När MacGyver följer med Penny Parker till en herrgård hon ärvt av sin försvunna faster hittar han ett skelett. Det dröjer inte länge förrän de är mitt uppe i ett 30 år gammalt mysterium.

MacGyver beger sig till sin hemstad där han hjälper en barndomsväns son som hamnat i onåd hos några lokala knarkhandlare.

MacGyver är ute och kör bil när bilens däck exploderar och han slungas över en brant. Han vaknar upp och upptäcker att han blir omhändertagen av det lokala amishfolket. Men han får snart fullt upp då han inser att det lilla samhället hotas av en aggressiv byggfirma.

MacGyver utger sig för att vara en vapenhandlare för att kunna infiltrera en rebellgrupp i Latinamerika där en nunna och en svårt skadad man hålls som gisslan.

MacGyver hamnar bakom ratten på en experimentell racingbil efter att föraren skadats i en mystisk krasch under kvalificeringsheaten.

MacGyver och Pete Thornton är ute i vildmarken i samband med en Phoenix foundation-träning när de hittar ett vrak. Det visar sig vara ett spaningsflygplan som tillhör narkotikapolisen och spåren leder till några farliga knarksmugglare.

MacGyver blir indragen när en seriemördare rymmer från en psykiatrisk mottagning.

MacGyver och Jack Dalton hamnar mitt ett kidnappningsdrama när de ger sig ut för att leta efter Jacks mamma. Det visar sig att hon är på flykt undan både polisen, en prisjägare och en korrupt tjänsteman.

MacGyvers gamla rival Murdoc använder Penny Parker som lockbete i en bisarr plan att lura MacGyver i en fälla.

Pete vet inte vad han ska göra när han upptäcker att hans son har sålt hemligstämplad information till en kriminell organisation.

MacGyver tar itu med en fejd mellan två familjer för att kunna rädda den kidnappade sonen till en tekniker på Phoenix Foundation.

MacGyver hjälper en rehabiliterad gängmedlem som anklagas för att ha stulit en bil.

MacGyver hjälper en ung prostituerad som försöker fly från sin hallick för att starta ett nytt liv.

MacGyver får i uppdrag att hitta ett lass med ryskt guld som förlorats i en flygplanskrasch. På nedslagsplatsen upptäcker han att piloternas kroppar och nästan allt guld är försvunnet.

MacGyver vet inte vad han ska tro när en vän som just återvänt från Östafrika börjar hallucinera och gå i sömnen.

MacGyver och Thornton tas som gisslan av en terroristgrupp som vill förlama staden med hjälp av en elektromagnetisk apparat.

MacGyver häpnar när han upptäcker att tjuven som stulit ett provrör med dödliga bakterier från Phoenix Foundation är en gammal vän som en gång i tiden räddade hans liv.

En hämndlysten intern som nyligen blivit frigiven ger sig ut i skogen på jakt efter MacGyver.