Sam, Alex et Clover enquêtent sur le phénomène Ricky Mathis, une toute nouvelle pop star dont les fans agissent de façon vraiment curieuse.

En arrivant au quartier général de l'organisation secrète Woohp, Sam, Alex et Clover apprennent que Jerry a pris sa retraite et qu'il est remplacé par Mac Smit.

Epuisées par leurs continuelles missions d'espionnage, Sam, Alex et Clover sont agréablement surprises lorsque Jerry leur offre un séjour à Hawaii.

Un homme machiavélique remonte le temps afin de modifier le cours de l'Histoire. Sam, Alex et Clover se lancent à ses trousses pour l'en empêcher.

Un sinistre fabricant de jouets répand dans le monde entier des jouets qui prennent le contrôle de l'esprit des adultes et les font retourner en enfance. Dans la sous-intrigue, Clover essaie de se comporter d'une façon un peu plus mature pour que Rick, un élève d'une classe supérieure, s'intéresse à elle...

Sam sauve la vie de Mandy lors du cours d'art plastique. Celle-ci lui voue alors une reconnaissance éternelle, au point de vouloir devenir sa meilleure amie.

Jerry convoque les Spies, les accusant, enregistrement vidéo à l'appui, d'avoir braqué une banque. Le trio est immédiatement incarcéré...

Des savants sont kidnappés. Chargées de l'enquête, Sam, Clover et Alex découvrent que le père d'un élève de leur école est à l'origine de ces enlèvements.

Alors que Clover et Mandy se disputent le prestigieux titre de miss Top Branchée, les Spies enquêtent sur la disparition de plusieurs top modèles.

Sam, Alex et Clover participent à une émission de téléréalité pour tenter de découvrir la vérité sur la disparition mystérieuse de plusieurs candidats.

Un informaticien configure son ordinateur afin qu'il nuise à ceux qui l'ont persécuté autrefois. Sam, Clover et Alex tentent d'arrêter cette machine infernale.

Clover et Mandy se disputent le titre de reine du lycée. Au même moment, dans une contrée africaine, des malfrats agressent Tassara, la reine de Lyrobie.

Un individu de petite taille ne supporte plus les moqueries. Pour se venger, il invente une machine à rétrécir les gens. Clover en est victime.

Les Spies enquêtent sur des enlèvements perpétrés par des extraterrestres et sur une organisation secrète, tandis qu'Alex passe son permis de conduire.

Il se passe d'étranges phénomènes sur une île perdue au milieu des océans. Les Totally Spies y sont envoyées pour percer le mystère...

Alors que Sam et Mandy participent à un concours d'orthographe, les Spies doivent affronter des pom-pom girls sans scrupule et leur impitoyable entraîneur.

Sam, Alex et Clover, remplacées par trois anciennes espionnes du Woohp, découvrent rapidement que le trio de choc cache de bien mauvaises intentions.

Sam craque pour un nouvel élève du lycée, mais elle découvre bientôt qu'il se sert d'elle afin de subtiliser à l'armée un sérum d'invisibilité gardé secret.

Les Spies sont à la recherche d'un bandit qui a inventé un appareil capable de capturer les champions des sports extrêmes pour les propulser dans un jeu vidéo.

Sam, Alex et Clover affrontent Lumière, un réalisateur dément, qui a enlevé les plus grandes stars du cinéma pour les obliger à jouer dans son prochain film.

Un fabricant de biscuits met au point un produit dont la consommation engendre une rapide obésité. Sam, Alex et Clover tentent de neutraliser le malfrat.

Sam redoute que ses premiers cheveux gris compromettent ses chances de gagner le prix du concours de la Jeunesse qui se tient à Beverly Hills.

Dans les centres commerciaux des plus grandes villes du monde, les gérants d'une chaîne de boutiques kidnappent leurs clients et les transforment en terroristes.

Un sinistre individu projette de geler complètement la planète et ainsi retourner à l'ère glaciaire pour effacer les dégâts causés à l'environnement.

Un bandit remplace les grandes figures de ce monde par des animations afin de transformer la planète en un gigantesque et dangereux parc d'attractions. Sam, quant à elle, affronte sa peur des sports extrêmes...