Neuf mois se sont écoulés depuis la libération de Michael et ses amis. Un agent de la CIA lui a confié une mission secrète : approcher Randall Burke, un ancien agent de la CIA devenu truand pour qu'il les mène à son chef, qui dirige un réseau terroriste en République dominicaine...

Michael et Strong, son superviseur, décident de retourner à Miami pour neutraliser l'homme qui continue de poser des questions sur Michael, afin d'éviter que la couverture de ce dernier ne soit éventée. Seulement, ses amis sont également à la poursuite du malfrat...

Burke projette de voler un camion contenant un équipement technologique de pointe. Michael lui propose l'aide de Jesse et Sam. Mais Burke projette en réalité de vendre ce matériel à Rafael Serrano, un terroriste. De leur côté, Madeline et Fiona doivent se débarrasser d'un bookmaker à qui Nate devait de l'argent...

Afin d'aider Michael à faire libérer un prisonnier retenu à Cuba par des agents russes, Fiona et Maddie doivent monter un piège contre un bureaucrate corrompu...

Andrew doit convaincre Fiona de venir en aide à Michael, qui doit fuir Cuba avec l'aide d'un ancien espion russe qui travaille dans l'organisation de Burke...

Michael se demande s'il a bien fait de demander l'assistance de Fiona pour l'aider à voler des données secrètes. Sam et Jesse sont sur une mission spéciale...

Michael est capturé par des membres de l'organisation qu'il essaye d'éliminer. Drogué par ses ennemis, il risque de leur fournir des informations sensibles...

Le groupe qu'a infiltré Michael le charge de faire tomber un réseau de trafic de stupéfiants. Fiona, Jesse et Strong en découvrent un peu plus sur James...

Maddie a le sentiment d'être suivie et décide de se défendre toute seule. Un diplomate, pris en charge et épaulé par l'équipe, est empoisonné...

Un ami de Michael menace de dévoiler le rôle qu'il a tenu dans une mission cruciale, tandis que le petit-ami de Fiona est victime des assauts d'un gang...

Michael part en mission avec Sonya au Mexique, sans savoir que Strong a recruté des mercenaires pour accomplir une mission délicate : capturer James...

Sonya demande à Michael des explications sur leur histoire. James, lui, cherche à découvrir sa véritable identité. Fiona et Jesse s'inquiètent...

Mike, Fiona et Sam sont à la recherche d'un informaticien qui a jadis travaillé avec James. Cet homme est susceptible de connaître l'endroit où se trouvent les données entières de l'organisation de James. Jesse, de son côté, est chargé de protéger Madeline des hommes de James. La CIA a cependant lancé un avis de recherche à l'encontre de toute l'équipe. Des choix difficiles seront pris du côté de Michael, mais également de celui de Madeline...