Mientras la Enterprise es invadida por los sulibanes, el capitán Jonathan Archer, atrapado en un futuro remoto, descubre que su desaparación de las líneas temporales es la causa de la devastación de la que es testigo el siglo XXXI.

Contradiciendo los libros de historia, T'Pol rememora cómo su bisabuela tomó parte en el primer contacto real entre los vulcanianos y los humanos, en la pequeña ciudad minera de Carbon Creek, en Pensilvania.

Averiado el Enterprise por una mina orbital alienígena en territorio ocupado por romulanos hostiles, Malcolm Reed intenta desactivar el artefacto. Al fracasar, intenta sacrificar su propia vida para salvar la de sus compañeros.

Tras acoplarse con una misteriosa estación espacial, la tripulación del Enterprise se asombra de las capacidades técnicas de la estación. Sin embargo, esa sensación de demasiado bonito para ser real se transforma en amargura cuando el alférez Travis Mayweather es hallado muerto.

Afectado por un virus contraído mientras acompañaba al capitán Jonathan Archer en una misión diplomástica, su sabueso Porthos es confinado en la enfermería. Mientras consuela a su mascota, Archer se encuentra cada vez más inmerso en pensamientos íntimos relacionados con T'Pol.

Buscando combustible, la Enterprise encuentra una pequeña colonia minera cuyos habitantes viven aterrorizados por unos bandidos klingons que roban los suministros de la colonia. El capitán Jonathan Archer y su tripulación se unen a la lucha.

Al serle encargada una misión secreta por el Alto Mando Vulcaniano, T'Pol le pide al capitán Jonathan Archer que la acompañe, una petición que sorprende al capitán, especialmente cuando se descubre que T'Pol tiene un interés personal en alcanzar el objetivo de su misión.

Al volver a una civilización pre-warp en busca de un comunicador abandonado allí accidentalmente en una misión de investigación, el capitán Jonathan Archer y Malcolm Reed son capturados y sentenciados a muerte acusados de ser agentes de los enemigos de sus captores.

Cuando se dirigen a observar parte de un sistema estelar trinario, la tripulación descubre que sus tareas diarias se están convirtiendo en una obsesión. No afectada por ese comportamiento compulsivo, T'Pol investiga, y descubre un peligroso factor que afecta a sus compañeros.

Tras realizar de mala gana su primer viaje en transportador, Hoshi sale del mismo sintiéndose rara, y empieza a imaginar que sus compañeros actúan de forma diferente con ella. Pese a que Phlox intenta convencerla, Hoshi no le cree, y sus investigaciones revelan la implicación de alienígenas.

Respondiendo a una llamada de ayuda, la Enterprise descubre que la nave que necesita ayuda transporta a una hermosa prisionera en estado criogénico. A pesar de liberarla de sus captores, Trip encuentra a la bella alienígena irritantemente combativa.

Amenazada por una mortífera tormenta radiactiva, toda la tripulación de la Enterprise se ve forzada a buscar refugio durante ocho días en una pequeña cavidad de mantenimiento, sin saber que una presencia alienígena intenta tomar el control de la nave.

Tras ser disparado en una misión en solitario, Trip se ve forzado a aterrizar en una luna donde hace un calor mortal durante las horas diurnas. Para salvar su vida, Trip tiene que contactar con la Enterprise antes del amanecer. Sin embargo, un agresivo alienígena se interpone en su camino.

La posición y la carrera de T'Pol se ven amenazadas cuando le diagnostican el síndrome de Pa’Nar, una enfermedad vulcaniana que se contrae a través de la fusión mental: una práctica considerada de mal gusto por la sociedad vulcaniana, incluido el Alto Mando.

Con los andorianos y los vulcanianos envueltos en un conflicto por la ocupación de un pequeño planeta, al capitán Jonathan Archer le encargan que medie entre las dos partes. A pesar de tener éxito al principio, los progresos de Archer son frustrados por un oficial granuja de uno de los bandos.

Tras encontrar una pequeña nave que contiene un cadáver humanoide, la Enterprise es atacada por los sulibanes y los tholianos, los cuales insisten en reclamar para sí la nave futurista.

La Enterprise encuentra una enorme nave extraterrestre que se traga a la nave de la Flota Estelar. Mientras están en el interior del gigante, unos alienígenas incorpóreos intentan intercambiar sus mentes con la tripulación de la Enterprise. Las intrigantes sensaciones esconden una extraña amenaza.

Acusado de conspirar contra el Imperio Klingon, el capitán Jonathan Archer se enfrenta a cadena perpetua en la dura prisión de Rura Penthe si es declarado culpable. Por desgracia, el abogado klingon de Archer es demasiado experto como para ofrecer una defensa combativa.

Con la Enterprise haciendo otras cosas, Travis Mayweather aprovecha la ocasión para visitar la nave en la que creció. Por desgracia, el regreso de Travis es empañado por la muerte de su padre, las tensas relaciones con su hermano, y un ataque alienígena.

Mientras Travis y otros intentan rescatar a tres denobulanos de unas profundas cavernas, Phlox se encuentra con un paciente antarano que se niega a ser tratado por un denobulano debido a los conflictos históricos entre las dos razas.

Al establecer el primer contacto con los visianos, la tripulación de la Enterprise descubre que esos alienígenas tienen tres sexos y que los del tercer sexo son tratados como ciudadanos de segunda clase. Trip tienta al desastre cuando enseña a leer a uno de los cogenitores, el tercer sexo.

Al descubrir los cuerpos de unos alienígenas perfeccionados cibernéticamente que habían estado enterrados en un glaciar durante casi cien años, un equipo de investigación ártica revive a los seres, con consecuencias estremecedoras.

Cuando el capitán Jonathan Archer se entera de que A. G. Robinson, su antiguo rival del programa NX, ha muerto, él rememora los días en que competía con Robinson por ser el primer piloto en superar la barrera Warp 2.

Capturado por un tellarita cazarrecompensas, el capitán Archer se encuentra en ruta para ser entregado a los klingons a cambio de una nave confiscada. Mientras, un microbio desencadena el impulso reproductor vulcaniano de T'Pol, con demoledoras consecuencias.

Una sonda alienígena desencadena un violento ataque contra la Tierra, cortando una franja desde Florida hasta Venezuela, y matando a millones de personas. Enviado a enfrentarse a los atacantes, el capitán Archer encuentra a los klingons y los sulibanes en el camino a la zona mortal conocida como la "Expansión".