Największa organizacja gwarantująca spokój i bezpieczeństwo wszechświata - Wspólnota Planet - rozpada się w wyniku zdrady jednej z ras (Nietzhean).

Kapitan statku Andromeda - Dylan Hunt, dostawszy się w zasadzkę, rozkazuje załodze opuścić statek, sam zaś próbuje odciągnąć wrogą flotę. Niestety, Andromeda wpada w czarną dziurę.

Po 300 latach poszukiwacze wraków wyciągają ją z osobliwości razem z Huntem, dla którego czas się zatrzymał. Zorientowawszy się, że wszystko co znał i kochał zostało zniszczone, a wszechświat jest nękany wojnami i wyzyskiem, postanawia przywrócić Wspólnotę Planet. W tym celu sprzymierzając się z nową załogą, wyrusza z misją, aby zachęcić inne światy do przyłączenia się.