Szinte haza se ér ázsiai megbízatásából, máris új feladata van. Új Mexikóban egy tudósokból álló csoport rekedt egy föld alatti laboratóriumban. A robbanásban megsérült egy tartály is, minek következtében kénsav szivárog a vízzáró réteg felé. Kiderül, hogy a robbanás nem véletlenül történt...

MacGyver Burmában kap új feladatot. Lezuhant egy repülőgép, amin egy nagyon veszélyes mérget szállítottak. A feladat megtalálni ezt a mérget 24 órán belül. Semmi sem mehet akadálytalanul, Mac éppen egy ópiumföld kellős közepén találja meg a mérget...

MacGyver Magyarországra megy, hogy találkozzon egy régi kettős-ügynök barátjával, Grotsky-val. Grotsky-nak értékes információi vannak orosz kémekről a zsebórájában. Grotsky-tól egy Yanna nevű cigánylány lopja el az órát, de segít is megtalálni, miután megtudja, hogy mi van benne..

MacGyvert Közép-Amerikába küldik, hogy hozzon haza egy Kate Connolly nevű újságírót. Az újságírónő éppen egy ügyön dolgozik amiben MacGyver segít neki.

MacGyver segít egy politikus lányának visszalopni 60 millió dollár értékű gyémántot..

MacGyver segít Trumbonak és a fiának az Amazon dzsungelben megvédeni az ültetvényét több milliárd hangyától.

MacGyver éppen horgászni indul amikor betér egy kis repülőtér melletti vendéglőbe, ahol fegyveres rablók tartanak fogva egy kis csoportot. Macnek kell kitalálnia azt, hogyan győzzék le a rablókat, és azt, hogy miként szabaduljanak ki..

MacGyver meglátogatja két barátját, Billt és Laurát, akik egy távoli kis földön olajkutat ásnak. Mac rendkívül szabálytalanul megpatkol egy biztosítékot, aminek hatására még aznap este a kút kigyullad, majd a ferro- és ferrimágneses anyagokról szerzett ismeretei segítségével helyretesz egy bokaficamot. Mac és Bill elmennek egy bányába dinamitért, de az égő kútig még elég rázós út áll előttük.....

MacGyvert ezúttal egy tanú védelmével bízzák meg. Frank Benett elmegy Mac-hez, de elrabolja a testvére Joey. Frank Joey ellen akar tanúskodni egy drog ügyben. A testvérek édesanyja haldoklik, és el akar búcsúzni Franktől, de Joey ezt csak akkor engedi meg neki, ha elmegy a családi házba. Mac elmegy vele, és együtt sikerül kiszabadulniuk Joey kezei közül.

MacGyver felrobbant egy atomreaktort, ezért meg akarják ölni. El kell bújnia, de nem engedi, hogy a szövetségiek rejtsék el. Meglátogatja a régen nem látott nagyapját, de itt is megtalálják...

MacGyvert egy koporsóban hozzák ki egy német táborból. Fő epizód: A német akció után Mac-et elviszik egy biztonsági házba, de kiderül, hogy közel sem biztonságos, sőt, fogságba esnek. MacGyvernek sikerül meglépnie, de Pete-t elfogják, ezért visszamegy.

MacGyvert felhívja egy régi ismerőse, amikor rájön, hogy uránt lopnak abból az atomerőműből, ahol dolgozik. Amy szobatársát felrobbantják, mert összetévesztik vele. Mac-et és Amy-t bezárják egy radioaktív hulladékok sugármentesítésére szolgáló kamrába. MacGyver pedig sikeresen levizsgázik emberismeretből, majd helyreállítja a reaktor hűtőrendszerét egy revolver segítségével.

MacGyver összeáll egy régi háborús cimborájával Charlie-val, hogy hatástalanítson egy bombát a Victoria nevű hajó fedélzetén, amin 1100 utas van. Figyelmeztetésképpen már felrobbantották a kapitányt, mire ők odaértek. Az első bomba hatástalanításánál Charlie meghal, de utolsó szava a bomba hatástalanításának titka volt...

MacGyvernek fel kell fednie egy kém azonosságát az ügynökségen belül, aki felelős négy ügynök haláláért.

MacGyver megpróbál kicsempészni Bulgáriából egy mikrofilmet, de a határon találkozik egy amerikai szépséggel, aki a zsebébe rejt egy ékszerekkel teli zsákocskát. A rendőrség észreveszi és őrizetbe helyezi őket, ahonnan sikerül megszökniük ugyan, de a csomagjaikat - ezzel együtt a mikrofilmet is - elvették....

Afganisztánban lezuhan egy katonai műhold, és MacGyver küldik oda, hogy hozza el a benne levő adatokat. Menekülés közben megsérül a válla, de egy afgán fiú és az édesanyja megmenti a Vörös Hadseregtől.

Egy tizenéves számítógépzseni lánynak sikerül feltörnie a Pentagon biztonsági rendszerét, és hozzáférnie egy bizonyos Kígyószem projecthez. MacGyver segít neki, de elrabolják tőle. A lány elárulja fogvatartóinak, hogy hogy tudják működtetni a Kígyószemet. Sikerül megszöknie és MacGyverrel közösen hatástalanítják a rakétákat, amiket a Kígyószem működtet.

Indiaiak térítik el azt a vonatot amin éppen MacGyver utazik. A banditák két ember keresnek, akik gyógyszer helyett mérget adtak el nekik.

MacGyvert egy misszionárius orvos kiszabadításával bízzák meg. Az orvost egy szigorúan őrzött börtönben tartják fogva. Miután sikerrel kiszabadítja, kiderül, hogy nem orvos, hanem fegyverkereskedő. A fegyvereket végül sikerül megsemmisíteni, a fegyverek árát pedig egy árvaháznak adományozzák.

MacGyver Pete után megy Oroszországba, és segít neki kiszabadítani Alexandert, az orosz Nobel-díj jelöltet egy elmegyógyintézetből. Alexander lánya is veszélybe kerül, de nem érdekli, segít MacGyvernek és Pete-nek kiszabadítani Alexandert.

Az ügynökség egy bérgyilkost keres, akinek Piedra a neve. Miután megtalálják és letartóztatják, MacGyvert állítják a helyébe, hogy fedje fel Piedra megbízóját. Piedra megszökik és meg akarja ölni az érseket...