כאשר רשע קדום חוזר להטיל אימה על יפן, בנו הצעיר של הקיסר נשלח לארצות רחוקות כדי להתאמן בדרכי הלוחם. רק אז הוא יכול להניף את החרב שתביס את אקו.

אקו שולח את הסמוראי בן התמותה לעתיד הרחוק בו אקו שולט בכל. כעת על הלוחם למצוא דרך חזרה תוך שהוא מסתגל לסביבתו החדשה תחת שם חדש: ג'ק.

החיפושית ההרסניות של אקו סוגרות על ג'ק הסמוראי ועל חבורת כלבים ארכיאולוגים, לכן ג'ק מחליט להשתמש בכל דבר ודבר שבידו כדי להגן על עצמם.

בזמן ציד אחר מזון, ג'ק עוזר לכריצ'ליטים הקטנטנים ללכוד וולי שנמלט. אבל ברגע שהם מזמינים אותו בחזרה לכפר שלהם, ג'ק מתחיל לחשוד בחוסר איזון בסדר הניקור.

ג'ק הסמוראי חובר לקבוצת מדענים שבונים בחשאי רקטה כדי לברוח מאקו. כשהם שומעים על מצוקתו של ג'ק, המדענים חושבים על דרך לשלוח אותו אחורה בזמן.

ג'ק נעזר בכישוריה של לוחמת מיומנת לא פחות ממנו עם סוד אפל על מנת למצוא קריסטל עם תכונות קסומות.

ג'ק שומע על באר המשאלות של המלך אוסריק הנמצאת על גבי מגדל המוגן על ידי שלושה קשתים בלתי מובסים ונשבע לחלוף על פניהם.

למרות הפרס של על ראשו, שום צייד ראשים לא מצליח להביס את ג'ק הסמוראי, ועל כן יוצר אקו תמונת ראי של ג'ק כדי להילחם בו.

כשג'ק מגיע לעיר התת-ימית אוקינוס בעקבות שמועות על שער זמן, הוא מתקבל בברכה על ידי תושביה החייזרים, הטריצראקינים. ומגלה שמדובר מלכודת של אקו.

לאחר שעשה את דרכו במערה מלאה במלכודות, ג'ק הסמוראי מתמודד עם מפלצת לבה ענקית שהייתה לוחם ויקינגי בימים עברו.

ג'ק חוצה גשר חבלים אינסופי כשהוא פוגש מבוקש אחר: הסקוטי. לאחר שנלחמו זה בזה, הם נאלצים לעבוד יחדיו כאשר ציידי ראשים מגיעים למקום וכובלים אותם זה לזה.

ג'ק הסמוראי מצטרף לכנופיית מאפיונרים כדי שיוכל להתקרב לאקו. החבורה מתכננת לגנוב משהו שאקו לא הצליח להשיג: תכשיט נפטון האגדי.

כשג'ק הסמוראי הפך לגיבור עם פופולרי בקרב ילדים קטנים, אקו מחליט להפיץ סוג משלו של אגדות שיעמידו את ג'ק באור רע.