Wir machen da weiter, wo das Finale von Staffel 4 aufgehört hat. Das Team untersucht den Tod einer Frau namens Lauren Santana, die mit dem Banküberfall in Verbindung gebracht wird. Sie ist eine Freundin von Flacks Schwester Samantha. Auch Mac ist dem Räuber entkommen, aber die Leichen stapeln sich immer noch. Das Team muss also schnell den Bankräuber finden, bevor er entkommen kann.

Eine Reihe von Todesfällen durch Strahlenvergiftung könnte mit einem tödlichen Buch in einer New Yorker Bibliothek zusammenhängen.

Als ein angeblicher Air Marshal auf einem Flug in den District of Columbia ermordet wird, sucht Mac im Flugzeug nach dem Mörder und der Mordwaffe.

Das Team untersucht den rätselhaften Tod einer Frau namens Ann Steele. Um den Fall zu lösen, muss das Team nach einer lebensgroßen Silikonpuppe suchen. Als das Team auf die Fabrik stößt, die diese herstellt, ist das für einige im Team sehr amüsant. Währenddessen trifft Hawkes einen alten Studienfreund, der ihn später bittet, einige Beweise in dem Fall zu gefährden.

Das CSI-Team untersucht den Mord an einem Archäologen, dessen geheimes Leben ihn möglicherweise eingeholt hat.

Drei Drogendealer, die vor Gericht stehen, werden an verschiedenen Orten tot aufgefunden. Sie alle wollten Zeugen ihres Verbrechens loswerden, aber es sieht so aus, als hätte jemand sie zuerst erwischt.

Das Team untersucht den brutalen Mord an einem Immobilienmakler, der tot in einem viktorianischen Haus aufgefunden wurde, das er gerade von Staten Island in die Upper East Side verlegen wollte.

In der hundertsten Folge von CSI: NY steht Mac seinem bisher tödlichsten Feind gegenüber. In New York City treibt ein Serienmörder sein Unwesen, der Menschen mit dem Namen Mac Taylor tötet und Mac zur Zielscheibe macht.

Eine Frau wird im Kofferraum eines zertrümmerten Autos auf einem Schrottplatz gefunden. Die Autopsie ergibt, dass sie schwanger war, und das Team muss herausfinden, wer sie ist, um das Baby zu finden.

Das Team ist gezwungen, zwei Verbrechen gleichzeitig zu untersuchen, als ein mysteriöses Energiefeld die Ursache für das Verschwinden eines Milliardärs und den Tod seines Limousinenfahrers zu sein scheint.

Mac trifft auf Ella McBride, die ihn Zeit kosten könnte, um herauszufinden, ob Isabelle Vaughn durch den Verzehr der Wunderfrucht gestorben ist. Stella gerät in Schwierigkeiten mit Mac, als sie einen weiteren Mord untersucht, der mit dem griechischen Diplomaten zusammenhängt, der sie angegriffen hat.

Junge zukünftige Bräute streiten sich beim größten Brautkleidverkauf des Jahres um ein mörderisches Kleid, und eine der Käuferinnen kommt dabei ums Leben. Die ungewöhnlichen Hinweise in diesem Fall zwingen Dr. Hawkes, sich mit einem schmerzhaften Kapitel seiner Vergangenheit auseinanderzusetzen.

Eine russische Touristin wird erstochen aufgefunden und die CSIs werden mit der erschreckenden Realität des Menschenhandels konfrontiert. Die Lösung dieses Falles wird persönlich, als ein prominentes Mitglied des NYPD direkt davon betroffen ist

Als bei einer Wohltätigkeitsveranstaltung die Leiche des stellvertretenden Bürgermeisters zusammen mit Hunderten von Luftballons von der Decke fällt, finden sich Stella und ihre Verabredung inmitten des Tatorts wieder, und Mac bekommt es mit Robert Dunbrook zu tun.

Als ein Bussard, der über Manhattan fliegt, einen menschlichen Augapfel aus seiner Kralle fallen lässt, beginnt ein Wettlauf, um die Leiche zu finden, zu der er gehört, bevor der Vogelsaboteur mit dem Rest des Beweismaterials davon fliegt.

Eine tödliche Rohrbombe sprengt ein Stadthaus in Manhattan und wertvolles Beweismaterial in die Luft. Die Ermittler müssen kreativ werden, um die beschädigten Spuren zu rekonstruieren, die schließlich zu dem Bombenleger führen.

Als die Frau eines ehemaligen Gerichtsmediziners ermordet aufgefunden wird, liefert ein weißes Pulver, das am Tatort gefunden wird, den Ermittlern eine wichtige Spur, die sie auf die Spur des Mörders bringt, als sich herausstellt, dass es sich bei dem Pulver um Heroin handelt, das aus menschlichen Körpern hergestellt wurde.

Als ein Häuptling der amerikanischen Ureinwohner in der U-Bahn erschossen wird, müssen die Ermittler herausfinden, wer von den verschiedenen ausländischen Verdächtigen für seinen Tod verantwortlich sein könnte.

Als Stella die Erschießung eines Gesangslehrers in einem leeren Theater untersucht, stellt sie fest, dass der Tatort seltsam vertraut und inszeniert ist.

Als ein Mann aus 20 Stockwerken in den Tod stürzt und seine Leiche nach dem Aufprall verschwindet, ohne dass eine Leiche gefunden wird, müssen die Ermittler diese seltsame Entwicklung als Vermisstenfall behandeln.

Die exklusivste Juwelenauktion des Jahres endet abrupt, als ein Gutachter während der Veranstaltung getötet wird. Die Ermittlungen nehmen eine emotionale Wendung, als die CSIs mit einer der größten Tragödien in der Geschichte der Menschheit konfrontiert werden - dem Holocaust.

Mac teilt einem Ex-Knacki mit, dass er für ein Verbrechen gesessen hat, das er nicht begangen hat, und Lindsay sagt Danny, dass es Zeit ist, dass das erste CSI-Baby auf die Welt kommt.

Als Stella entdeckt, dass New Yorker wegen antiker griechischer Artefakte ermordet werden, gibt sie ihre Dienstmarke ab, um einer Spur zu folgen, die nach Griechenland führt, und deckt zusammen mit Mac eines der größten Geheimnisse der Geschichte auf.

Bei der Überführung des Sohnes von Robert Dunbrook vom Gefängnis zum Gericht gerät das NYPD in einen Hinterhalt einer Gruppe professioneller Entführer, die ein Mitglied des Teams töten, und das Leben eines der CSI-Mitarbeiter steht auf dem Spiel.