Alan, nel sistemare la parabola della tv, cade e si procura diverse ferite per cui è Charlie a doversi occupare di Jake. La serata diventa subito molto movimentata per tutti e tre.

Jake viene sospeso da scuola e Alan prova a chiamare Charlie perché vada lui a riprenderlo, essendo impegnato con un paziente, ma il fratello, in compagnia, non risponde nemmeno. Il giorno dopo, per fare ammenda, decide di aiutare Alan al suo studio ma finisce col trasformarlo in un bordello

Alan confessa a Charlie di uscire da qualche settimana con Judith e di aver taciuto la cosa a Jake per non dargli false speranze. Charlie chiama allora Evelyn e Rose per farlo desistere, ma Alan torna a casa di Judith e ci passa la notte, per poi scappare in mutande per evitare Jake.

Berta chiede ospitalità per alcuni giorni e Alan, senza interpellare Charlie, acconsente per affermare la sua autorità. Pur di rimanere, Berta li aizza uno contro l'altro e Alan arriva a decidere di andarsene. Alla fine implora il fratello di rimanere proprio quando Charlie aveva deciso di farli rimanere.

Charlie allontana una ragazza che dice di amarlo e insegna anche a Jake il suo credo, sollevando l'ira di Alan. Seguendo il consiglio di Rose, Charlie tenta quindi di risolvere i problemi che ha con sua madre così da riuscire a creare una relazione duratura, ma non ci riesce. Charlie, alla fine, grazie a Rose riesce a recuperare la sua virilità grazie all'ipnosi.

Charlie frequenta Isabella, una ragazza appassionata di occultismo, e quando rompono a causa di Alan, che crede che lei abbia una cattiva influenza su Jake, sulla casa sembra essere caduta una maledizione. Per risolvere la situazione interviene qualcuno di ancora più spaventoso della ragazza: Evelyn.

Al compleanno di Rose, Charlie si ubriaca e i due finiscono di nuovo a letto insieme. Il giorno dopo, il padre della ragazza, Harvey, si presenta a casa di Charlie chiedendogli che intenzioni abbia con lei. All'incontro intervengono anche Rose ed Evelyn; Harvey si invaghisce della madre di Charlie andando a vivere a casa sua. Rose, parlando col padre, rivela che lei e Charlie non hanno fatto sesso e, alla fine, la madre di Harvey gli ordina di tornare a casa.

Norma, la vicina di Charlie, fa la conoscenza di Alan e i due entrano subito in confidenza; dopo averla accompagnata ad una serata, la donna gli propone di investire nella sua professione, data la sua ricchezza, in cambio di una notte di sesso. Alan chiede quindi consiglio a Charlie e alla fine, dopo avergli regalato un orologio costosissimo, cede, ma dopo aver fatto sesso la donna muore. Charlie gli confessa infine di aver fatto anche lui sesso con la donna in cambio di un favore: il suo pianoforte.

Alan invita la famiglia a cena per comunicare loro che un giornale locale ha fatto un'intervista su di lui, ma venendo denigrato come sempre si ubriaca: decide quindi di non essere più vittima del suo senso di insoddisfazione e di sottomissione nei confronti soprattutto delle donne e Charlie si offre di aiutarlo. I risultati, tuttavia, non sono molto incoraggianti.

Alan passa la notte con la sua insegnante del corso di cucina, Sandy: questa si rivela una casalinga perfetta ma Charlie mette in guardia il fratello dal cominciare una relazione duratura. La donna tuttavia prende tutti per la gola grazie alle sue abilità culinarie finché a Natale non dimostra di essere un po' instabile. Alan tuttavia viene fregato con una notte di sesso.

Alan è colto da crisi di panico perché Jake comincia ad essere sempre più indipendente e Charlie, che si trova a rimanere con lui, racconta le disavventure causate da questo alla psicologa.

Charlie si vede ancora con Mia, che lo convince ad andarci piano. L'uomo sente molto presto la mancanza del sesso e le chiede il permesso di andare con altre donne, cosa che la fa infuriare; tenta quindi di scusarsi, ma Mia persegue nelle sue idee e Charlie se ne va. La sera stessa, tuttavia, Mia si presenta a casa sua e si riappacificano.

Kandi, una ragazza con cui Charlie è stato, torna a casa sua quando è con Mia e la donna le chiede di liberarsene, ma data la sua condotta se ne va infuriata. Alan, che è intervenuto per aiutare il fratello, comincia lui a frequentare la ragazza, venendo scoperto da Judith. Charlie e Mia hanno un rapporto sessuale per la prima volta e la donna gli rivela di amarlo per quello che è in realtà e non per quello che possiede o per la sua fama; la relazione tra Alan e Kandi è invece all'opposto, con grande gioia del primo.

Charlie promette a Mia di fare una vita sana, ma ben presto gli diviene impossibile. I due, dopo che la ragazza riceve la benedizione di Evelyn, vanno a cena ma qui la donna scopre che Charlie le ha mentito sul suo nuovo stile di vita: l'uomo grida quindi pubblicamente il suo disappunto e passa due giorni a Las Vegas. Quando si reca all'appartamento di Mia per chiederle scusa, scopre che si è trasferita a New York per lavoro e si ferma dalla sua coinquilina Ginger, molto simile a lui.

Si avvicina il compleanno di Jake e Alan teme che, vedendo Kandi alla festa, Judith gli darà il tormento. La ragazza lo rassicura e i due si presentano insieme al party, che però si rovina perché Jake, cercando delle vitamine nello scaffale del padre, assume del Viagra.

Charlie e Alan incontrano Archie, conoscente del primo anche lui autore di jingle, che li invita a partecipare alla consegna del premio che ha già vinto molte volte dato che Charlie, mai vincitore, è stato candidato. Rose intanto chiede a Charlie di parlare al suo ragazzo Gordon per avere più spazio. Charlie e la famiglia partecipano alla premiazione ma Archie vince ancora, riuscendo per di più a rimorchiare Evelyn. Charlie infine aiuta Rose e Gordon.

Charlie mette in guardia Alan poiché Kandi, prima o poi, comincerà a chiedergli soldi e la cosa capita puntualmente. Alan si trova rapidamente in ristrettezze ma Charlie riesce a guadagnargli tempo per gli alimenti di Judith. Alan, infine, decide di invitare Kandi a vivere con lui per risparmiare.

Charlie rimane molto contrariato dal fatto che Kandi si sia trasferita a casa sua senza essere informato, ma rimane ancora più scioccato dal fatto che, secondo la ragazza, Alan è un amatore migliore di lui. L'uomo l'assume come centralinista, ma dopo una giornata d'inferno Kandi esce con Judith; le due rientrano ubriache e Kandi decide di licenziarsi e andare a vivere con Judith. Charlie infine riceve la visita della attraente madre di Kandi, in cerca della figlia.

Alan, per risollevare la situazione con Kandi, chiede aiuto a sua madre Mandy, che ora frequenta Charlie. Si reca poi a casa di Judith, dove incrocia il suo nuovo compagno, il padre di Kandi Andy. Alla fine Mandy e Charlie rimettono le cose a posto tra Kandi e Alan, ma quando Judith, in compagnia di Andy, li trova nell'idromassaggio di casa sua sbatte fuori i due e anche Kandi.

La maestra di Jake, Francine, convoca Alan e Judith per spingere il bambino verso alcune attività extrascolastiche e la scelta ricade sul musical. Alan confessa quindi a Charlie di essere uscito con Francine, con la quale comincia una relazione platonica dati i molti interessi in comune. Alla fine, tuttavia, Francine scopre che Alan e Kandi stanno insieme, sebbene solo dopo aver dato a Jake il ruolo di protagonista nella recita scolastica.

Jake partecipa alla sua prima festa con ragazze e Alan e Charlie cercano di fargli entrambi da maestri, ma Alan si rende conto di essere del tutto impreparato, a differenza del fratello. I due lo portano quindi a farsi i capelli e a fare shopping e Charlie lo guida passo passo durante la festa tramite il cellulare, riuscendo nel contempo a far colpo su una cameriera che aveva adocchiato Alan, preferendo però farsi dare il numero anziché uscirci la sera stessa per poter aiutare il nipote. Jake, grazie ai suoi consigli, riesce a baciare la ragazza che gli piace. Alan confessa a Charlie di invidiare Alan perché il fratello non l'ha mai aiutato come sta facendo con Jake quando aveva la sua età.

Mia torna in città e invita tutti al suo spettacolo; Charlie inizialmente non vuole rivederla ma alla fine cede. Dopo lo spettacolo i due si rivedono e Mia gli chiede il suo seme per rimanere incinta. Charlie alla fine rimane affascinato dall'idea della paternità e, dopo averle detto di non aver depositato il suo seme, chiede a Mia di sposarlo e lei accetta.

Charlie comunica la sua decisione di sposare Mia alla famiglia e a Rose, che si è appena lasciata e che rimane sconvolta dalla notizia. La cena tra le due famiglie va malissimo e la sera Rose va a far visita a Mia. Per evitare diversi problemi, Charlie e Mia decidono di sposarsi a Las Vegas ma discutono sulla permanenza di Alan e Jake a casa loro e il matrimonio salta, mentre al loro posto si sposano Alan e Kandi.