Acht Wochen sind vergangen, seit das Team um Jordan durch Macys Ausscheiden und Woodys lebensgefährliche Schussverletzung völlig auf den Kopf gestellt wurde. Neuer Leiter der Gerichtsmedizin ist Dr. Jack Slokum, für den Jordan und ihre Kollegen nichts als Verachtung empfinden. Doch jetzt bietet sich endlich die Chance, Macy zurück ans Institut zu holen und den verhassten Slokum zu unterwandern: Offenbar hat der verurteilte Mörder Oliver Titleman, der vor kurzem aus der Haft entlassen wurde, erneut einen grausigen Mord begangen. Da es ihm bei seinen damaligen Taten vor allem darum ging, Macy zu imponieren, liegt es nun nahe, diesen wieder ins Boot zu holen und Titleman mit seiner Hilfe eine Falle zu stellen. Dadurch gerät Macy jedoch in akute Lebensgefahr. Und auch für Woody sieht es nicht gut aus: Tommy Riggs, der Mann, der auf ihn geschossen hatte, wird ermordet aufgefunden – mit Woodys Fingerabdrücken an seinem Hals.

In die Pathologie wird die Leiche eines Teppichhändlers eingeliefert. Bug glaubt zunächst, der Mann sei an seinem Hühnchen-Sandwich erstickt, doch dann wird der Fall plötzlich skurril: Bridgette, die glamouröse Frau des Toten, taucht in der Pathologie auf, setzt den Leichnam in Flammen und springt aus dem Fenster. Die Spur führt ins Montecito Ressort & Casino nach Las Vegas, wo Woody auf die Casino-Mitarbeiterin Samantha Marquez trifft. Mit ihrer Hilfe findet er heraus, dass der Tote ein Auftragskiller war und für den Gangsterboss Jimmy Ning arbeitet, den die Polizei von Las Vegas einfach nicht zu fassen bekommt und der bereits seinen nächsten Coup plant: Er will den chinesischen Botschafter töten lassen, da dieser seine Auslieferung nach China fordert. Woody hat alle Hände voll zu tun, um das Attentat zu verhindern – und gönnt sich schließlich eine kleine Auszeit – in der Jordan mit Danny und Woody mit Sam im Bett landen.

In einem Naturschutzpark hat man auf dem Grund eines Brunnens die Leiche eines kleinen Jungen gefunden. Jordan, Macy, Bug und Nigel werden zum Fundort gerufen und machen eine weitere schreckliche Entdeckung: Unweit des Jungen liegt eine weibliche Leiche. Zudem stellt sich heraus, dass zwei weitere Jungen vermisst werden. Obwohl sie schwer erkältet ist, setzt Jordan alles daran, die beiden Kinder auf eigene Faust zu finden. Dabei kommt ihr der Zufall zur Hilfe: Während eines schrecklichen Unwetters fällt sie in einen Schacht, in dem sie die beiden Vermissten, Tod und Danny, entdeckt. Einer von ihnen ist schwer verletzt, und beide stehen Todesängste aus, denn es scheint keinen Ausweg aus diesem Stollen zu geben. Jordan gelingt es zwar, die Kugel aus der Schulter des verletzten Jungen zu schneiden, doch die Wunde hat sich infiziert, der Kleine muss dringend medizinisch versorgt werden. Fieberhaft sucht Jordan nach einem Ausgang, doch vergebens.

Die Frau eines Richters wurde erschossen. Woody und Bug werden zum Tatort gerufen und stellen schnell fest, dass eigentlich der Richter selbst die Zielperson des Anschlags war. Täter ist der gerade aus dem Gefängnis entlassene John Bailey, der sich für seine Verurteilung rächen wollte. Man vermutet, dass Bailey sich im Haus seiner Schwester Marcy aufhält, wo es zu einer folgenschweren Schießerei kommt, die Marcys Ehemann das Leben kostet. Woody leidet wegen des Anschlags auf sein Leben noch immer unter einem Trauma und gibt sich plötzlich als knallharter Cop. Er behauptet, Marcy kenne das Versteck ihres Bruders und nimmt sie deshalb in Untersuchungshaft. Lily dagegen versucht alles, um Marcy zu verteidigen. In der Gerichtsverhandlung kommt es schließlich zu einem Drama: Bailey taucht plötzlich auf, erschießt mehrere Polizisten und nimmt Lily und einen Anwalt als Geiseln. Jordan ist unterdessen einem Skandal auf der Spur.

Eine Frau wird mit einer Kugel im Kopf in ihrem Wagen aufgefunden. Zunächst geht man von Selbstmord aus, doch Jordan findet schnell heraus, dass es sich um Mord handelt. Als auch noch der Sohn der Toten ermordet aufgefunden wird, führt die Spur zu Eli Graham, der ein Therapiezentrum leitet. Zu Jordans Freude hat auch der Journalist J.D. Pollack mit dem Fall zu tun – der Flirt zwischen den beiden kann in die zweite Runde gehen. Während sich Jordan und Pollack bei den Ermittlungen näher kommen, wird die Beziehung zwischen ihr und Woody immer eisiger. Zudem muss sich Woody mit der Polizeipsychologin Lu herumschlagen. Diese erkennt schnell, dass Woody nur aus Angst den harten Cop mimt. Woody ist genervt, kann aber auch nicht abstreiten, dass zwischen Lu und ihm eine gewisse erotische Spannung besteht. Unterdessen stellt sich heraus, dass Graham offenbar ein wahnsinniger Sektenführer ist. Gemeinsam stellen Jordan und Pollack ihm eine Falle, um ihm die beiden Morde nachzuweisen.

In einem Wald wird ein Skelett gefunden. Bei dem Toten handelt es sich um den Lehrer Robert Stockton, der vor zehn Jahren als vermisst gemeldet wurde. Schon bald taucht ein gewisser Brian Healey auf und behauptet, seinen Lehrer ermordet, die Erinnerung daran aber bisher verdrängt zu haben. Woody glaubt seine Geschichte jedoch nicht und nimmt Brian hart in die Mangel, während Lu der Meinung ist, dass der Junge an einem schweren Trauma leidet und erst nach und nach an seine Erinnerung herangeführt werden muss. Es kommt zu einem heftigen Streit zwischen Woody und Lu, doch am Ende klären die beiden den Fall gemeinsam auf. Jordan arbeitet zusammen mit Nigel an einem vermeintlichen Doppelmord. Ein Ehepaar wurde an seinem 26. Hochzeitstag ermordet, indem man beide über die Balkonbrüstung geworfen hatte. Dann taucht jedoch Jeffery Brandau von der Staatsanwaltschaft auf und behauptet, die beiden hätten sich gegenseitig ermordet.

Mehrere Leichen beschäftigen Jordan und ihr Team. Die Morde tragen allesamt die Handschrift der Serienmörderin Ryan Kessler, die jedoch lebenslänglich hinter Gittern sitzt. Jordan und Woody besuchen Kessler, die ihre Hilfe anbietet: Sie will mit ihnen zu einem Ort fahren, an dem sich zwei weitere Leichen befinden. Jordan ist zwar nicht ganz wohl bei der Sache, denn Kessler entwickelt eine Bewunderung für sie, die ihr unheimlich ist, doch sie lässt sich auf Kesslers Angebot ein. Weit kommen Jordan und Woody nicht, denn Kessler gelingt die Flucht – genau wie sie es von Anfang an geplant hatte. Die Morde wurden von einem ihr hörigen Mann begangen, der ihr Briefe ins Gefängnis geschrieben und exakt nach ihrem Plan gehandelt hatte. Als man ihn verhaften will, ist es jedoch schon zu spät: Kessler hat ihn umgebracht. Am Abend erwartet Jordan eine weitere unangenehme Überraschung: Kessler wartet bereits in ihrer Wohnung auf sie.

Woody und Jordan müssen mit ansehen, wie ein Officer im Dienst getötet wird. Lu bittet Woody darum, sich um Jessie, den Sohn des Officers, zu kümmern, da sie einfach nicht an den Jungen herankommt. Unterdessen gerät ein gewisser Robert Radlauer unter Verdacht, Beweise gegen ihn gibt es jedoch nicht. Jessie ist daraufhin so verzweifelt, dass er fingierte Beweise platziert. Die ganze Sache fliegt jedoch schnell auf, und nun gerät Woody unter Verdacht, die Beweise fingiert zu haben. Doch Woody schützt den Jungen weiterhin und riskiert damit alles. In der Gerichtsmedizin taucht eine sichtlich verstörte junge Frau namens Natalie auf und behauptet, einer der Toten sei ihr Mann, den sie sofort mitnehmen müsse. Dann verbessert sie sich und behauptet, der Tote sei ihr Geliebter – und Aliens würden ihn holen kommen. Zunächst gehen alle davon aus, dass die Frau vollkommen verrückt ist, doch dann findet Nigel im Kopf des Mannes ein merkwürdiges Implantat.

In einem Wald wird ein Wagen gefunden, in dem offenbar ein Mord begangen wurde, die Leiche ist allerdings verschwunden. Der Wagen gehört einer gewissen Laura Bennett, deren Schwester Jennifer fünf Jahre zuvor ermordet worden war. Hauptverdächtiger war damals Jennifers Mann Bill Patterson, er musste aber aus Mangel an Beweisen wieder freigelassen werden. Jetzt sieht alles danach aus, als habe er auch seine Schwägerin ermordet. Jordan startet eine intensive Recherche, doch ohne Leiche kann man Patterson wieder nichts nachweisen. Die junge Mutter Kristen Bishop wurde ermordet. Am Tatort finden Woody und Nigel ihren kleinen Sohn, und kurz darauf taucht auch Henry, der Vater des Jungen, auf. Henry verweigert jedoch die Aussage, da er befürchtet, damit auch das Leben seines Sohnes zu riskieren. Denn Bishop wird von seinem Halbbruder, einem skrupellosen Mafia-Boss, bedroht. Als er diesen am Ende erschießt, haben die Ermittler das allergrößte Verständnis.

Jordan und Woody müssen zusammen aufs Land hinaus, wo in einem friedlichen kleinen Dorf ein Mord geschehen ist. Der Tatort ist eine gruselige Pension, in der die beiden Ermittler auf die merkwürdigsten Gestalten treffen. Hier gibt es nicht nur einen schrägen Butler mit Glasauge, sondern auch ein Hochzeitspärchen mit Todessehnsucht und einen ziemlich beschränkten Dorfpolizisten. Und jeder von ihnen erscheint verdächtig. Während Jordan und Woody ihre Ermittlungen anstellen und sich dabei wieder einmal näher kommen, wird auch der Butler mit dem Glasauge ermordet. Schließlich stellt sich heraus, dass die Pensionswirtin Frances vor Jahren ihren Verlobten umgebracht hatte. Sein Skelett befindet sich noch immer im Haus, und jeder, der Frances’ Geheimnis entdeckt, bezahlt mit dem Leben. Bevor Jordan dieser Sachverhalt aber klar wird, steckt sie bereits bis zum Hals in Gefahr. Bug und Lily ermitteln zusammen im Fall des Mordes an einem illegalen Einwanderer.

Ein junger Mann, der seine Freundin kaltblütig ermordet haben soll, steht vor Gericht. Die gesamte Anklage stützt sich auf die Aussage von Macy, doch der wurde am Vorabend wegen Trunkenheit am Steuer von der Polizei festgenommen. Das ist natürlich ein gefundenes Fressen für den Verteidiger des Jungen, der nun alles versucht, um Macy vor Gericht zu diskreditieren. Jordan hält zwar weiterhin zu ihrem Chef, macht ihm jedoch hinter verschlossenen Türen klar, dass er dringend etwas gegen sein Alkoholproblem unternehmen muss. Zusätzlich versucht sie alles, um weitere Beweise gegen den Mörder zusammenzutragen, damit seine Verurteilung nicht allein von Macys Aussage abhängig ist. Ganz nebenbei machen Jordan auch persönliche Probleme zu schaffen: Sie ist mit Woody im Bett gelandet und geht nun Pollack möglichst aus dem Weg. Der wundert sich natürlich über ihr Verhalten und stellt sie zur Rede. Jordan ist hin- und hergerissen: Für wen soll sie sich entscheiden?

Drei erschossene junge Männer geben der Polizei Rätsel auf. Vor allem Macy ist von dem Fall betroffen, denn einer der Toten ist Chad Wasserman, der Freund seiner Tochter Abby. Vor kurzem hatte Macy die beiden noch aus seiner Wohnung geworfen und seitdem nichts mehr von Abby gehört. Nun ist er in größter Sorge um seine Tochter, die spurlos verschwunden ist. In der Zwischenzeit stellt sich heraus, dass Chad einem Drogenring angehörte – und dass Abby vermutlich als Zeugin von Chads Mördern verfolgt wird. Macy kann seine Tochter zwar vor den Mördern finden, gerät dabei aber prompt in Lebensgefahr. Nach einer Rettung in letzter Sekunde führt Macy endlich ein intensives Gespräch mit Abby, in dem er es sogar schafft, sie zu einer Drogentherapie zu bewegen. Das führt auch bei Macy selbst zu einer längst fälligen Erkenntnis: Er ist alkoholabhängig und braucht dringend Hilfe.

Das gesamte Team wird zu einem Großeinsatz gerufen. In einer Bahnstation ist eine Bombe hochgegangen. Es gibt viele Tote und Schwerverletzte. Die Ermittler arbeiten fieberhaft und bis zur Erschöpfung. Für alle Beteiligten ist es ein grauenvoller Tag. Die Behörde beschließt, dass alle Einsatzkräfte den Polizeipsychologen Dr. Stiles aufsuchen müssen, um ihre schrecklichen Erfahrungen zu verarbeiten. Dabei kommen bei allen längst verdrängte Traumata wieder hoch. Macy erinnert sich an Abbys Zwillingsbruder, der bei der Geburt gestorben ist, Nigel erkennt, dass er das Grauen nur durch seine ständigen Witzeleien ertragen kann und Lily bemerkt, dass sie durch das viele Leid schon ganz abgestumpft ist. Eine positive Entdeckung machen dagegen Woody und Lu. Sie erkennen, dass sie ineinander verliebt sind.

Bug platzt fast vor Stolz über sein schickes neues Auto, doch er hat nicht lange Freude daran: Aus dem 15. Stock stürzt ein Mann genau auf sein heiß geliebtes Schätzchen. Der Fall erweist sich als äußerst mysteriös, denn der Tote trägt unter seinem Anzug ein Superman-Kostüm – und wurde, wie die Ermittlungen schon bald ergeben, aus dem Fenster gestoßen. In einer im Gebäude ansässigen Spielzeugfirma, die dem Onkel des Ermordeten gehört, kommen Woody und Lu schließlich dem Täter auf die Spur. Macy, Nigel und Jordan werden mit einem anderen Fall betraut. Bei einem Waldbrand sind sechs Feuerwehrleute ums Leben gekommen. Jordan findet schon bald heraus, dass der Tod der Männer billigend in Kauf genommen wurde, denn ihr Chef hat ein paar einflussreiche Freunde, deren Villen es unbedingt zu schützen galt. Unterdessen bekommt Macy wieder große Probleme mit Abby, die nicht in der Entzugsklinik bleiben will.

Jordan hört in ihrem eigenen Haus Schüsse und findet in der Wohnung über ihr ihre Nachbarin Kayla mit einer Pistole vor. Vor ihr liegt ihr erschossener Vater, doch Kayla war nicht die Täterin. Im Gegenteil: Auch sie ist nun in Lebensgefahr, da ihr Vater in Waffengeschäfte verwickelt war und sie den Täter gesehen hat. Anhand eines Phantombildes gelingt es Jordan und Kayla, den Mörder zu identifizieren. Dieser überrascht Jordan jedoch in ihrer Wohnung, weil er hofft, Kayla dort vorzufinden. Als Kayla schließlich auftaucht, entreißt sie dem Mann die Pistole und zielt auf ihn. Macy und Lily sind unterdessen mit einem anderen Fall beschäftigt: Der Sohn der angesehenen Familie Payton wurde in einem Armenviertel ermordet aufgefunden, neben ihm eine schwarze Frau. Payton Senior torpediert die Ermittlungen jedoch, startet eine Hetzkampagne gegen die Familie der schwarzen Frau und erwirkt eine richterliche Verfügung, nach der das Autopsie-Gutachten seines Sohnes nicht herausgegeben werden darf.

In einem respektablen Vorort lässt eine neu errichtete Anstalt für Geisteskranke die Gemüter höher kochen. Als die Jugendliche Sarah Burdick ermordet wird, steht für die Einwohner deshalb fest, dass nur einer der Patienten der Täter sein kann. In Verdacht gerät der junge Nate, der während seiner Freigänge im Garten der Burdicks gearbeitet und sich mit Sarah angefreundet hatte. Selbst Woody ist nicht frei von Vorurteilen und davon überzeugt, dass der Schizophrene das Mädchen ermordet hat. Der Täter ist jedoch weder Nate noch einer der anderen Insassen der Anstalt … Jordan hat sich dazu entschlossen, die kleine Kayla, deren Vater vor ihren Augen erschossen wurde, zu adoptieren. Unter ihren Kollegen stößt diese Entscheidung nicht gerade auf große Begeisterung, da niemand Jordan diese schwierige Aufgabe zutraut. Jordans Pläne werden jedoch ohnehin über den Haufen geworfen, als Kaylas totgeglaubte Mutter Lori auftaucht. Diese hat ihre Drogenprobleme mittlerweile in den Griff bekommen.

Jordan und Lu bearbeiten den Fall der jungen Shannon, die behauptet, von dem berühmten Baseballspieler Quentin Baker vergewaltigt worden zu sein. Ihre Aussage steht jedoch auf wackeligen Beinen, da Shannon als äußerst flatterhaft gilt, unter starkem Alkoholeinfluss stand und nach der Tat mit ihrem Freund geschlafen hat. Es kommt zu einem Streit zwischen Lu und Jordan, weil Jordan dem Mädchen unbedingt Glauben schenken will und wegen der aufkeimenden Beziehung zwischen Woody und Lu ohnehin nicht gut auf ihre Kollegin zu sprechen ist. Als Shannon ermordet aufgefunden wird, scheint es, als habe Jordan Recht gehabt. Doch Baker ist weder Shannons Vergewaltiger, noch ihr Mörder. Um jeglichen Tatverdacht von sich abzuwenden, müsste er sich allerdings als Homosexueller outen … Nigel ist unterdessen mit einem anderen Fall beschäftigt: In den Bergen wurde die eingefrorene Leiche eines Piloten gefunden, der vor 55 Jahren dort abgestürzt ist.

Eine gewisse Isabel Haley ist ermordet aufgefunden worden. Angeblich konnte sie Wunder vollbringen und hat sogar einen toten Jungen wieder zum Leben erweckt, aber dann stellt sich heraus, dass sie mit richtigem Namen Theresa Donovan hieß und wegen Mordes gesucht wurde. Daraufhin avanciert der Sohn des Paares, das Theresa zum Opfer gefallen war, zum Hauptverdächtigen. Doch obwohl dieser Theresa am fraglichen Abend aufgesucht hat, ist er nicht der Mörder. Lily hat ein großes Problem: Sie glaubt, dass ihr Freund Jeffrey Brandau eine Geliebte hat. Dann findet sie jedoch heraus, dass es sich bei der attraktiven Brünetten um Jeffreys Mutter Elaine handelt, die ihren Sohn noch immer voll im Griff hat und offenbar nichts von der Beziehung zwischen ihm und Lily hält. Lily ist schwer enttäuscht und davon überzeugt, dass ihre Liebe keine Chance mehr hat. Doch Brandau bietet seiner Mutter die Stirn und macht Lily einen Heiratsantrag.

Garret Macy hat sich in eine ausweglose Situation manövriert: Als er bei einer Familie etwas zum Tod einer nahen Verwandten recherchieren wollte, hat er entdeckt, dass in dem Haus ein Junge gefangen gehalten wird. Dadurch gerät er selbst in Lebensgefahr, denn der Entführer sperrt ihn als lästigen Zeugen in den Keller und kettet ihn an die Wand. Macy hat keine Chance zu fliehen, und der entführte Junge namens Jonah scheint von Everett einer Gehirnwäsche unterzogen worden zu sein, so dass Macy auch von ihm keine Hilfe erwarten kann. Wie sich herausstellt, handelt es sich bei Everett um einen Triebtäter der übelsten Sorte, der bereits einmal einen kleinen Jungen umgebracht hat. Doch Jonah ist so verunsichert, dass er Macy keinen Glauben schenken will. Erst als Everett das Haus verlässt, kann Macy ihn überreden, den Kellerschrank zu öffnen, in dem er die Leiche des Jungen vermutet. Als tatsächlich ein Skelett aus dem Schrank heraus fällt, ist Jonah endlich bereit, Macy zu helfen.

Pünktlich zu Lilys Polterabend taucht Pollack wieder in Jordans Leben auf. Jordan freut sich sehr und landet schließlich in Pollacks Hotelzimmer. Als sie dort am nächsten Morgen aufwacht, liegt Pollack tot neben ihr – erschossen! Sie hat die Waffe in der Hand und kann sich an nichts erinnern. Obwohl alles dafür spricht, dass Jordan die Mörderin ist, sind ihre Kollegen von ihrer Unschuld überzeugt. Nur Lu, die wegen ihrer Gefühle zu Woody ein Problem mit Jordan hat, stellt sich gegen sie. Damit bringt sie Woody jedoch so auf die Palme, dass er ihre Beziehung beendet.Während alle anderen fieberhaft nach Beweisen für Jordans Unschuld suchen, ist Lily der Verzweiflung nahe, denn ihre Hochzeit hatte sie sich eigentlich anders vorgestellt. Ihr Kummer bringt jedoch auch eine wichtige Erkenntnis mit sich: Nicht Brandau ist der Mann ihres Lebens, sondern Bug.