MacGyver s Peteem testují nový bezpečnostní systém v přísně tajném výzkumném středisku. Když systém selže, Mac se setkává se systémovou konstruktérkou doktorkou Jill Ludlumovou, se kterou se pokusí nebezpečný a mimořádně komplikovaný počítačový systém vyřadit z provozu a najít cestu ven.

Agent MacGyver věří, že pomáhá zoufalému otci najít ztraceného syna. Je to ovšem trik. Časem Mac pochopí, že Louie není tím, za kterého se celou dobu vydával. Mac ve skutečnosti pomáhá nájemnému vrahovi Jimmymu „Čističi“ Kendallovi najít jeho další oběť, kterou chce zlikvidovat.

Angus MacGyver a Peter Thornton chystají překvapení pro kolegu v podobě divokého večírku. Když se však kolega neobjeví, MacGyver ho hledá a najde docela zhrouceného, ve stavu těsně před sebevraždou. Jistý podvodník ho obral o veškeré životní úspory. MacGyver si myslí, že by bylo dobré podvodníka pořádně vytrestat a navrhne zrealizovat plán pomsty – jakýsi podvod na druhou. Přesvědčí se však, že podvést podvodníka není až tak jednoduché!

MacGyvera vyšlou, aby vyzvedl přítelova bratra Paula Chana. Zaplete se přitom do podvodu starého bohatého čínského obchodníka, který pátrá po reinkarnaci legendárního Božského dítěte, aby získal jeho nesmrtelnost. Podle legendy Božské dítě přináší věčný život tomu, kdo jím disponuje. Shodou okolností by toto Božské dítě mělo vypadat zcela jako MacGyverův přítel.

Když MacGyver dostane možnost zapojit se do rehabilitačního programu pro narušenou mládež v horách, okamžitě se chopí šance. Ale poté, co se osobně setká s problémovou čtveřici teenagerů, pochopí, že zvládnout komplikované vztahy mezi mladými násilníky a divochy je nad jeho síly. MacGyver se proto rozhodl předčasně odejít domů. Letadlo však havaruje uprostřed pustiny a přežití pasažérů závisí na tom, jak dokáží spolupracovat. Bude to těžké, neboť mezi čtveřicí mladých vzpurných lidí roste napětí, násilí, rivalita a násilí.

MacGyver dorazí domů a zjistí, že mu kompletně vykradli byt. Při pátrání po zlodějích se MacGyver setká se svým starým přítelem Jackem Daltonem. Jack se mu svěří, že potřebuje pomoc při záchraně jistého botanika, kterého zajali při přepravě orchidejí ze středoamerických zemí. MacGyver nakonec souhlasí s tím, že mu pomůže. Když Jack zjistil, že přepravované orchideje s obsahem heroinu patří drogovému dealerovi Sonnymu a zkorumpovanému policejnímu plukovníku Antunnezovi, přerušil zločincům systém zásilek. Antunnez se mu pomstí tak, že unese jeho botanika. MacGyver se již brzy dozví, že uneseným botanikem je jeho stará přítelkyně Michelle "Mike" Forresterová. Kdyby tak věděl, do čeho se vlastně namočil...

Angus MacGyver s Peteem se vydávají evakuovat sirotčinec v Asii nedaleko thajských hranic vedený katolickou jeptiškou a dávnou Peteovou přítelkyní Margaret. S jeptiškou pracuje i Mackova bývalá dívka Debra Eastonová. V zemi jim hrozí nebezpečí, proto musí najít způsob, jak se odtud všichni v pořádku dostanou. Sirotčinec chce zničit muž jménem Chantara. Po jeho prvním útoku sestry odvedou děti do bezpečí. K tunelu, kde se děti skrývají, dorazí záchranný vrtulník. Peter, Margaret a děti úspěšně odletí, ale MacGyver a Deborah se zpozdily a zůstaly zamčeni v kuchyni sirotčince.

Ani během dovolené si MacGyver věru neodpočine. V patách má krutého zločince, který unikl z vězení, na útěku postřelil a zranil vzácného orla a nyní chce zavraždit MacGyvera z pomsty za minulost.

MacGyverovu hluchoněmou přítelkyni a učitelku znakové řeči Carrie Lindenovou sužují děsivé sny a předtuchy, že dojde k celosvětové tragédii, kterou odstartuje krádež nového vojenského naváděcího systému jaderných zbraní. Mack musí prověřit skutečnost a zastavit obchodníky se zbraněmi, kteří systém ukradli.

Je 14. prosince 1987, smutné 25. výročí autonehody, při které zahynul MacGyverův otec a jeho babička. Harry Jackson přichází navštívit svého vnuka - Angnuse MacGyvera. Oba plánují společné chvíle strávit na hokejovém zápase. Jenže Mac si uvědomí, že zapomněl lístky, a tak se po ně vrátí do Peteovy kanceláře v nadaci Phoenix. Při vstupu je MacGyverovi, divné, že jejich ochranka vpustila bez obvyklých bezpečnostních postupů. MacGyverovo podezření se potvrdí, ochranku tvoří členové teroristické skupiny. Do budovy mezitím vnikl nebezpečný zabiják - Viktoria Jamesová, kterou najali teroristé, aby stavbu podmínovala a odpálila. Mac se s Harrym pokusí katastrofě zabránit všemi silami...

Peteova bývalá manželka Connie se synem Michaelem jsou při archeologickém výzkumu v Louisianě uneseni Frankem Bonnerem, bývalým Peteovým kolegou. Bonner viní Petea ze smrti rodiny. MacGyver si uvědomuje závažnost situace, a proto neváhá a okamžitě příteli nabízí pomoc...

MacGyver se infiltruje mezi spiklenců chystajících atentát. Macův nový případ začal ve chvíli, kdy jeho roztržitá přítelkyně Penny Parkerová nastoupila do nového zaměstnání a hned první den se stala náhodnou svědkyní, jak dva muži mučí federálního agenta Roberta Juliana. Agent MacGyver zjistí, že tito dva zločinci jsou členy kolumbijského drogového kartelu. Mac si musí zaskat jejich důvěru a nepatrně se infiltrovat do jejich gangu, aby jim zabránil spáchat chystaný atentát.

Na čerpací stanici přiběhne k MacGyverovi těhotná žena a naskočí do jeho džípu. Jmenuje se Elaine Harrymanová a utíká před svým manželem. Andrew Harryman, bývalý trestanec, zneužíval Elainin dům ke zločineckým aktivitám. Prodával tam drogy, zbraně, plánoval a organizoval loupeže. Elaine má důkazy a chce je předat policii. Harryman se však dozví o manželčině záměru udat ho a chystá se zabít Elaine i MacGyvera, který jí pomáhá. Endrew zažene oba do místního skladu. MacGyver vytvoří horkovzdušný balón, aby mohl vyslat signál o pomoc. Andrew chytí Elaine, ale MacGyver ho zastaví. Policie se sanitkou včas dorazí na místo a Elaine porodí holčičku...

MacGyver a Pete Thornton z agentury Phoenix jsou pověřeni bojem proti moderním pirátům. Vyšetřování začínají výslechem Dr. Barbary Ortegové, poslední oběti pirátů. Barbara se svým týmem našla španělsky potopený poklad. Její loď však napadli piráti, kteří vědcům ukradli nalezený lodní deník španělského kapitána, obsahující klíč k objevení celé flotily a potopeného pokladu v hodnotě 60 milionů dolarů. Mac se rozhodl, že ukradený kapitánský deník pomůže najít. Gar Manning, hlava pirátského gangu, unese Ortegovou, aby jim pomohla najít poklad, a uvězní Maca v potápějící se lodi. MacGyver z lodi uteče a připlouvá na ostrov Goat, kam piráti odešli hledat poklad. Jak se mu podaří vysvobodit Ortegovou a zajmout všechny piráty?

MacGyver a Pete Thornton si užívají zimní lyžování. Jistý muž si s Macem vymění lyžařské hole, ale vzápětí ho zavraždí bývalí přátelé. Smrtící výstřel však vyvolá lavinu, před kterou není úniku a MacGyvera zcela pohřbí. Pete musí přesvědčit záchranáře, aby spustili záchrannou akci dříve, než se spustí další lavina. Když MacGyvera konečně zpod sněhu vyhrabou, první, co uvidí, jsou gangsteři. Jsou u něj a čekají na vzácný obsah lyžařských holí.

MacGyver se zúčastní pohřbu starého známého, agenta Jacka Daltona, ale ukáže se, že Jack je stále živý a zdravý a byl jen součástí tajné operace CIA. Něco se pokazilo a Jack teď musí běžet o život. Jack a MacGyver jdou za Jackovým kontaktem, ale toho mezitím zavraždí. Další Jackův kontakt přezdívaný Stín se skrývá v nočním klubu, ale Jack, MacGyver i Stín odtud jen těžko uniknou po zásahu gangsterů. Bota, kterou ztratil jeden z gangsterů, zavede trio do skladiště patřícímu Stanu Berrengerovi, kterého na místě zatknou a získají zpět ukradený šifrovací stroj.

MacGyver a Pete Thornton se utkají na vrakovišti aut, ale neznámý útočník je překvapí a uvězní ve velkém nákladním autě. Jedinou stopou a záchytným bodem z této situace je nekrolog s jejich jmény a jménem Jacka Daltona. Mac má podezření, že pachatelem může být Murdoc, který je všechny nalákal do pasti. Murdoca se jim podaří zahnat do budovy, která má vybuchnout. Jak mohl Murdoc přežít výbuch a jak mohli Mac s Peteem uniknout z kamionu dříve, než ho Murdoc stihl odpálit?

Ve středoamerické zemi obvinili amerického pilota ze špionáže a postavili ho před soud. Angus MacGyver vyráží do záchranné akce, ale celou situaci zkomplikuje pilotova dcera, která mezitím už také podnikla své vlastní kroky nezbytné pro osvobození otce.

V sídle Phoenix Foundation uspořádají MacGyverovi přátelé velkolepou párty k jeho narozeninám. Překvapený a zaskočený Angus MacGyver si vzpomíná na své zážitky z cest, misí a na staré přátele, které ve světě získal, a přemýšlí, jestli už nedozrál čas, aby tento způsob dobrodružného života zanechal...

Angus MacGyver trpí ztrátou paměti v důsledku poranění hlavy. Zapomněl i na to, že odhalil bombu pohřbenou během jistého pohřbu. Vrátí se mu paměť dříve, než ji odpálí rafinovaný vrah?

Angus MacGyver s kolegyní - agentkou se vydávají za manželský pár a cestují do socialistického Československa. Chtějí se infiltrovat mezi pacienty psychiatrické léčebny, aby odtud osvobodili politického aktivistu, kterého tam vězní jako nebezpečného nepřítele režimu.