Dr. Drakken tänker höja sin intelligens med hjälp av en stråle från det topphemliga Phoebus-projektet. Istället är det nakenmullvaden Rufus som blir hyperintelligent när han kommer i vägen för strålen. Med Rufus gömd i skjortärmen klarar Ron skolans matteprov med glans. Alla tror nu att Ron är ett geni. Även Drakken tror det, så han kidnappar Ron för att tvinga honom att konstruera en domedagsmaskin.

Kim och Ron utreder en stöld av en robot på rymdbasen där Kims pappa arbetar. Spåren leder till en hemlig klubb där robotkonstruktörer låter sina maskiner kriga mot varandra under brutala former. Mellan varven gör Ron flera försök att ragga upp den söta kassörskan på biografen i Middleton.

Platserna på de mera populära tillvalskurserna har tagit slut, så Kim och Ron får nöja sig med det enda ämnet som finns kvar – hemkunskap. Samtidigt har Señor Senior Sr. anställt Shego som privatlärare till sin son. Senior hoppas att Shego ska lyckas lära Junior hur man blir en riktig superskurk.

Globala Säkerhetstjänsten gör en specialstudie av Ron Stoppable. Teorin är att Rons närvaro är hemligheten bakom Kim Possibles framgångar, något som man kallar ”Ron-faktorn”. Undersökningen väcker även superskurken Geminis intresse. Gemini kidnappar Ron och försöker värva honom som sin närmaste medarbetare.

Drakken och Shego kidnappar Dr. Freeman som är världens ledande expert på tänkande maskiner. Drakkens armé av förödarrobotar har nämligen problem med sin artificiella intelligens. Robotarna är stendumma, så Drakken förväntar sig att Dr. Freeman ska fixa programbuggarna. På skolan i Middleton har Kim och Ron fullt upp med sina lektioner i bilkörning när en talande bil utan förare kommer för att hämta dem.

Ron anmäler nakenråttan Rufus till en hundutställning (!) i syfte att komma åt en diamanttjuv som även är internationellt känd som hunduppfödare.

Kim åtar sig att passa Rufus medan Ron åker till Frankrike på semester. Av en händelse råkar Rufus svälja ett värdefullt datachip som alla superskurkarna är ute efter. Medan Ron och hans föräldrar vilar upp sig i Paris får Kim jobba hårt med att försvara Rufus mot Monkey Fist, Duff Killigan och Shego.

Det ska bli praktisk yrkesorientering på skolan i Middleton. Varje elev får en mentor som under en vecka ska introducera eleven i sitt yrke. Till Bonnie Rockwallers stora skadeglädje får Kim skolans vaktmästare som mentor. Ron har bättre tur – hans mentor är hemlig agent. Kim försöker hela tiden smita från sin mentor, men när Kim och Ron ger sig ut för att stoppa Drakkens senaste plan upptäcker Kim att hon borde ha varit mera uppmärksam under vaktmästarens lektioner.

Familjen Possible är i Florida för att hjälpa Kims farmor flytta in på ett äldreboende. Dr. Drakken finns också i närheten. Han tänker skaffa sig en armé av viljelösa ungdomar genom att ta kontroll över dem via deras MP3-spelare. Tyvärr blir radiofrekvensen fel, så Drakken förslavar istället alla pensionärer i området (även Kims farmor) eftersom styrsignalen går in på deras hörapparater. Men man ska inte underskatta farmor Possible!

Ron försöker imponera på Zita, flickan som han beundrar, genom att demonstrera sin skicklighet i dataspelet Everlot. I själva verket beror Rons framgångar på att han blir sufflerad av Wade. Men Ron har en rival, den mystiske Andemästaren. Han tar Ron och Zita till fånga och förflyttar dem till Everlots värld där de tvingas spela dataspel på liv och död. Deras enda chans att ta sig ut är att vinna spelet. Kim och Wade tar sig också in i spelet för att rädda Ron och Zita, men den avgörande hjälpen kommer från oväntat håll.

Ron Stoppable arbetar som frivillig inom äldreomsorgen. På besök hos den vresige pensionären Timothy North upptäcker Ron dennes hemliga identitet. North var i sin ungdom en Batmanliknande superhjälte som kallade sig Lilla Illern. Ron erbjuder sig att ta över Lilla Illerns trikåer och föra brottsbekämpandet vidare. Efter lite övertalning går North med på förslaget. På plats i Middletons undre värld får Ron stora problem när han stöter ihop med Illerns ärkefiende Skunken. Ännu mera tilltrasslat blir det när Kim upptäcker att Lilla Illern aldrig har funnits – annat än som rollfigur i en tv-serie!

Ron ska tillbringa en vecka i Japan som utbytesstudent på Yamanouchiskolan som visar sig vara en hemlig ninjaskola. Medan Ron är där blir skolans heliga lotussvärd stulet av Monkey Fist och hans apninjor. Nu är Ron Stoppable skolans enda hopp att få svärdet tillbaka. Hemma i Middleton utspelar sig ett annat drama. Alla flickorna blir upp över öronen förälskade i den japanske utbytesstudenten Hirotaka, och rivalitet utbryter mellan Kim Possible och hennes bästa vän Monique.

Dr. Drakken tänker krympa sig själv så att han obemärkt ska kunna ta sig in på den topphemliga försvarsanläggningen Area 51. Tyvärr går något snett – krympstrålen fungerar som förstoringsstråle och förvandlar Drakkens pudel till ett jättemonster. Medan Kim och militären slåss mot jättehunden videofilmar Ron konfrontationen som tävlingsbidrag till Middletons skräckfilmsfestival.

Middleton har drabbats av det värsta snöovädret i mannaminne. Barnen är förstås lyckliga som slipper skolan och får gå ut och bygga snögubbar. Men alla snögubbarna blir levande och börjar attackera människor. Väderreportern på tv, Britt Sommar, får skydd i familjen Possibles hem. Snart är alla snögubbarna på väg dit.

Som julklapp till Kim tänker Ron ta fast Dr. Drakken på egen hand så att Kim kan få en lugn jul tillsammans med familjen. Det slumpar sig inte bättre än att Ron och Drakken skjuter ut sig i rymden och återvänder till Jorden i en räddningskapsel som landar på Nordpolen. När Kim och hennes familj till slut hittar Ron har han och Drakken slutit fred och bestämt sig för att fira jul tillsammans.

Dr. Drakkens Bebe-robotar är tillbaka, fast den här gången agerar de på egen hand. Ett antal stölder på dockfabriker runt om i världen får sin förklaring när det visar sig att Bebe-robotarna behöver maskiner för att tillverka ännu fler robotar. Kims problem är att robotarna rör sig så snabbt att de inte syns för blotta ögat. Men det har Wade en lösning på. Han ordnar fram ett par skor som gör Kim minst lika snabb som robotarna.

Än en gång åker Ron och hejaklacksflickorna på läger. Än en gång hamnar de på det fruktade Myskolägret, fast nu är området sanerat och omdöpt till Myslägret. Det hjälper förstås inte när Rons gamle rumskamrat Jim än en gång förvandlas till den fiskliknande mutanten Gäl.

Kim och Ron har åkt till Go City för att besöka en nyöppnad Bueno Nacho-restaurang. Medan våra vänner är där invaderas restaurangen av superskurken Aviarius, och strax därpå dyker superhjälten Hego upp. Aviarius är ute efter att stjäla Hegos superkrafter, men av en händelse överförs krafterna till Kim. Det visar sig att Hego är ledare för Team Go, en numera skingrad syskonskara av superhjältar. Även Shego var en gång medlem av Team Go, men hon har gått över till den onda sidan och arbetar för Dr. Drakken. Kim och Ron måste tillfälligt sluta fred med Shego och arbeta tillsammans med Team Go för att ta fast Aviarius och återställa Hegos superkrafter.

Kim och Ron måste resa ända till Kina för att spåra upp Monkey Fist som har rymt från fängelset. Han är där för att stjäla en amulett som enligt legenden ska göra bäraren till apornas kung. Av en ren händelse hamnar amuletten i stället runt halsen på Kim. Tillbaka på skolan i Middleton upptäcker Kim att hon gradvis håller på att förvandlas till apa, något som är extra pinsamt eftersom skolfoto ska tas samma dag. I ett obevakat ögonblick tar Monkey Fists apa Chippy på sig Kims klänning, och när Ron Stoppable får se apan tror han att Kims förvandling är fullbordad. I själva verket befinner sig Kim som fånge hos Monkey Fist. Visserligen är Kim ännu inte apa till hundra procent, men det är inte långt dit. Och Wades analys visar att tiden håller på att rinna ut. Om inget görs mycket snart kommer förvandlingen att bli permanent.

Dr. Drakken har för tillfället gett upp planerna på världsherravälde. Han inser att om han ska komma någon vart måste han först av allt röja Kim Possible ur vägen. Så Drakken sprayar Kim med en kemikalie som får henne att försvinna bit för bit varje gång hon rodnar. Ron Stoppable ger sig iväg till Amazonas djungler i jakt på ett motgift. Under tiden försöker Kim isolera sig på sitt rum för att inte råka ut för något pinsamt som kan få henne att rodna. Men hon kan trots allt inte säga nej till en träff med sin drömkille Josh. Ska Ron Stoppable hinna fram med motgiftet i tid, innan situationen blir så pinsam att Kim försvinner för alltid?

Dr. Drakkens försök att skapa en armé av genetiskt förbättrade supersoldater misslyckas eftersom han inte riktigt behärskar tekniken. Men genom att samarbeta med genetikern Amy ”DNAmy” Hall tror Drakken att han ska kunna lösa problemen. I skolan i Middleton handlar det också om samarbete när eleverna ska arbeta parvis med olika vetenskapsprojekt. Ron Stoppable ska arbeta tillsammans med Monique, och Kim får det unga geniet Justine Flanner som partner. Personkemin i grupperna stämmer inte alls, men så anfalls staden av Drakkens och DNAmys jättelika dinosaurie och då kommer saken i ett annat läge.

Señor Senior Juniors hetaste önskan är att bli internationell popstjärna, något som hans far gör allt för att uppfylla. Men varför göra det på ett enkelt sätt när man kan göra det på ett ondskefullt sätt? Så Señor Senior Senior kidnappar medlemmarna i pojkbandet Oh Boyz – och av en slump även Ron Stoppable – för att kunna bedriva utpressning mot deras skivbolag. Utpressningsförsöket går inte hem, för Oh Boyz popularitet är i dalande och skivbolagsdirektören är bara glad att bli kvitt sina krävande divor.

Kims uppdrag är att vakta den mystiska ”Stråle X-maskinen” innan den flyttas till hemlig ort. Problemet är bara att Kim är förkyld och brister i uppmärksamhet, något som Drakken och Shego utnyttjar. Förkylningen sprids som en löpeld till både vänner och fiender, och båda sidor tvingas sätta in vikarier. Maskinen stjäls, tas tillbaka, stjäls igen och krossas under en fallande ljuskrona. Till slut kan Kim trots allt återlämna den förstörda maskinen till dess uppfinnare, och den häpnadsväckande sanningen om vad Stråle X egentligen gör kan avslöjas!

Under ett räddningsuppdrag träffas Kim och Ron av en stråle som gör att de bara kan prata sanning under det kommande dygnet. Problemet är att Kims pappa har bjudit hem sina högsta chefer på middag, varvid Kim obönhörligt avslöjar allt hon tycker och tänker.

Det är mors dag och Kim kommer överens med sin mamma att de två ska umgås hela dagen, oavsett vad som händer. Tyvärr tar superskurkar som Dr. Drakken och Shego inte ledigt för att fira sådana högtider. Eftersom Ron har lovat sin mamma att städa garaget blir det Kim och hennes mamma som ger sig ut för att stoppa Drakken. Men Dr. Drakkens mamma dyker också upp. Hon vet inte att hennes son är en brottsling, och Drakken har all möda i världen att hålla skenet uppe.

Avancerade motorer och bildelar stjäls över hela världen av Motor Ed och hans hejdukar. Hemma i Middleton lär Kim och Ron känna Felix, en rullstolsburen pojke vars mor är arbetskamrat med Kims pappa. Ron blir snabbt god vän med Felix, men Kims fördomar mot handikappade gör att hon hela tiden gör bort sig i Felix sällskap. När det gäller bovjakt visar sig Felix vara minst lika duktig som Kim och Ron. Tillsammans lyckas Kim och Felix befria Ron som kidnappats av Motor Ed och sätta stopp för ligans härjningar.

Ron Stoppable har fått 99 miljoner dollar i royalties för ett matrecept som han har komponerat åt snabbmatskedjan Bueno Nacho. Trots att Ron lovar Kim att han fortfarande är samme gamle Ron stiger pengarna honom åt huvudet. Dr. Drakken har penningbekymmer av ett annat slag. Han förbereder sig än en gång för att ta över världen, men ”operation katastrofalt slut” visar sig kosta mer än han har råd med.

Kim och Ron besöker idrottstävlingen X-games för att ta fast en mystisk tjuv som har bokstäverna SSS tatuerade i nacken. På idrottsplatsen träffar de även den före detta miljardären och superskurken Señor Senior Senior och hans son Junior. En svindlare har lurat av Senior alla hans pengar, så far och son försörjer sig numera på ärliga affärer – att sälja T-shirts. Det är i alla fall vad de själva påstår.

Kim och Ron ställs inför ett hundra år gammalt mysterium när deras skolklass besöker historiska museet. Enligt gamla anteckningar begick en gammelfaster till Kim en spektakulär stöld på världsutställningen i Middleton hundra år tidigare. Kim och Ron forskar i saken och hoppas kunna rentvå Miriam ”Mim” Possibles namn.