A USS Enterprise é invadida por uma força alienígena que rouba o cerébro de Spock, fazendo com que Kirk e McCoy entrem em uma corrida desesperada para recuperá-lo.

Aparentemente agindo de forma agitada e irracional, Kirk inexplicavelmente ordena que a Enterprise cruze a Zona Neutra até o espaço romulano, onde ela é capturada e Kirk é levado como prisioneiro para a nave inimiga.

Um misterioso dispositivo alienígena em um planeta com uma cultura predominantemente nativa americana apaga a memória do capitão Kirk, e ele começa a viver com eles como um membro da tribo.

A tripulação da Enterprise resgata um grupo de crianças presas em um planeta, junto com seu perigoso amigo "imaginário".

A Enterprise viaja com um embaixador alienígena que deve ficar dentro de uma mala especial preta porque sua aparência causa insanidade.

Depois de transgredirem as regras de um planeta alienígena, o Capitão Kirk, Spock, McCoy, Scotty e Chekov são forçados a reencenar o famoso tiroteio do Curral O.K., porém eles estão no lado perdedor da disputa.

Uma forma de vida alienígena não corpórea e baseada em energia, que se alimenta de emoções negativas (como medo, raiva, ódio), faz a tripulação da Enterprise entrar em um conflito brutal contra uma nave klingon.

Quando McCoy descobre que está morrendo de uma doença incurável, a tripulação da Enterprise corre para impedir que um asteróide colida com um planeta da Federação, apenas para descobrir que o asteróide é, na verdade, uma nave alienígena disfarçada. Eles descobrem uma civilização interira vivendo dentro da nave que acreditam estar na verdade em um planeta, cujo "Óraculo" proíbe qualquer tentativa para descobrir a verdade.

Ao tentar resgatar a nave estelar USS Defiant, o Capitão Kirk desaparece quando a nave morta é puxada para o interespaço. A Enterprise é então atacada pela espécie local, os tolianos. Os episódios "Em um espelho, escurecido", de Jornada nas Estrelas: Enterprise, servem como continuação deste episódio.

A tripulação da Enterprise encontra uma intemporal e maliciosa espécie de humanóides psíquicos que afirmam ter organizado sua sociedade com base nos ideais da Grécia Antiga.

Alienígenas invisíveis e "acelarados no tempo" assumem o comando da Enterprise para abduzir a tripulação para serem usados como "estoque genético".

Enquanto visitam um planeta condenado, o grupo de desembarque se torna cobaia de experimentos torturosos para testar uma espécie empática.

O Capitão Kirk transporta um princesa mimada que deve levar paz para um sistema planetário em guerra.

O Capitão Kirk visita um hospício e confronta um insano capitão de nave estelar que acredita estar destinado a controlar o universo.

A Enterprise encontra os dois últimos sobreviventes de um planeta devastado pela guerra, que ainda estão determinados a destruir um ao outro abordo da nave.

Uma espécie de alienígenas de um planeta superpovoado sequestra o Capitão Kirk para tentar resolver seus problemas.

A tripulação da Enterprise visita um posto abandonado guardado por um misterioso computador.

A tripulação da Enterprise encontra um humano imortal que vive de forma reclusa em seu próprio planeta.

A Enterprise é sequestrada por um médico criminoso e seus leais seguidores que tentam encontrar o paraíso.

Kirk corre contra o tempo para adquirir minerais para lutar contra uma praga que está infestando um planeta à beira de uma guerra civil.

Alienígenas forçam Kirk e Spock a batalhar vilões ilusórios em um teste de bem contra o mal.

Kirk, Spock e McCoy ficam presos no passado de um mundo ameaçado por uma supernova.

A consciência de Kirk fica presa no corpo de uma mulher que está determinada a matá-lo e assumir o comando da Enterprise enquanto habita o corpo do Capitão.