为了寻找亚契，苏利班人已经登上企业号并将船员限制在他们的住所。亚契和丹尼尔斯设法及时将消息发送回企业号工作人员。里德在丹尼尔斯的旧房间里找到了一个时空旅行工具，但西里克接过它，亚契从31世纪回到了苏里班Helix。同时，由于伪造了曲速核心漏洞，企业号摆脱了Helix的束缚。亚契设法将Silik劫为人质，然后回到企业号。任务可以继续进行。

在特珀登船一周年之际的船长晚宴上，她向亚契和塔克讲述了一个历史事件，必须将其视为人类与瓦肯人之间的实际首次接触。特珀的曾祖母T'Mir属于瓦肯轮船的船员，当时该船正在观察斯普特尼克一号在1957年的发射，当时它被迫坠毁到了碳溪小镇附近的土地。机长在撞击中丧生。当幸存的船员的粮食用尽时，他们不得不住在当地居民中。其中一位叫梅斯特拉（Mestral），他热爱地球的文化，也热爱一个名叫麦琪（Maggie）的女人。他决定留在地球上，敦促他的两个船员假装自己在瓦肯轮船抵达时已经死了。

进入新发现的M类行星的轨道时，企业号遭受了隐身炸弹的袭击并受到严重破坏。另一枚地雷被困在船体上，里德出去解除了武装。在他的努力中，一个尖刺从地雷中伸出，刺入他的腿并将其钉在船的船体板上。亚契来帮助里德，但他可能不得不让船身板与里德一起漂浮才能拯救飞船。同时，罗慕兰飞船出现在现场，声称该星球为罗慕兰帝国所有，并要求企业号立即离开。由于没有机会解除地雷的武装，亚契消除了里德腿上的尖刺，从而触发了爆炸机制。他们隐藏在航天飞机舱门后面，保护自己免受爆炸的伤害。

企业号停靠在一个未知来源的自动修理厂，该厂使用先进的复制技术以惊人的速度快速修复了最近的战事以及里德受伤的腿。当梅威瑟在重建地区偶然被杀时，亚契对太空站的不好感受证明了这一点。但是弗拉士发现它实际上是梅威瑟的无生命副本。这个少尉与其他外星人一起被发现在太空站的核心地带，他们的大脑被用来补充计算机的力量。为了逃脱，有必要摧毁太空站。但是随着企业号的离开，它似乎已经在自我重建……

在访问Kreetassan母星时，Porthos感染了病原体。克里特萨斯人（Kreetassans）因Porthos在一棵神圣的树上撒尿而被得罪，拒绝提供承诺的血浆注射器，无助于为狗找到治愈方法。亚契几乎整夜都在熬夜，担心他的狗，并考虑向克雷塔萨斯人道歉。弗拉士医生迅速进行的即兴手术挽救了狗的生命。第二天，亚契经历了一次奇怪的道歉仪式，令克雷塔桑人高兴，以便他们运送注射器。

在一个遥远的外来采矿殖民地亚契，特珀和塔克见证了克林贡掠夺者如何压迫殖民者。在与他们作战一次并丧命八人之后，他们现在受到了威胁，但亚契最终说服了他们抓住机会。为了避免与克林贡人发生公开冲突，有必要避免其中的死亡。他们返回后，克林贡人进入了由船员和定居者设立的陷阱。由于功率过大，他们被送回船上，并被告知永不回来。

特珀负责逮捕叛乱的Menos，他在30年前没有从秘密行动中返回。她违背她的命令，要求亚契加入她的行列。两人在贸易基地找到了梅诺斯并将其逮捕。特珀变得异常激进，并要求Menos承认他所谓的走私生物毒素罪，而亚契确信该男子无罪。

在接近三位一体系统中的黑洞时，机组人员开始变得烦躁不安并沉迷于琐碎的事，而不是在乎他们的职责。只有特珀不受影响。原因是辐射来自系统内部。距离船员死亡只有不到两个小时的时间，特珀唯一的机会就是在靠近黑洞边缘的碎片场中驾驶飞船。她叫醒了亚契，亚契几乎无法应付，但在里德新安装的警报协议的帮助下，船终于自由了。

当极地风暴接近塔克和星正在研究的古老废墟时，亚契命令将两名军官传送到船上。星是第二名。回来后，她开始感到头晕，好像分子没有正确地重新组装。一段时间后，她意识到自己已经变得不可见并被宣布死亡。星发现外星人显然是在放炸弹炸毁船，但她警告船员的企图是徒劳的。最后，她在平台上物质化，并被告知没有发生任何事是真实的。她在模式缓冲区中只花了八秒钟。

塔克帮助一名Retellian货轮进行维修。两位Retellians之一发现崔普找到的女子已经醒了，敲打崔普失去了知觉，并把他们困在了船上。女子凯塔阿玛（Kaitaama）是克里奥斯帝国的君主，被囚禁在船上。两人设法释放了一个逃生舱并降落在附近的星球上。同时，另一位Retellian受亚契和特珀的讯问。

当企业号无法逃脱在高曲速时接近的中子风暴时，整个工作人员必须与三名Takret来宾一起躲在机舱内部屏蔽良好的“走秀”中。一段时间后，塔克调查了为何该物质和反物质注入器投入使用，他发现塔克雷特（Takret）军方正试图接管这艘船。这三位客人实际上是逃兵，但军方似乎对该船更感兴趣。当他们要为曲速驱动器加电时，时间紧迫。亚契声称自己是唯一的幸存者，扬言要摧毁这艘船，并让梅威瑟前往风暴中的漩涡。

在一个天然气巨星的轨道上，塔克的穿梭机突然被一艘小型外星飞船袭击，他需要降落在其中一颗卫星上。外星人，阿科尼亚人，也必须放下船只。不久，两人都在努力让应急发送器与他们的船只联系。同时，亚契与仇外的阿科尼亚人（Arkonians）取得了联系，后者允许企业留下来执行共同的搜索任务。爬虫类动物阿克尼亚人Zho'Kaan在热月上开始脱水。尽管他多次遭到他的袭击，但塔克还是有义务与他待在一起，直到双方都可以获救。

当他参加医学会议时，弗拉士医生向瓦肯同事寻求有关瓦肯疾病（帕纳德综合症）的建议。特珀通过与Tolaris的思想融合使Pa'nar收缩。它仅在无视的“融合者”亚文化中很常见。当瓦肯人的医生发现特珀患有这种疾病时，她将被免职。为了挽救特珀的职业，亚契建议她提及自己不是少数派成员，并受到武力感染，但是特珀认为这只会重申对少数派的偏见。瓦肯人的代表之一尤里斯医生最终揭露了特珀病的真相，他承认自己本人是少数派。

Shran要求亚契调解瓦肯恒星系统附近的小行星Weytahn / Paan Mokar所发生的安多利亚－瓦肯冲突。Weytahn最近被安多利亚人占领。在Shran表示愿意参加对话之后，亚契，特珀和Soval大使乘坐班车前往了地面，但被击落。同时，瓦肯和安多利亚船准备在小行星附近进行战斗，而企业号就在它们之间。当三位谈判者最终到达会场时，Shran发现他已被他自己的人民之一Tarah出卖，他不愿意对瓦肯做出让步。除去障碍，双方同意就小行星进行谈判。

发现一个有人类尸体的未知来源的受损豆荚漂浮在太空中。苏里班人要求将豆荚投降。亚契拒绝。进一步的证据表明，这艘小型船的发射日期为未来900年。托洛人是一个以敌对行动闻名的种族，与苏里班人的需求相同。托莱安人使瓦肯战舰失灵后，他们与苏利班战斗，这使企业号船员有时间准备销毁吊舱，以节省时间。然而，托利安人设法禁用了吊舱内的弹头。崔普激活了其紧急信标后，吊舱会消失得无影无踪。

亚契和崔普被误捕为Enolians的走私犯，并正在监狱运输到Canamar的刑事殖民地。刚宣布将其释放时，Enolian人 Kuroda和他的诺西卡助手煽动起义并接管了这艘船。亚契通过点燃尾气等离子欺骗两艘Enolian巡逻船而赢得了Kuroda的信任。但是，Kuroda无意释放他的同胞囚犯，而是计划在他离开后将其焚化为行星状。

企业号被更大的飞船吞没了。在探究了其内部之后，塔克被证实是被一种非物质的外星生物所占领。亚契离开塔克并释放飞船的要求显然是由外星人满足的。但是当船员们正在努力使船再次投入运营时，更多的外星人登上了船，接管了24名船员，而其余的人则躲在了坚不可摧的机舱“走秀”中。与外星人不相容的弗拉士医生向船上充斥二氧化碳，使船员几乎窒息而死，于是外星人离开了。

亚契正在克林贡法庭上，因为他帮助所谓的叛乱分子逃脱了。这就是战列巡洋舰复仇号的杜拉斯所证明的。尽管不再习惯，但亚契可以说服其律师科洛斯让他讲述这个故事。但是，法院决定将他转移到Rura Penthe的刑事殖民地。科洛斯必须加入他的行列。贿赂克林贡官员后，可以从鲁拉·潘特（Rura Penthe）救出亚契，但科洛斯决定留下来。

在企业号绕道而行调查行星上的火山活动时，梅威瑟少校借此机会参观了他家人的船ECS地平线号。他的父亲最近去世了，尽管所有人都很高兴见到他，但特拉维斯很快就不得不了解到这不再是他的世界。受到外星人攻击后，他将舰船的等离子大炮升级为哥哥的不悦。但是，当外星人返回并要求将地平线号移交给他们时，改进后的武器将帮助击败敌人。

派遣了一支与塔克，里德和梅威瑟一起的客队，从Xantoras的一个洞穴系统中疏散了一群德诺布拉地质学家。当梅威瑟受伤并且迪诺布拉人不愿离开时，任务没有按计划进行。同时，企业号在事故发生后为乘客运输提供医疗援助和维修。一名重伤的病人是安塔拉人。事实证明，直到300年前，德诺布兰人和安塔拉人之间爆发了激烈的战争，这就是为什么仍然充满仇恨的安塔拉人拒绝接受弗拉士医生的待遇。在亚契的敦促下，弗拉士必须克服自己的骄傲和成见，才能赢得对Antaran的信任和尊重。

企业号首次与Vissians接触，Vissians的先进技术使他们可以密切研究超级巨星。当亚契和Vissian船长一起在吊舱中探索恒星的光球时，崔普得知，Vissian人是祖先的奴隶，是祖先的第三种性别。崔普与Vissian首席工程师的祖父成为朋友，并教它阅读并展示给人们带来生活乐趣。当祖先请求庇护时，阿亚契必须拒绝该请求。在Vissians离开后不久，企业号收到一条消息，指出该祖父已自杀。

当一个研究小组在2063年在北极圈附近发现博格船只的残骸时，这些博格个体开始再生，吸收并吞并了他们的航天飞机。企业号追随博格，并在他们吸收Tarkelean船只的过程中与他们互动。随着博格船的驶离，看似被救出的病床塔卡林人将纳米探针注入了弗拉士，并开始在船上安装博格装置，直到亚契决定将它们吸入太空。禁用博格技术后，企业号能够赶上博格船并摧毁它，而弗拉士则通过暴露在微米辐射下进行恢复。

亚契收到一条消息，称老朋友罗宾逊舰长去世。当他们乘坐航天飞机探索所谓的暗物质星云时，亚契告诉特珀他们在NX开发项目中的时间。鲁滨逊进行了第一次曲速2级飞行，但是在NX-Alpha原型机的爆炸中幸存下来。该项目将被推迟。然后，亚契和罗宾逊在塔克的帮助下，将NX-Beta进行未经许可的飞行，达到曲速2.5级，此后该项目继续进行。亚契和特珀可以从飞船发射的电荷点燃星云，从而确认星云中存在暗物质。

亚契是泰拉赏金猎人Skalaar的囚徒，他将把他移交给克林贡人。特珀和弗拉士已经吸收了微生物，需要留在去污室中。微生物会在特珀中引起庞发，而弗拉士很难忍受。同时，Skalaar必须将航天飞机降落在L级星球上，才能逃脱竞争对手的赏金猎人。Skalaar的船Tezra被克林贡人抓住，当得知亚契的Tezra被拆解后，他愿意帮助亚契逃脱。

新地派出的探测器摧毁了佛罗里达和加勒比海地区，造成700万人丧生，其中包括崔普的姐姐莉兹。根据苏里班未来的来访者的说法，新地人是在先发制人的自卫中这样做的，因为自400年以来，他们的家园将被人类摧毁。他们将建造一个更大的装置来摧毁整个星球。在克林贡人杜拉斯的追捕下，企业号回到地球。在瓦肯的建议下，亚契说服星际舰队司令部派遣企业号对付新地，新地原本应该躲在德尔菲空域中，该区域是所有太空种族都恐惧的空间。特珀决定不接受她的命令。配备新的光子鱼雷的企业号摧毁了杜拉斯的船只，并进入神域 ...