Enterprise ve vesmíru objevuje neznámé plavidlo využívající pokročilý iontový pohon. Ještě než stihnout plavidlo důkladněji prozkoumat, objevuje se na můstku cizí žena, která ovladačem na zápěstí omráčí posádku celé lodi. Při probuzení volá Dr. McCoy kapitána Kirka na ošetřovnu, protože zde leží pan Spock. Doktor konstatuje, že mu byl vyoperován mozek a kapitán má 24 hodin, aby jej znovu získal, jinak jeho tělo zemře.

Dr. Leonard McCoy zaznamenává v deníku zprávu, že kapitán James Tiberius Kirk se poslední dobou chová velmi podivně, je velmi emotivní a popudlivý vůči své posádce. Na kapitánovi rozkazy se loď ubírá do neutrální zóny u Romulanského impéria, kde je obklíčena trojicí klingonských plavidel, které ovšem využívají romulané.

Enterprise se nachází na orbitě planety velmi podobné Zemi. Loď jde zde pro odklonění blížícího se asteroidu, který má planetu zasáhnout přibližně za dva měsíce. Kapitán Kirk, první důstojník Spock a doktor McCoy jsou na povrchu na obhlídce. Povrch je až překvapivě podobný Zemi se stejnou florou i faunou. Výsadek objevuje zvláštní monolit s neznámými znaky. Poblíž se vyskytuje také vesnice obývaná lidmi velmi podobnými severoamerickým indiánům, avšak jde o vyspělejší směsici Mohykánů, Navajů a Delawarů.

Posádka reaguje na nouzový signál a doráží na orbitu planety Triacus. Zde výsadek nachází mrtvé kolonisty Federace. Vše nasvědčuje tomu, že šlo o hromadnou sebevraždu. Výsadek dále objevuje také skupinku dětí, které si bezstarostně hrají, jako by úplně ignorovaly okolní skutečnost.

Loď má vzít za pasažéra medusanského velvyslance Kollose. Lawrence Marvick, jeden z hlavních konstruktérů Enterprise, ještě jednou upozorňuje, že pohlídne-li na medusana jakýkoliv člověk, v okamžiku zešílí z jejich zrůdného vzezření.

Enterprise se setkává s rasou Melkotianů, rasy pocházející ze systému Theta Kiokis II. Posádka je varována, že narušuje jejich prostor a další upozornění již nebude tolerovat. Kirk úkoluje Uhuru, aby zkusila odeslat Melkotianům zprávu, že Federace má mírový úmysl.

Píše se hvězdné datum 5630.3 a Enterprise doráží na místo, kde stála lidská kolonie Beta XII-A, odkud byl vyslán nouzový signál. Po příletu výsadek nenachází ani stopu po stovce kolonistů. Na orbitě se objevuje klingonská loď, která je ovšem značně poškozená. V tu chvíli je výsadek napaden klingony. Ti berou Kirka a ostatní členy výsadku za rukojmí a obviňují je z poškození klingonského plavidla. Po celou dobu je jakoby pozoruje neznámý blikající objekt.

Loď nachází ve vesmíru zvláštní asteroid s průměrem 370 km, který je ve skutečnosti vesmírné plavidlo se zastaralým atomovým reaktorem. Současně Dr. Leonard McCoy zjišťuje, že trpí smrtelnou nemocí zvanou xenofolicytémie. Oznamuje kapitánovi, že mu zbývá zhruba rok života.

Posádka pátrá po ztracené federační lodi USS Defiant, která se je považována za pohřešovanou. Když loď objevují, na její palubu se transportují kapitán Kirk, první důstojník Spock, vrchní lékař Dr. McCoy a praporčík Pavel Čechov. Na lodi vše nasvědčuje tomu, že zde proběhla vzpoura.

Píše se hvězdné datum 5784.2 a Enterprise doráží na planetu odkud vychází nouzové hlášení, ale která by podle pana Spocka měla být naprosto neobydlená.

Z planety Scalos vychází záznam signálu neznámých obyvatel planety. Při průzkumu výsadek nenachází žádné známky života, ale během sběru vzorků náhle zmizí jeden z členů výsadku. Kirk během výsadku zaslechne zvláštní zvuk připomínající bzukot hmyzu.

Hvězdná loď USS Enterprise doráží na orbitu planety Minara II. Slunce této planety se má zanedlouho přeměnit v červeného obra a pohltit planetu samotnou i s vědeckým týmem Federace, který doposud neodpovídá na žádné volání lodi Enterprise.

Z planety Troyius přichází na palubu vyslanec Petri, který spolu s Kirkem má za úkol dopravit z planety Elas mladou, ale velmi namyšlenou a arogantní Dohlman Elaan, členku královské rodiny Elasu. Elaan se má na Troyiu vdát za troyianského panovníka, aby mezi světy, které doposud vedly válku, vládlo příměří.

Na planetě Elba II se nachází trestanecká kolonie Federace. Kapitán a první důstojník Spock se transportují do kolonie, aby předali nový přípravek pro použití na zbylých patnácti trestancích.

Posádka pod vedením kapitána Jamese T. Kirka míří na planetu Ariannus, kde má pomoci dekontaminovat zamořenou atmosféru. Cestou Enterprise objevuje malý transportní raketoplán Federace, který odpovídá popisu ukradeného plavidla z jedné základny hvězdné flotily. Na palubě je pouze jeden humanoid, muž s doslova černo-bílou tváří.

Enterprise doráží na planetu Gideon, kde má kapitán Kirk absolvovat jednání s koncilem Gideonu, který jej schválil jako jediného návštěvníka. Gideon žije izolovaný život, bez bakterií a nemocí a velmi se obávají infikace z vnějšku.

Posádka objevuje velice mladou planetu jejíž věk odhaduje vědecký důstojník Spock na pouhých pár tisíc let, velikostí odpovídá měsíci, ale váhou Zemi, což je nelogické. Zvláštností je i dýchatelná atmosféra, která by se neměla za tak krátkou dobu existence vytvořit.

Enterprise je zasažena nákazou rigelliánské horečky. Aby nákaza byla zažehnána, je zapotřebí látka zvaná Ryetalyn. Daří se najít planetu, kde se nachází v použitelné formě. Při výsadku jsou však pan Spock, kapitán Kirk a vrchní lékař Leonard McCoy napadeni levitujícím robotem. Na poslední moment se objevuje cizí muž a robota odvolá. Žádá, aby všichni tři opustili planetu a to okamžitě, jinak je bude muset donutit. Kirk se nedá a tak muž, který se představí jako Flint, nakonec souhlasí a dává výsadku dvě hodiny pro získání látky.

Enterprise stíhá kradený raketoplán Aurora, který neodpovídá na volání a při zachycení vlečným paprskem se snaží uniknout do Romulanského impéria. Následkem přetížení motorů je plavidlo zničeno, Scotty na poslední moment přenese všech šest členů posádky a hned po transportu konstatuje, že jde o pěknou chásku.

Kapitán James T. Kirk s posádkou doráží na planetu Ardana pro zásilku zenitu, tamního minerálu, který má být doručen jako pomoc planetě Merak II. Kapitán Kirk odmítá setkání v oblačném městě Stratos a pro urychlení naložení minerálu žádá správce Plasa o setkání přímo u vstupu do dolů, kde má být zásilka připravena.

Kapitán James T. Kirk se ve vesmíru setkává s Abrahamem Lincolnem. Postava sedící v křesle přesvědčuje posádku, že je pravým Lincolnem a žádá o vstup na palubu. Kirkovi je jasné, že jde o cizí postavu, která se za 16. prezidenta USA jenom vydává, ale pro jistotu žádá po posádce, aby k bytosti přistupovala, jako by šlo o opravdového Lincolna.

Hvězdné datum 5943.7. Enterprise doráží k planetě Sarpedion, jejíž slunce se již brzy má stát červeným obrem a planetu zničit. Kapitán Kirk, první důstojník Spock a vrchní lékař Dr. Leonard McCoy se transportují na povrch. Pouze v knihovně nachází pana Atoze, který neustále lpí na tom, aby si každý vybral svůj disk. Zatímco se Spock zajímá o neznámý přístroj, Kirk si prohlíží různé disky, najednou zaslechne křik ženy a vydá se tím směrem. Atoz už jej nestihne zastavit a Kirk projde jakousi branou, která jej přenese přímo do světa mušketýrů. Spock a McCoy se vydají za ním, ale objevují se v mrznoucí pustině.

Loď doráží na planetu Camus II, kde se setkává s Dr. Janice Lesterovou a Dr. Arthurem Colemanem, kteří jako jediní přežili neznámé ozáření. Kapitán Kirk Dr. Lesterovou zná z dřívějška z dávného vztahu, ze kterého odešli oba ve zlém. Kirk se sice domnívá, že doktorka je po zásahu radiace nemohoucí, ale ta náhle ožívá a znehybní ho na přístroji, který je schopen vyměnit vědomí a osobnost mezi těly.