami ne sait plus quoi penser d’elle. Entretemps la loi martiale est instaurée dans le royaume de Padar, au bord d’une guerre civile.

Padar sombre dans le chaos à cause de la guerre civile. Mais il y a un soudain revirement de situation lorsque la société Shake Hands s'implique. Une allocution du roi est postée en ligne, prouvant que ce dernier est vivant. Lupin demande à Ami de se déguiser en Dolma pour infiltrer la cérémonie de couronnement où ils prévoient de sauver la princesse.

"Je veux que vous découvriez qui a tué mon mari." Il y a trois ans, quelqu’un a tiré sur le comte de Maupassant. Sa veuve, Isabelle, convoque Lupin chez elle pour qu’il enquête sur l’affaire. Il y a trois suspects, puis d’autres meurtres surviennent dans le vieux château… Place à Détective Lupin !

Peu de temps après avoir emménagé dans sa planque de Riquewihr, Lupin découvre à son réveil que les toilettes sont cassées. Après une bisbille avec Jigen pour l’accès aux toilettes, Fujiko entre dans la pièce et semble savoir ce qui bloque la plomberie. Lupin et sa bande commencent à se méfier de Fujiko quand Zenigata débarque…

Une série de fusillade frappe l’Afrique du Nord. Il s’agit en fait d’un défi lancé à Lupin par le riche Zylberstein. Lupin se dirige vers la vallée où son adversaire l’attend pour une partie d’échec. En parallèle, du haut des deux falaises se joue un duel de snipers entre Jigen et Mirage.

Lupin et sa bande visitent l’Ange du Nord, à l’extérieur de la Russie. Ce qui a priori semble être une ville terne et enneigée s’avère être un nid à trésors. Lupin s’intéresse à une banque mais découvre qu’elle a déjà été dévalisée par nul autre que Zenigata !

"Peoplelog" est un réseau social qui permet de tout savoir d’une personne à partir des données présentes sur internet analysées par son intelligence artificielle. Lupin est à Vienne pour dérober un musée d’art mais il est repéré par Peoplelog. Alors qu’il tente de s’échapper Peopleog prévoit chacun de ses gestes…

Fujiko a été capturée. Elle est retenue sur l’île d’Orig, le siège de Shake Hands. Lupin et sa bande, y compris Ami, se dirigent là-bas pour libérer Fujiko. Avec ses talents de hacker Ami sème le chaos chez Shake Hands, ce qui permet au groupe d’arriver à destination. Alors qu’ils avancent quelque chose dans le fils d’info sur Lupin perturbe Goemon.

Ami supplie son père enfin retrouvé de sauver Lupin. Mais ce dernier est obsédé par l’idée de sauver le monde grâce à Peoplelog. Six mois après leur capture, Lupin et Goemon sont transférés dans un convoi d’Interpol, c’est alors qu’un automobiliste bloque la circulation, une cigarette à la main.