Lindsay, qui a tiré sur le preneur d'otages Shane Casey afin de protéger sa famille, a reçu une médaille pour son courage. Tous les agents de la police scientifique sont présents à la cérémonie. Jo Danville, nouvelle venue dans l'équipe, en profite pour se rendre dans le labo vide où a été transféré le corps d'une femme retrouvée poignardée. La victime est vite identifiée : c'est une employée qui travaille à l'étage juste au-dessous, dans un cabinet d'architecture. Alors que tout semble indiquer que le meurtre n'a pas été prémédité, une défaillance du système de sécurité survenue la nuit du crime tend à démontrer le contraire...

Alors qu'il est en train de chatter avec une jeune femme, Adam assiste à son meurtre : elle est étranglée par un individu masqué. Adam persuade l'équipe que le meurtre était bien réel. En effet, dans un appartement de Manhattan, il retrouve le corps sans vie de la victime, dénommée Sass. L'équipe remarque qu'il n'y a pas d'ordinateur portable dans l'appartement. Des empreintes relevées mènent à Torrey Powell, son petit ami et un voleur connu des services...

Un couple a été agressé dans sa maison. L'homme a succombé à ses blessures. Son épouse a tout juste eu le temps de se protéger de celui qui a décidé de les violenter : le fils du couple, Billy Travers. C'est en tout cas la version donnée par la survivante. Arrêté, Billy dément énergiquement sa participation. Mac pense que l'affaire est close, car il n'a pas d'alibi. Tout est remis en cause quand la mère du prévenu retire ses accusations. Marvin Foster, qui purgeait une peine de prison à vie et qui venait de s'évader de la prison, a été interpellé la nuit du meurtre, près du domicile des victimes. Il constitue un suspect idéal...

Panthro Torres, le chef du puissant gang El Puño, est retrouvé assassiné. Mac et son équipe doivent à tout prix retrouver le tueur avant qu'El Puño ne veuille se venger et que cela ne dégénère en guerre des gangs. Mac demande de l'aide à Luther Devarro, le fondateur d'El Puño, qu'il a arrêté quinze ans plus tôt et qui vient de sortir de prison. C'est alors qu'une suspecte potentielle est retrouvée morte. Tout semble indiquer que ce n'est pas le fait d'un gang rival, mais bien une opération de «grand nettoyage» interne...

Un homme est assassiné par deux braqueurs professionnels, qui ont dérobé des bijoux pour une valeur de plusieurs millions de dollars. James Belson, qui était chargé de protéger la victime, a été blessé pendant l'échange de coups de feu avec les voleurs. Un des malfaiteurs a été retrouvé mort auprès de l'hélicoptère qui a servi à la fuite du gang. Dans un sac, les experts ont retrouvé une puce électronique destinée à pister les tueurs. Adam, qui sait que deux des truands possédaient un sac, tente de localiser la deuxième puce. Les agents ont la surprise de retrouver la fameuse puce dans la chaussure d'un cadavre, situé dans un immeuble...

Après la disparition de son fils, la mère de Jeremy Harris a reçu un message vocal d'un tueur en série qui lui a donné l'endroit exact où elle pourrait trouver le corps du jeune homme. Elizabeth Harris s'y est aussitôt rendue. Elle n'a découvert que le cadavre d'une autre victime de l'assassin. Celui-ci l'a utilisée pour détruire des preuves sur la scène de crime. Les experts tentent d'analyser le message pour connaître l'identité du manipulateur. Peu de temps après, Elizabeth reçoit de nouvelles instructions. Contre l'avis de son mari, elle décide de les suivre. Les experts s'ingénient, de leur côté, à stopper la série macabre du meurtrier...

Les experts enquêtent sur les agissements d'un tireur embusqué, qui a déjà fait plusieurs victimes. Mac a la surprise d'apprendre que le principal suspect des meurtres, Michael Reynolds, n'est autre qu'une personne qui a été victime d'un enlèvement par le passé et qu'il a secourue. Michael a été identifié grâce à des traces de sang retrouvées sur une scène de crime. Mac ne peut se résoudre à croire qu'il est devenu un assassin. A l'époque du rapt, Michael était un adolescent et il avait beaucoup souffert entre les mains de son ravisseur. Mac décide d'aller interroger les parents du suspect pour tenter de comprendre ce qui a bien pu se passer...

Les experts sont appelés sur le lieu d'une mort suspecte. Une femme a, en effet, été retrouvée dans un secteur de Central Park, dont certains disent qu'il est le théâtre de phénomènes paranormaux. La victime semble avoir été effrayée, suffisamment pour qu'elle succombe à un arrêt cardiaque. Les agents ne détectent aucune marque de traumatisme. L'affaire se complique lorsque Mac découvre un second cadavre dans le parc. Il s'agit aussi d'une femme, identifiée comme étant la soeur d'un chef de la police de New York, Ted Carver. Les indices recueillis sur le corps de la première victime mènent les enquêteurs vers un établissement funéraire...

Une femme a été retrouvée battue et tuée à coups de revolver. Il semble qu'il s'agisse de la même personne qui, quinze ans auparavant, avait volé l'identité de la soeur de Carver. La balle extraite du cadavre a été tirée par une arme que possédait Carver. Ce dernier prétend l'avoir perdue il y a des années, mais n'aurait jamais pensé à faire un rapport. Mac ne croit pas à sa déclaration et mène une enquête serrée. Les experts parviennent à déterminer l'identité de la victime : il s'agit de Marcella Gomez, une immigrée clandestine qui s'est mariée à un homme violent pour obtenir sa carte de séjour. Elle avait utilisé le nom de la soeur de Carver afin de rester dans le pays et échapper enfin aux violences conjugales...

Un clown prépare son maquillage et se l'applique sur le visage. Il croise un homme qui le salue. L'artiste lui rend son bonjour, sort une arme et tire sur l'inconnu. La scène de crime est ensuite dérangée, ce qui complique le travail des experts. Un ancien témoin, qui a été autrefois protégé par le FBI, est suspecté. Pour accomplir son devoir de citoyen, il a dû quitter ses proches. Aujourd'hui, il semble que sa tête ait été mise à prix. Il cherche par tous les moyens à savoir qui lui en veut, quitte à semer des cadavres après son passage. Flack se sent concerné par l'affaire : c'est lui qui avait convaincu le fugitif de témoigner...

Un influent promoteur de club espagnol est retrouvé mort dans son appartement situé en plein coeur de New York. L'affaire prend alors une tournure internationale. Mac va devoir se résoudre à contacter la police criminelle de Barcelone, avant d'engager la plus petite enquête sur cette affaire. L'équipe réalise rapidement que d'un continent à l'autre, les méthodes sont totalement différentes. Alors que Mac considère cette affaire comme la sienne, la police espagnole, de son côté, a beaucoup de mal à suivre l'avis du policier américain et à se laisser déposséder d'un meurtre, certes perpétré sur le continent américain, mais qui n'en concerne pas moins l'un de ses concitoyens...

Les agents enquêtent sur la mort de plusieurs personnes qui se trouvaient dans un véhicule qui a fini sa course tragique dans l'Hudson River. Les experts, en analysant les traces de pneus laissées sur la route, comprennent que l'accident était volontaire. Ils tentent de savoir qui conduisait au moment du drame. Mac tente de déterminer l'identité des victimes. Il cherche aussi ce qu'elles pouvaient avoir en commun. Le meurtrier ne lui a pas facilité la tâche : il a tout fait pour brouiller les pistes. Mac compte sur ses collaborateurs et sur leurs instruments dernier cri pour démêler le vrai du faux...

Mac et son équipe se voient confier une affaire inhabituelle. En effet, un tueur à gages défraye la chronique à New York. Malgré son professionnalisme flagrant, l'assassin a laissé derrière lui maints indices permettant de suivre sa trace. Les experts tentent alors l'impossible pour faire parler les indices et localiser ce tueur. Très vite, l'enquête prend une tournure inattendue. En effet, la traque qui a débuté conforte Mac dans l'idée que cet individu n'est pas un tueur à la petite semaine. Il réalise peu à peu qu'il a affaire à un criminel impliqué dans un complot majeur. S'il aboutissait, il pourrait avoir des conséquences irréversibles...

Un violeur multirécidiviste est assassiné. Il est retrouvé ligoté de la même manière que ses victimes...

Une jeune femme est retrouvée morte dans une ruelle, a priori, victime d'une overdose. Sur place, Mac reconnaît tout de suite Tessa, qui l'avait abordé un an plus tôt pour lui parler d'un meurtre dont elle avait été témoin. Selon les premiers éléments de l'enquête, Tessa a été assassinée. Chez elle, les policiers découvrent un mur couvert de photos et de coupures de journaux. Mac est convaincu que la jeune femme était saine d'esprit et sur une piste. Toutes les coupures de journaux datent du 17 février, qui était le jour de Mardi gras, l'année passée. Un autre article fait référence au Club Vonner. Mac et Flack décident alors de s'y rendre...

Alors que le principal de l'Académie Archford, une école secondaire huppée de Manhattan, fait visiter le bâtiment et vante les mérites de son établissement aux parents d'un futur élève, une toute autre scène se déroule non loin de là. Sexe, drogue et triche sont le quotidien de ces élèves issus de la haute société new-yorkaise. Olivia Prescott, major de sa promotion, arpente les couloirs les mains plaquées à l'arrière de sa tête sur une blessure sanglante. Puis, la jeune fille s'écroule, morte. Appelé sur place, Danny retrouve des traces de sang sur un évier des toilettes à côté duquel gît son sac à dos. Olivia était appréciée de tous et personne n'a la moindre idée de qui aurait pu lui en vouloir...

Un vieil homme entre dans le métro, une boîte de cigares à la main et Ellie, la fille adoptive de Jo, lui cède sa place. Un autre homme, visiblement saoul, l'accoste et le force à sortir de la rame. S'ensuit une bagarre, un coup de feu, et le vieil homme meurt. Mais en guise de vieil homme, la police constate tout de suite qu'il s'agit en réalité d'une femme déguisée. Le mari de la jeune femme ne cache pas sa surprise d'apprendre que cette dernière, une hôtesse de l'air, était à New York alors qu'elle était censée être à Miami. Plus tard, sur la boîte de cigares, Lindsay relève une empreinte qui appartenait à un détenu décédé. Mac décide alors de demander l'aide du FBI...

Un camion-restaurant explose alors qu'il participe à un festival de véhicules de vente ambulante. Sur place, la police constate qu'une bouteille contenant un dangereux explosif a été collée au réservoir de propane du camion. Lors de l'autopsie de la seule victime de l'attentat, le propriétaire du camion, les médecins découvrent qu'il porte d'importantes traces de contusions sur le torse...

Le cadavre d'une très jolie jeune femme est retrouvé en plein coeur de Central Park. Les enquêteurs se rendent sur place pour étudier la scène du crime et font rapidement le lien entre cette affaire et un autre meurtre. En effet, le corps de Macy Martinez avait été retrouvé dans les mêmes circonstances et il semblerait que les deux jeunes femmes aient été étranglées par le même tueur en série. Les policiers retrouvent sous les ongles de la jeune femme du parc une peinture pourpre d'une genre particulier qui les met directement sur la piste d'une collectionneur d'art à Manhattan. Pendant ce temps, un détenu récemment libéré cherche Mac pour se venger...

Un prisonnier tout juste libéré, Raymond Harris, traque Mac dans les rues de New York, muni d'une imposante quantité d'armes. Mac, lui, est au laboratoire, où il discute avec William Hunt, avec qui il faisait équipe à ses débuts. C'est alors que les deux hommes essuient une pluie de balles provenant d'une fenêtre de l'immeuble d'en face. Quand la police arrive sur place, le tireur a déjà pris la fuite, laissant derrière lui son arme, ainsi qu'un certain nombre de preuves compromettantes. Après examen, les indices conduisent les policiers dans un appartement que Harris avait jadis occupé, et où il avait été arrêté pour trafic de drogue, 17 ans plus tôt...

Après s'être retrouvé en joue d'un criminel, à une balle de la mort, Mac n'est plus le même, comme absent. Seule Jo semble s'en apercevoir mais n'arrive pas à tirer les confidences de son chef, encore plus taciturne que d'habitude. Il consent simplement à partager avec elle une de ses obsessions récentes: sa dernière affaire encore non résolue. L'histoire d'un criminel en cavale depuis quelques années, après un braquage sanglant en pleine ville. En compagnie de Don, Mac revient sur les lieux du crime. Peu de temps après, il fait une découverte qui va changer le cours de l'affaire. Ce braquage cachait également un kidnapping. Depuis cette fameuse nuit, la petite Olivia a disparu...