קלובר, סם ואלכס לומדות יחד וגם מרגלות לטובת ארגון ביון. הפעם הן מסכלות את מזימתו של סבסטיאן, נגן גיטרה לשעבר, המתכנן להשתלט על העולם ע"י הפנוט ההמונים דרך שיריו של כוכב הרוק ריקי מאתיס.

הבנות שבות ממשימה ומגלות שאת מקומו של ג'רי ממלא מק סמית. כשהבנות כמעט משלמות בחייהן במשימה אליה מק סמית שולח אותן, הן מגלות דברים מפתיעים על הבוס החדש שלהן. בהמשך הן משוגרות לחלל, שם הן מוצאות את ג'רי.

הבנות נשלחות לחופשה בהוואי. בהגיען למקום, הן נתקלות במקרי היעלמות משונים המובילים אותן למעמקי הר געש מקומי, שם הן מתעמתות עם הייפסטוס, הזומם להציף את העולם בלבה.

הבנות חוזרות לימי הביניים בחיפוש אחר גנב נשק מתוחכם שמצא דרך לחזור בזמן.

כשאנשים בכל רחבי העולם מתחילים להתנהג כילדים, מגלות הבנות שהאשם הוא יצרן הצעצועים, קוזירב, המבקש להפיץ בובה חדשה שפיתח, ולכן מחזיר את כל האנשים לילדותם.

הבנות מסכלות ניסיון של מדען ימי מתוסכל להשתמש ביצורים שהמציא כדי ליטול את זיכרונות כל מדעני העולם. הפעם עליהן גם להיפטר ממנדי, שמתוך נחישותה להיות חברה של סם, היא נצמדת אליה לכל מקום שהיא הולכת.

כפילות בדמותן של המרגלות מבצעות שוד בנק. ג'רי מנסה לכלוא את המרגלות ולהשתיל במוחן שבבים נגד אלימות, אך הן נמלטות כדי להתחקות אחר האמת.

קלובר וסם מסתכסכות כששתיהן חושקות באותו תפקיד בהצגה. הבנות חוקרות את היעלמותם של מדענים זוכי פרס נובל, ומגלות שהאשם הוא שגריר זר שבנו עבר ללמוד בבית ספרן זמן קצר קודם לכן.

אחרי פגישה עם דוגמנית צמרת, קלובר נחטפת והבנות חודרות לסוכנות דוגמנות בה מנצלים את הדוגמניות בדרכים החורגות מן המקובל. סם ואלכס גוברות על סוכני הרשע ומשחררות את קלובר ואת שאר הדוגמניות.

המרגלות משתתפות בתכנית נוסח הישרדות כדי לחקור היעלמויות של מתחרים בתכנית. עד מהרה הן מגלות שהקרב המדומה בתחרות הוא בעצם די אמיתי. אלכס מתמודדת עם בריונית בבית הספר.

הפעם נשלחות המרגלות לעצור פריק שמסית את מחשבו האישי כנגד כל מי שפגע בו. הבנות מתגייסות למנוע השמדה המונית. קלובר מנצלת לרעה את מעמדה בבית הדין לתלמידים.

הבנות נשלחות לאפריקה למשימת הגנה על מלכה צעירה שעברה ניסיון חטיפה בנשק חדשני. קלובר, שמנסה להיבחר למלכת השכבה, מתקשה לנהל את מסע הבחירות שלה מאפריקה.

נוכל בעל תסביך נפוליאון משתמש במכונת ההקטנה שלו כדי למזער את העולם. קלובר, שמתכוננת לקראת פגישה חשובה, חייבת לחזור לגודלה המקורי לפני הפגישה.

המרגלות חוקרות שורה של חטיפות בידי חייזרים המתרחשות ברחבי העולם. אלכס מתכוננת למבחן הנהיגה שלה.

מעצבת אופנה מרושעת רוקמת תכנית מפלצתית לשילוב גנים אנושיים עם גנים של בעלי חיים. קלובר נופלת קורבן לתכתיבי האופנה כשהיא מתייסרת בנעלי פלטפורמה מענות כדי לצאת עם בחור גבוה.

המרגלות נאבקות בקבוצת מעודדות מרושעות ובמאמנת המרירה שלהן. סם ומנדי מתחרות בחידון איות.

המרגלות מוחלפות בשלישיית מרגלות שפרשו ועתה חוזרות לפעולה. קלובר, סם ואלכס מגלות עד מהרה שכוונותיהן של המרגלות הוותיקות אינן טהורות.

סם מתאהבת בתלמיד בבית הספר, אך מגלה שהוא משתמש בה כדי לגנוב נסיוב היעלמות סודי ביותר מן הצבא. הבנות מחליטות שהן אינן מבלות די זמן יחד, ומתכננות סוף שבוע של נופש בפאלם ספרינגס.

נוכל יוצר מכשיר הלוכד כוכבי ספורט אתגרי ומשלב אותם במשחקי מחשב. אלכס מתאהבת באליל נוער שמתגלה כאישיות ממוחשבת.

המרגלות נלחמות בנבל שחוטף כוכבי קולנוע כדי להשתמש בהם בסרט פעולה מסוכן ביותר. סם זוכה בתואר "התלמידה הפופולארית" בספר המחזור, וצריכה להתמודד עם החיים באור הזרקורים.

יצרנית עוגיות מרושעת יוצרת עוגיות משמינות במיוחד. קלובר מסרבת לחבוש כובע שלא נראה לה לפי מידתה.

שורת חטיפות קניונים ברחבי העולם מובילה לייצור טרוריסטים מתנגדי צריכה. אלכס מואשמת בגניבה מחנות.

המרגלות יוצאות בעקבות גנב חפצי אמנות, ופוגשות קוסם שאמור להיות מת. המרגלות מאשימות את מנדי בחבלה בפרוייקט הצילום שלהן.

נבל מתכנן להקפיא את העולם ולהחזיר אותו לעידן הקרח, כדי למחוק את הנזק שבני האדם עוללו לסביבה. קלובר מתמודדת עם המוניטין שלה כבעלת מזג קר.

נבל מתוחכם מחליף מנהיגים עולמיים ברובוטים, בניסיון להפוך את העולם לגן שעשועים ענק ומסוכן. סם מתמודדת עם פחדה מספורט אתגרי.