När en dator börjar krångla under ett test av dess säkerhetssystem blir MacGyver och systemets skapare inspärrade och de hamnar i livsfara.

MacGyver råkar oavsiktligen leda en torped till sitt mål, en man som jagas av både regeringen och maffian.

MacGyver och Thornton försöker komma åt en bedragare som lurat en gammal vän till dem på alla hans besparingar.

MacGyver ställs inför en oväntad komplikation när han erbjuder sig att hämta en väns lillebror från ett födelsedagskalas. Pojken visar sig vara inblandad i ett farligt bedrägeri och MacGyver måste ta sig an kinesiska gangsters för att rädda honom.

MacGyver får i uppdrag att övervaka fyra unga gängledare som försöker gräva ner stridsyxan under en campingresa. Det blir i en kamp för överlevnad när deras flygplan kraschar mitt i ödemarken.

Jack Dalton behöver hjälp med att befria en botanist som kidnappats av knarksmugglare. Det visar sig att botanisten är en gammal vän till MacGyver.

MacGyver reser till Sydostasien för att rädda en nunna, några föräldralösa barn och en gammal flamma som alla hamnat i händerna på en förtryckande regim.

MacGyver hamnar öga mot öga med en förrymd fånge som skjutit en sällsynt örn och nu vill röja MacGyver ur vägen.

MacGyvers vän som är döv har mardrömmar som kan bistå i jakten efter ett stulet navigeringssystem för missiler.

MacGyver kämpar mot maffian samtidigt som han beskyddar ett äldre par som råkat bli inblandade i penningförfalskning.

MacGyver är inspärrad i Phoenix foundation tillsammans med sin farfar. Han måste hitta och desarmerna en bomb innan den exploderar.

MacGyver blir inblandad när Penny blir vittne till hur en gangster torterar en federal agent.

MacGyver måste rädda en gravid kvinna som hamnar i livsfara när hon försöker avslöja sin makes gangsterliga.

Marinkåren ber MacGyver om hjälp med att fånga in några pirater som kidnappat en arkeolog.

MacGyver är på skidresa när han råkar komma över en mikrofilm som innehåller bevis på illegal spelverksamhet.

MacGyver tar hjälp av sin vän Jack Dalton för att stoppa en korrupt CIA-agent och hans anhang som smugglar ut topphemlig information.

MacGyver och Thornton ställs inför en lönnmördare som de trodde varit död i flera år.

MacGyver försöker rädda en amerikansk pilot som åtalats för spioneri i Centralamerika.

När MacGyver överraskas med en födelsedagsfest på Phoenix Foundation får han anledning att minnas sin gamla vän och äventyr. Han överväger även om det är dags att byta jobb.

MacGyver skadar sig och tappar minnet efter en konfrontation med några torpeder. Då han innan skadan upptäckte att det finns en bomb redo att smälla av under en begravning gäller det att minnet återvänder i tid.

MacGyver tvingas samarbeta med en hänsynslös frilansagent för att kunna rädda en människorättsaktivist.