パク師範の勧めにより、アンたちはオマシュまで護衛してもらうため土の王国のフォン将軍の基地へ向かう。最近アンはアバターの境地に達した状態の自分の夢にうなされ、自分を恐ろしく感じているが、フォン将軍はアンに今すぐアバターの境地になって火の王を倒してほしいと頼む。そしてアンをアバターの境地にさせるため漢方茶や祈祷を試すがなかなかうまくいかず、危険が迫らないと境地に達せないと知ると、アンに攻撃を仕掛ける。そしてカタラを土に沈め、アンを怒らせてアバターの境地にさせることに成功する。アンの魂が体を抜け出すとロクが現れ、アンに教えを与える。それは、アバターの境地では最も強くなれるが、その状態で殺されると生まれ変わりのめぐりが壊されアバターは死に絶える、というものだった。

アンたちはチョン率いる流浪の一団と出会う。オマシュヘ向かっていることを話すと、チョンは伝説の恋人たちが作った山の中を通るトンネルが近道だと言う。火の国に襲われるため、アンたちはトンネルを通っていくことにする。しかしそれは、愛を信じなければ永久に出られないという呪われたトンネルだった。サカはトンネルの地図を描いて出口に到達しようと試みるが、一度通った道がふさがれていることに気づく。その時、火がアッパの足に飛び火し、アッパはパニックになって暴れまわる。壁が崩れ、一同は二組に分かれてしまった。アンとカタラがトンネルを２人で進んでいくと、伝説の恋人たちの墓が見つかる。そこには伝説の話が書いてあった。昔２つの敵対する村に住む男女が、村と村の間にそびえる山の頂上で出会って恋に落ち、人目を避けて会うため山にトンネルを作ったという。キスする２人の彫像の傍らには「愛は暗闇で最も光り輝く」と記されていた。

火の国に占領されたオマシュを見たアンたちは、ブミの安否を確認しようと下水道から潜入する。オマシュでは、抵抗軍が火の国に反撃しようと総督一家の命を狙っていた。抵抗軍のリーダーであるヤンは、侵略された時ブミ王が何もせず降伏したことを嘆き、死んでも戦うと気炎を上げるが、オマシュを出て反撃の時を待つべきとアンに説得される。そして大勢の難民たちとともに伝染病のフリをして無事オマシュを出るが、総督の幼い息子トントンも一緒についてきてしまう。抵抗軍に息子を誘拐されたと思った総督は、トントンとブミの人質交換を要求する。

沼地の上空を飛んでいたアンは、沼地が自分を呼んでいるのに気づく。周囲に反対されたためアンは上陸をあきらめるが、突然竜巻に襲われて結局一同は沼地に落ちてしまう。はぐれてしまったアッパとモモを捜し回る。不気味な雰囲気の中、沼地で野宿する３人はツルに引っ張られて離ればなれになる。各々が幻を見て追いかけていくと、沼地の中心部で再会した。その時ツルでできた怪物が現れ３人を攻撃する。怪物を倒すと、中でツルを操っていた男ヒューが出てきて３人を大木のふもとへ連れて行く。ヒューは沼地を守っていると言い、沼地が１つの木でできていること、世界もまた１つであることを語る。アンは、沼の男たちに追われていたアッパたちを救う。沼の男たちも水のベンダーであることが分かり、アンたちは食事をごちそうになる。不思議なことなど起きないただの沼地だと主張するサカの向こうで、ツルがうるさい鳥をはたき飛ばしていた…。

土の王国を旅するアンたちは、チン村で行われている「アバターの日」という記念日の祭りに遭遇する。しかしその祭りはアバターを称えるものではなく、かつて村の君主チン大王がアバター･キヨシに殺されたことを恨み、アバターを呪うためのものであった。トン村長らに責められたアンは、前世の潔白を証明すべく裁判にかけられることになる裁判の日、不利な展開で窮地に陥ったアンがキヨシの格好で登場すると、キヨシ本人が乗り移って事実を語り始める。キヨシによるとチンは征服者であり、住民を守るために殺したという。自分自身に戻ったアンは有罪となり残酷な刑に処されることが決まる。そこへ火の国のモンケ大佐率いる荒サイ騎兵隊が現れ、村に服従を強いるが、アンたちが撃退し村は救われる。村人たちはアンに感謝し、「アバターの日」をアバターを称える記念日に変えることにする。

アンたちは土の国の王国でユー師範の道場のチラシを見て体験レッスンを受ける。金儲け主義のユーを見てがっかりするアンだったが、土のベンダーの強豪が対戦する大会「土の武道会」が行われることを聞きつけ、そこで師匠が見つかるかもしれないと観戦しに行く。現チャンピオンからベルトの奪還を狙うボルダーは、対戦相手を次々と倒し決勝に進む。決勝でチャンピオンとして現れたのは、小さな盲目の少女だった。少女は目が見えないが地面の波動を足で感じ取り、圧倒的な強さでボルダーに勝つ。アンは彼女こそが土のベンダーの師匠にふさわしいと感じ、決戦後の特別試合で少女の前に現れる。少女はアンの気の技であっさり負け、怒って姿を消してしまう。

空腹に耐えながらひとりで旅するズーコは土の王国のとある町へたどり着き、なけなしの金でダチョウウマのエサを買うが、悪党兵士ガオたちに因縁をつけられ奪われてしまう。ガオたちにいたずらしてズーコに助けられた少年リーは、お礼にズーコを家へ連れて行く。家族の絆に触れたズーコは自分の家族を回想する。少年時代のズーコは、優しい母アーサ、火の王アズロンの次男である父オザイ、神童のような妹アズーラと暮らしていた。オザイの兄アイローは土の王国の都バーシンセーを攻め落とそうとしていたが、息子ルーテンを戦で失い絶望に暮れ、都の包囲をあきらめる。野心的なオザイは王位継承権をアイローでなく自分に与えるようアズロンに懇願し、アズロンの怒りを買う。その夜、アーサはズーコに別れを告げて失踪し、アズロンは謎の死を遂げ、オザイは火の王となる。

春になり毛が生え変わっている最中のアッパと共に旅を続けるアンたち。新たにメンバーに加わった盲目のトフは、野宿の準備も手伝わず一人だけ孤立しようとする。カタラは皆と協力するよう注意するが、頑固なトフとけんかになってしまう。その時、不気味な戦車が驚異的なスピードでアンたちを追ってきた。一同はアッパで空を飛びながら逃げる。しかし、アンたちがどんなに逃げても着陸するたびに戦車が追いついてくる。正体を知ろうと待っていると、現れたのはアズーラ、メイ、タイリーの３人組だった。圧倒的な強さを見せる３人との対決は避け、アンたちはアッパに乗って夜通し逃げる。寝不足で疲労のたまった一同はついに不時着してしまい、トフはカタラとアンとの言い争いで腹を立て、一人で去ってしまう。

いよいよ土の技の訓練を受けられることになったアン。喜び勇んで臨むがトフの厳しい指導についていけない。見かねたカタラは、優しく教えるようトフにアドバイスするが、アンはトフに度胸のなさを指摘されますます落ち込む。そんなアンをカタラは、「土」は「気」の対極にあるからマスターするのが難しいのは当然だと言って励ます。その頃サカは猛獣の子供を捕まえようとして、うっかり地割れにはさまれ出られなくなってしまう。運良くアンに発見されたところへ怒った猛獣の親が現れ、ピンチに陥るサカ。まだ土の技を使えないアンはサカ救出に苦戦するが、最後に勇敢に立ち向かい猛獣の親を撃退する。その度胸をトフにほめられ、再び土の技にチャレンジし見事にマスターする。

訓練を頑張っているごほうびとして、プチ・バケーションを取ることにしたアンたち。アンは笛を吹いて演奏を楽しみ、カタラは氷の泉のある町へ行く。リラックスできるだろうという期待に反し、着いたところは砂漠の端にある町。アンたちはゼイというバーシンセー大学の教授と出会う。ゼイと話すうち、彼が砂漠の中にあるという博識の精霊が作った伝説の書庫を捜していることを聞いたサカは、火の国の情報を得るためプチ・バケーションの行き先をその書庫に決める。ゼイと共に砂漠へ入り、書庫の建物らしき先端部分が地上に出ているのを発見する。建物の中に入った一同は広大な書庫で精霊ワンシートンと出会うが、人間は知識を戦いのために悪用するのでもはや立入禁止となっていると告げられる。悪用しないことを誓って何とかごまかしたアンたちは、書物の閲覧を許可される。サカは「火の国史上最悪の暗黒の日」と書かれた書物を発見する。

砂のベンダーにアッパをさらわれ、砂漠に取り残されアンたち。アッパを心配するアンは、砂漠から自分たちが脱出することばかりを考える他のメンバーに腹を立て、一人でアッパを捜しに行く。カタラたちはバーシンセーを目指して日照りの中を歩き出す。のどが渇いたサカはサボテンを見つけて中にたまった水を飲み、幻覚を引き起こしてしまう。トフは乾いた砂の上では土の技が思うように使えず、歩くことすらままならない。アッパを見つけられず戻ってきた不機嫌なアンとともに、一同は疲れ果てるまで歩く。夜になり星図をもとに方角を調べながら歩いていたアンたちは、捨てられた砂の帆船を見つける。コンパスの指す方向へと向かうが、着いたのは磁気を発する巨大な岩で、凶暴なハゲタカバチの巣だった。追ってくるハゲタカバチとアンたちが格闘していると、砂のベンダーたちが現れる。トフはその中の一人の声を聞き、アッパを連れ去った犯人だと気づく。

アッパを失ったアンたちは地図を頼りにバーシンセーまで「大蛇の峠」と呼ばれる道を通って行こうと計画。しかし途中で出会った難民のターンと身重の妻インから、大蛇の峠は険しいので満月湾から出ている船を利用すべきだと聞き、一緒に満月湾へ向かう。港で乗船券を発行してもらったアンたちは警備員として働くスキに遭遇し再会を喜ぶ。だがパスポートを盗まれたインたちは乗船券をもらえなくなってしまう。アンたちは大蛇の峠を通ってインたちを送り届けることにし、サカを心配するスキも同行する。アンたちは苦労しながら峠を進むが、途中で現れた大蛇に攻撃されてしまう。何とか撃退し、峠を越えたところでインが産気づくが、カタラの助産で無事出産。アッパを失って感情を押し殺していたアンは、生まれた赤ちゃんを見て希望を取り戻し、アッパを捜すため一足先にバーシンセーへ向かう。

バーシンセーに着いたアンたち一同は、駅でジョディーという案内役の女性に出迎えられる。サカは早く土の王に会わせてほしいとジョディーに頼むが、彼女はサカの言葉を無視しマイペースで都の案内を始める。そこでアンたちが見たものは、身分ごとに壁で仕切られた、政府によって完全に統制された町だった。アンたちは特別な客として豪華な家に泊まることになるが、王に会えるまで１ヵ月はかかると言われる。仕方がないのでそれまでアッパを捜すことにし、ジョディーに付き添われて人々に聞き込みをして回る。しかし詳しく話を聞こうとするとなぜか皆おびえた様子で黙ってしまうのだった。アンたちの背後にいるジョディーが不気味な笑顔で首を振ったとたんに…。

カタラとトフ、アイロー、アン、サカ、ズーコ、モモ、それぞれのバーシンセーでのお話。トフはカタラをエステサロンへ連れて行く。帰り道、トフは意地悪な女の子たちに化粧をからかわれしまう。商店街でアイローは泣く幼児を見つけ、歌を歌って喜ばせる。動物園で元気のない動物たちを見たアン。飼育係から、設備が老朽化したせいで客が集まらないと聞いたアンは、新しい施設を作ることを提案する。俳句教室の前を通りかかったサカは、女の子の詠む句に聞きほれるうち、うっかり窓から中へ落ちてしまう。茶屋で働くズーコは客のジンからデートに誘われ、アイローの勢いに押されてしぶしぶ出かける。２人は「火の明かりの泉」へ行くが、明かが消えていてジンはがっかりしてしまう。アッパを恋しがるモモは、雲の陰や花をつけた大木をアッパと見間違い、がっかりする。通りでピグミーピューマに追われ、ピューマもろとも衛生局に捕まり屠殺場に送られてしまう。

時は４週間前にさかのぼり、アッパが砂のベンダーにさらわれた後のこと。ギャシュウィン率いる砂のベンダーによって商人に売りつけられたアッパは曲技団に売られる。曲技団ではエサも与えられず調教師から虐待を受け、耐え切れなくなったアッパはテントから飛び出す。砂漠へ戻り書庫のあった場所へ飛んで行くが、書庫は地中深くに埋まっていて成すすべがない。あきらめて飛び立つアッパは、途中数々のトラブルに遭いながらとある納屋へ忍び込む。わずかな水と干草を得て眠りにつくものの、家主に驚かれて納屋を飛び去る。疲れ果てたアッパは森のほら穴に降り立つ。するとほら穴の中からヤマアラシシが現れて取っ組み合いのケンカとなってしまう・・・。

"バーシンセーでアッパを捜すアンたちの前にジェットが現れ、協力を申し出る。しかしじつは彼はロンフェンとダイリーに洗脳され、アンを都から追い出そうとする画策に利用されていたのだった。洗脳状態から覚めたジェットの案内でラオガイ湖の地下にあるダイリーの秘密のアジトへ向かったアンたちは、そこでダイリーと対決。再び洗脳に惑わされたジェットは、ロンフェンに隙を突かれてやられてしまう。ダイリーに取り囲まれピンチに陥ったアンたち。そこへアッパが現れ、ダイリーとロンフェンを一掃。アンたちはアッパとの再会の喜びをかみしめるのだった。"

土の王に真実を伝えることにしたアンたちは、宮殿の衛兵を振り切って中へ乗り込む。王に会ったアンたちはロンフェンの陰謀や戦争が起きていることを話すが、王はなかなか信用しない。ロンフェンの脚についたアッパの歯型や火の国の巨大ドリルを見せ、ようやく王に実情を分かってもらう。ロンフェンは牢屋へ入れられた。ロンフェンが隠し持っていた個人に関する極秘資料が発見され、トフの母親がトフに会いに都へ来ていることが分かる。アンは東の気の寺の導師からの手紙で、アバターとしての次の段階の指導を受けられることを知る。カタラとサカの父親は近くの湾で陣を構えていることが分かった。一同は別行動をとることにし、アンとサカはアッパに乗って飛び立つ。アンとサカが出かけたあと、バーシンセーにキヨシ島の女戦士が参上する。土の王は喜んで歓迎するが、王の前に現れたのは変装したアズーラたちだった…。

アバターの境地をコントロールする方法を学ぶため東の気の寺に向かったアンは、導師パティークの教えに従い７つのチャクラを開く修行を始める。ユーとシンフーに捕らえられ親元に送り返されそうになったトフは、苦心の末に鉄を操る技をマスターして逃げ出す。土の将軍たちと火の国攻撃の作戦を立てたカタラは、立ち寄った茶屋でズーコとアイローを目撃し驚愕する。キヨシ島の戦士になりすましたアズーラをスキと思い込んで助けを求め、捕らえられてしまう。アズーラはバーシンセー支配をもくろむロンフェンと手を組んでいた。６番目まで順調にチャクラを開いたアンは、最後のチャクラを開くためカタラへの想いを捨てようと努力するが、捕らえられたカタラの悲鳴が聞こえ、想いを捨てることができない。途中でやめると修行は台なしになると言う導師を振り切り、父ハコダとの再会を喜んでいたサカとともにカタラを助けに向かう。

カタラの危険を知ってアンたちがバーシンセーへ向かっていく頃、宮殿ではロンフェンから指揮を任されたアズーラが、ダイリーを率いてクーデターの準備をしていた。アズーラはアイローとズーコを騙して宮殿へ誘い、ダイリーにズーコを捕らえさせる。バーシンセーに戻ったアンたちが家へ向かうと、そこへアイローが手助けを求めて現れた。アンたちはアイローと協力してカタラとズーコを救出することにし、バーシンセー旧市街へ向かう。サカとトフは土の王にクーデターの事を伝えに行くが、宮殿に着いた直後にクーデターが始まってしまい、土の王と共にアズーラに捕らわれてしまう。カタラは、同じ牢のズーコが自分と同様母親を失っていることを知る。ズーコの火傷の跡を癒そうとした時、アンとアイローが助けに現れたため治療は中断、アンとカタラは先に外へと向かう。アイローとズーコの前にはアズーラが現れ、ズーコに手を組み戦いに勝利することを提案する。