Enterprise pod dowództwem kapitana Jonathana Archera wyrusza w dziewiczy rejs z misją powrotu rannego Klingona do swoich ludzi.

Kapitan Archer pragnie przekuć ciekawość w czyny i postanawia wejść na statek unoszący się w kosmosie. Hoshi ma problemy z przystosowaniem się do życia na Enterprise.

Kiedy Enterprise bada niezamieszkaną planetę, która okazuje się o wiele bardziej niebezpieczna niż się spodziewano. Członkowie załogi, którzy odwiedzają planetę, są zarażeni przez obcy pyłek, który wywołuje halucynacje i paranoję.

Kiedy Trip zostaje wysłany, by pomóc obcemu statkowi z problemami z zasilaniem, jest zachwycony, że ma przyjazne spotkanie z jedną z inżynierów statku. Ale po odkryciu, że ich szczególny moment spowodował zajście w ciążę, uświadamia sobie, że miał nieświadome doświadczenie z obcym seksem. Archer i jego załoga muszą wtedy spróbować zwrócić szybko rosnącemu dziecku obce matce.

Załoga Enterprise zmienia kurs, aby zbadać tajemnicę Terra Nova, legendarnej kolonii Ziemi, której mieszkańcy tajemniczo zniknęli wiele lat temu. Ale kiedy przybywają, konfrontują potomków kolonistów, którzy stali się bardziej obcy, niż Archer mógł sobie kiedykolwiek wyobrazić.

Załoga Enterprise płaci przyjazną wizytę w starożytnym sanktuarium duchowym wulkanu, pomimo obawy T'Pol, że jej koledzy z pracy będą niezręczni i uciążliwi. Po wylądowaniu odkrywają, że klasztor został przejęty przez Andory, paranoiczną i wysoce pobudliwą rasę kosmitów o długiej historii konfliktu z Wolkanami. Archer wkrótce odkrywa, że załoga Enterprise dostała się w środku międzygwiezdnej Puszki Pandory i teraz musi znaleźć wyjście.

Statek Vulcan zakłóca sondę Archera nad przewymiarowaną kometą.

Kapitan Archer i załoga odkrywają w pełni zamieszkałą, cywilizowaną, choć mniej zaawansowaną planetę podobną do Ziemi. Przebrani za wygląd swoich mieszkańców, płacą planecie wizytę rozpoznawczą, gdzie dowiadują się, że szkodliwa choroba dotyka miejscową ludność. Gdy Archer stara się pomóc im znaleźć źródło choroby, znajduje się w bliskim kontakcie z uroczą żeńską kosmitą.

Załoga Enterprise jest wysyłana przez Dowództwo Gwiezdnej Floty, aby pomóc Fortunate, ludzkiemu statkowi towarowemu, który został zaatakowany przez piratów Nausicaan. Po przybyciu są zaskoczeni, że załoga Fortunate jest odporna na starania Archera, aby im pomóc i zdecydowana dążyć do zemsty na swoich napastnikach, bez względu na reperkusje.

Enterprise ma grupę kosmitów obserwującą zjawisko gwiezdne na pokładzie. Kiedy statek zostaje cudownie uratowany przed wysadzeniem, załogant Daniels ma ważną wiadomość dla Archera.

Kiedy Enterprise zostaje zaatakowany przez niezidentyfikowany statek wroga, załoga musi działać szaleńczo, aby uruchomić nowe kanony fazowe. Tymczasem Archer zdaje sobie sprawę, że nikt nie zna Reeda wystarczająco dobrze, by dać mu spersonalizowany prezent urodzinowy.

Załoga odkrywa nową planetę z dwoma wyścigami, z których jedna jest w rozpaczliwej potrzebie medycznej i naukowej pomocy. W trakcie próby pomocy dr Phlox wspomina swoją własną denobulańską przeszłość, aby rozwiązać dylematy etyczne, które pojawiają się w teraźniejszości.

Kiedy Enterprise natknie się na ranny statek Klingonów, T'Pol, Hoshi i Reed zdejmują palec, aby zbadać sprawę. Tam zostają złapani w pułapkę przez wrogą klingońską kobietę, która przejmuje kontrolę nad shuttlepodem, pozostawiając członków załogi Enterprise niebezpiecznie utkniętych na pokładzie statku Klingonów. Teraz to Archer musi wziąć Klingona pod straż i poprosić o pomoc w ratowaniu swojej załogi.

Archer i załoga są zawiedzeni, gdy odkrywają, że Tefol został nakazany przez Wysokie Dowództwo Wulkana, by opuścił Enterprise - i równie sfrustrowany z powodu jej pozornej obojętności, że opuścił ich szeregi. Ostatnia misja T'Pola jako oficera Gwiezdnej Floty okazuje się pełna wydarzeń, kiedy ona i Archer zostają porwani przez bojową frakcję na obcej planecie. Jednak pomoc przychodzi im w postaci Andorian: ich przywódca, Shran, wciąż jest winien Archerowi dług (od wydarzeń z "Incydentu andorskiego"). Okazuje się, że Wolkańczycy potajemnie popierają rządzącą frakcję na planecie, podczas gdy Andorianie pomagają bojownikom o wolność. Przy pomocy Andorianów, Malcolma i Tripa ratują Archer i T'Pol w sprawie sprzeciwu miejscowego statku Vulcan, a Shran uważa, że jego dług wobec Archera został spłacony.

Enterprise napotyka grupę mieszkańców Vulcan, którzy oderwali się od normalnego życia wulkana, starając się odkryć swoje emocje. T'Pol jest zaniepokojony przez nowych gości i ostrzega kapitana, że wszelkie próby z przeszłości wcielenia wulcanowych emocji w ich życie okazały się katastrofalne. Tymczasem wiadomość od admirała Forresta pozostawia kapitanowi trudne zadanie przekonania jednego z odwiedzających Wolkanów, aby zadzwonił do domu i porozmawiał z umierającym ojcem.

Podczas eksploracji niezbadanej planety, członkowie załogi Enterprise napotykają grupę kosmitów, którzy tropią miejscowe stworzenia do rekreacji. Podczas eksploracji Archer jest zahipnotyzowany wizjami kobiety desperacko próbującej się z nim komunikować. Eteryczny sygnał cierpienia kobiety informuje Archera, że ona i inne podobne do niej są w rzeczywistości ofiarą łowców obcych. Reagując na wezwanie, Archer wyrównuje pole walki z łowcami kosmitów.

Enterprise napotyka piratów z Ferengi, którzy używają gazu, aby znokautować załogę i szukać skarbów na Enterprise. Ale nie liczyli na Tuckera, który znajduje się w komorze dekonstrukcji i unika gazu, i próbuje odzyskać statek od piratów.

Podczas eksploracji rozbitego statku na opustoszałej planecie, załoga Enterprise jest nawiedzana przez niektóre upiorne postacie i napotykają obcą rasę, która przetrwała mimo nieprzezwyciężonych szans. Trip pomaga naprawić ich opuszczone jednostki i zaprzyjaźnia się z Lianą, atrakcyjną kosmitą, która rozwija w sobie uczucia.

Podczas zwiedzania planety, Archer i Mayweather wchodzą do "strefy wojskowej" i są przetrzymywani w internowanym więzieniu przez obcą rasę zwaną Tandarans, którzy toczą wojnę z Sulibanami. Podczas gdy poprzednie ekipy Enterprise z Sulibanami były katastrofalne, Archer i Mayweather dzielą się celą z niektórymi więźniami Suliban, którzy, jak sądzą, mogą zostać niesłusznie uwięzieni.

Dziwna, symbiotyczna obca istota wsiada do Enterprise, chwytając kilku członków załogi, w tym Archer i Trip, i kokonuje ich w sieci żywiąc się ich ciałami, aby przeżyć. Gdy życie uwięzionych członków załogi jest zagrożone, Hoshi, pod dowództwem T'Pol, staje przed największym wyzwaniem, próbując znaleźć sposób na komunikację z formą życia, aby powrócić do swojej macierzystej planety.

Enterprise planuje wycieczkę do relaksującej planety Risa, kiedy otrzyma pilną prośbę od dowództwa Vulcan. Muszą wybrać ambasadora V'Lara, który popadł w niełaskę. Najwyraźniej wykorzystała swoje stanowisko podczas negocjacji na planecie Mazar i została eksmitowana. Po tym jak Enterprise odebrał V'Lara i jest już w drodze na spotkanie z okrętem Vulcan Sh'Ran, nagle pojawia się statek Mazarytów. Chcą V'Lar na dalsze przesłuchania. Kiedy kapitan Archer chce przedyskutować to najpierw z dowództwem Gwiezdnej Floty, otwierają ogień.

Enterprise jest po raz drugi w drodze do Risy, kiedy ponownie pojawia się kolejna pilna sprawa: wezwanie pomocy. Pochodzi z małego statku. Właściciel, Zobral, jest bardzo zadowolony z pomocy Enterprise i zaprasza kapitana Archera do swojego rodzinnego świata na dobry posiłek i grę w Geskana. Kiedy Archer i Trip wylądowali na pustynnej planecie, Enterprise otrzymuje wiadomość od kanclerza Torothana Trelita. Mówi, że Zobral nie jest tak miłym człowiekiem, jak myśli kapitan Archer.

Gdy załoga opuści brzeg lądu na słynnej planecie przyjemności Risy, Archer ma tajemnicze spotkanie z obcą kobietą; Hoshi ma zaskakująco romantyczne spotkanie; Mayweather ma wypadek wspinaczki; a Trip i Reed chodzą tylko po to, aby zakończyć wieczór jako nieświadome ofiary napadu. Tymczasem Floks pozostaje na pokładzie Enterprise z T'Pol, aby przeżyć coroczną 48-godzinną hibernację i wykazuje pewne nietypowe osobliwości, kiedy muszą go obudzić po tym, jak ranny członek załogi wróci z urlopu na brzegu.

Enterprise odkrywa kolonię górniczą z Paraagans. Załoga dostaje zaproszenie na spotkanie na powierzchni, a kapsuła promowa próbuje przebić się przez atmosferę. Nagle tuż pod promem zaczyna się gigantyczna eksplozja i przypala ziemię pod ziemię. Wszystkich 3600 kolonistów uważa się za zmarłych. Po zbadaniu Enterprise odkrywa, że wyciek plazmy z otworów wentylacyjnych zapalił tetrazynę w atmosferze. Porucznik Reed upewnia się jednak, że zamknął szczeliny w plazmie, zanim zniknął prom. Po rozmowach z admirałem Forrest of Gwiezdnej Floty kapitan Archer dowiaduje się, że misja Enterprise została odwołana i muszą wrócić do domu, a nie wrócić do kosmosu przez kolejne dziesięć czy dwadzieścia lat. Kiedy statek zmienił kurs, członek załogi statku, Daniels, podróżujący w czasie, odwiedza kapitana Archera.