Max nabývá vědomí po transplantaci srdce a zjišťuje, že je zpět v Manticore a že srdce, které má v těle, je Zackovo. Teď, když je laboratoř zničena, se společnost Manticore rozhodla každé X5 najít partnera ke spáření. Max se proto setkává s Alecem, klonem Bena, který nemá sebemenší problém s tím, že s ním Max nechce nic mít. Místo toho Max za pomoci Joshui – napůl psa a napůl člověka – z Manticory opět utíká. Logan, který je v stále v Seattlu, i po třech měsících věří, že Max je naživu, a pomocí Eyes Only se rozhodne odtajnit existenci Manticore, což vede doktorku Renfro ke zničení všech důkazů. Budovu zapálí i s lidmi uvězněnými uvnitř. Max nechce, aby zemřeli, proto se jim rozhodne pomoct. Znovu se setkává s Loganem, jenže mají problém – Max má v těle virus, který ji nutí k zabití Logana.

After months of being imprisoned at Manticore, Max has resisted powerful attempts at re-programming and breeding and plans her escape from the genetics lab. She is aided in her breakout by the gentle but beast-like Joshua, an early Manticore creation, and together they release all the other Manticore creatures. Max attempts to reunite with Logan, only to discover that he is now number one on Manticore's most wanted list.

Logan diffuse un message piraté de Streaming Freedom expliquant en quoi consistent les expériences génétiques du Projet Manticore mises au point dans le but de créer le soldat parfait. Logan fait ainsi le serment de punir les gens responsables. Pendant ce temps là, à Manticore, Max se remémore la torture qu'elle a dû subir et qui l'a mené à se soumettre aux exigences de Manticore. De retour dans sa cellule, Max, lentement mais sûrement, réussit à ôter des parpaings du mur, en vue de s'échapper...

Max gelingt die Flucht aus Manticore, sie ist mit einem Retrovirus infiziert, das für Logan gefährlich werden könnte, wenn sie ihn berührt. Per Videoübertragung verrät sie der Öffentlichkeit den geheimen Standort des Labors. Renfro befiehlt daraufhin die Zerstörung Manticores.

מקס חזרה להכרתה לאחר שהלב שלה הושתל רק כדי להבין שהיא שוב נמצאת במנטיקור ושליבו של זאק פועם בה. גברת אקס או דוקטור רנפרו לוקחת אותה אל מה שנשאר מזאק.

Max újra a Manticore foglya, ezúttal azonban már az első pillanattól fogva a szökést tervezi, hogy ismét karjaiba zárhassa Logant. Nem is sejti azonban, hogy érintése végzetes lehet a férfi számára, a Manticore ugyanis egy speciális vírus hordozójává tette, amely csak Loganre halálos. Közben tenyészpárt is kap, Alecet, aki úgy tűnik, hogy segíthet neki az angolos távozásban. A szökés során Max megismerkedik a kutyaszerű Joshua-val, aki Sandemannek, a Manticore alapítójának első teremtménye. Eközben Logan még három hónap elteltével sem adja fel a reményt és minden eszközzel igyekszik leleplezni a Manticore-t, amiben az S1W nevű mozgalom oszlopos tagja, Asha segíti. Max és Logan csak az első csók után tudják meg a kettős játékot űző Alectől, hogy ellenszer nélkül a férfi életét veszti. Max így kénytelen visszatérni a Manticore-ba, melyet a leleplezéstől tartó Renfro lángba borított. Max végül nemcsak az antiszérumot szerzi meg, de a Manticore valamennyi lakóját is kiszabadítja.

Dopo mesi di prigionia e tortura a Manticore, Max finge di essere stata piegata, solo per mettere in pratica il suo piano di fuga. Zack non è morto, ma tenuto in vita artificialmente per effettuare degli esperimenti su di lui. Grazie all'aiuto di Joshua, un incrocio tra uomo e cane, Max riesce a fuggire ma in realtà è solo un piano di Madame X per eliminare il nemico numero uno di Manticore: Solo Occhi.

Max resiste los poderosos ataques de reprogramación en Manticore, y planea su escape del laboratorio. Allí conoce a Alec, un clon de su antiguo amigo Ben, que murió en batalla. Ella es ayudada en su fuga por la apacible bestia Joshua, una creación de Manticore de humano y ADN animal, que fue mantenido el secreto de la gente común de la organización. Mientras tanto, la obsesión de Logan con destruir Manticore esta siendo lo único en su mente.

Lại một lần nữa trở thành tù nhân ở Manticore, Max lên kế hoạch bỏ trốn cùng đối tác phối giống Alec, sinh vật nữa người nửa thú Joshua