Después de lo ocurrido en Power Rangers Turbo, los villanos más malvados del Universo son reunidos por órdenes de Dark Spectro para celebrar su victoria sobre Zordon, pero son interrumpidos por un misterioso Red Ranger que resulta ser un espía. Los Rangers (excpeto Justin) ya sin poderes se dirigen a Eltar, pero son absorbidos por la Astro Megaship. T.J., Cassie, Ashley y Carlos conocen al nuevo Red Ranger e intentan convencerlo de que están de su lado y también fueron Rangers. La Megaship es atacada por Astronema, y deben aterrizar en un planeta. Deciden salir a luchar contra los Quantrons...

El Red Ranger es un ser del planeta KO-35 llamado Andros y regresará a los chicos a la Tierra. Cuando los deja en el Transbordador de NASADA, son atacados por Astronema y sus Quantrons. Alpha 6 intenta convencer a Andros que debe aliarse con los Rangers de la Tierra y le da a cada uno sus nuevos poderes. T.J. pasará a ser el Blue Ranger y Carlos el Black Ranger, mientras que Cassie y Ashley se mantienen como las Pink y Yellow Rangers respectivamente; están siendo atacados por una nave de Astronema y tendrán que utilizar el Astro Megazord para destruirlo. Ahora los Power Rangers se dirigen a la Tierra para reparar la Astro Megaship.

Los Rangers llegan al planeta Tierra pero fueron perseguidos por Astronema, quien tendrá como nuevo ayudante a Elgar. Ahora Bulk y Skull deciden ayudar al profesor Fenómeno en busca de alienígenas. Ecliptor ataca la ciudad y los Rangers necesitarán la ayuda del Astro Megazord para vencerlo. Al final, Astronema hipnotiza a unos héroes famosos de Nueva York que son las Tortugas Ninja mutantes.

Con la ayuda de un nuevo escuadrón de supervillanos, las Tortugas Ninja les hacen creer a los Rangers que son amigos y logran entrar a la Megaship, aunque Andros sigue desconfiado. Cuando Astronema toma el mando de la nave, se dirige a un agujero negro y las Tortugas vuelven a la normalidad y ayudan a los Power Rangers a luchar contra los Quantrons.

Andros se dirige a su planeta de origen KO-35 para buscar a su hermana perdida, pero todo resulta ser una trampa cuando se encuentra con Ecliptor y Carlos que lo ayuda más tarde es gravemente lastimado. Los Rangers deben convencer al Red Ranger que debe confiar en ellos y trabajar en equipo.

Norquist, el comandante de NASADA pide ayuda a los Rangers diciéndoles que Astronema quiere destruir un satélite que tiene información valiosa. El satélite cae en un planeta llamado Kalderon y los Rangers son capturados y serán devorados por Clawhammer. La única esperanza son D.E.C.A y Alpha 6 para comandar el Astro Megazord.

Mientras T.J., Cassie, Ashley y Carlos asisten al Instituto de Angel Grove, Andros se hace amigo de un trío de ladrones, que peligran cuando un monstruo los ataca en su guarida de coches robados.

Cassie fue chantajeada para ir a una cita con un perdedor, gracias a ella descubre que no lo es. La cita va mal cuando uno de los monstruos de Astronema intenta demoler un edificio que contiene un tubo de plutonio, los Rangers deben impedirlo para evitar una explosión atómica.

Un rayo recarga el simulador, volviendo reales a los Craterites que se multiplican, escapan, y atacan Angel Grove.

Un monstruo avispa no quiere ser malvado, él ayuda y se hace amigo de Cassie, rescatándole la vida.

Los Rangers investigan un planeta en su búsqueda de Zordon y encuentran al Phantom Ranger, herido de un ataque por Divatox, él da a Andros un disco que le da control a la Delta Megaship.

El Profesor Fenómeno desarrolla un rayo láser que puede convertir objetos malvados. Astronema decide utilizarlo en contra de los Rangers, convirtiendo al Delta Megazord en malo.

La abuelita de Ashley visita Angel Grove, en intento de ver a su nieta comprometida con alguien, cuando un grupo de termitas invade la ciudad, los Rangers van a destruirlas, y la abuelita de Ashley los ayuda con un auto de la policía.

Una picadura de un insecto alienígena hace que Carlos se transforme. Carlos entonces pica Cassie, que también se transforma. Los Rangers tienen que derrotar al insecto alienígena, uno de los monstruos de Astronema y buscar la curación para Cassie y Carlos antes de que destruyan la nave.

Darkonda neutraliza a Ecliptor en pleno combate con los Rangers y absorbe sus poderes y energía convirtiéndose en Darkliptor, congela a Ashley, Cassie y Carlos, y lanza un ataque justo a la cabeza de T.J. dejándolo inconsciente obligando a Andros a llevarlo a la Megaship. Cuando despierta padece amnesia. En el momento preciso recuerda todo y salva a sus amigos de Darkliptor con Andros.

Andros hace un cierto trabajo secreto en una planeta alienígena, donde Darkonda pasa su tiempo en un casino. Andros derrota a un grupo de alienígenas en un juego de tarjetas, y gana las tarjetas llave de Zordon. Andros escapa del planeta y finalmente recuerda que fue Darkonda quien secuestró a su hermana Karone.

Los Rangers encuentran la localización de los Mega Vehículos, cinco naves poderosas del espacio que se combinan para formar el Mega Viajero, y ganan el control de los vehículos con las tarjetas llave de Zordon.

Lightning Cruiser y Storm Blaster, anteriormente fueron secuestrados por Divatox, en medio de la nada los Piranhatrons los llevan amarrados pero tratan de escapar, Lightning Cruiser no tuvo suerte de salir y Storm Blaster va a la tierra a buscar ayuda, los Rangers dieron con él hasta que Astronema los atrapa, es ahí cuando Storm Blaster busca a Justin para ayudar a los Rangers, Justin recupera sus poderes del Blue Turbo Ranger y salva a sus amigos, después todos juntos van al rescate de Lightning Cruiser.

Los chicos celebran el cumpleaños de Ashley en el parque de Angel Grove, sus amigos le dan regalos pero ella aprecia más el de Andros ya que es una muestra de cariño de él hacia ella, Astronema quiere infiltrarse a la Megaship para destruir a los Rangers con la ayuda de un monstruo que cambia cuerpos, él convierte a Astronema en Ashley y para que no haya sospechas la secuestran, Astronema tiene atrapados a Cassie, Carlos y T.J., trata de eliminar a Andros, pero Ashley logra escapar y lo salva, finalmente los Rangers destruyen al monstruo.

En un mundo extranjero hostil, la Megaship es atacada, dañando el compartimiento criogénico que sostuvo Zhane, el Silver Ranger. Mientras los Rangers defienden la Megaship, Zhane camina hacia fuera y presta una mano, a la sorpresa de Andros, que lo había colocado en el Cryo-stasis debido a las lesiones serias que sufrió al defender KO-35 de Dark Spectro.

Andros busca a Ashley para invitarla a salir, pero la encuentra con Zhane creyendo que hay algo entre ellos, Zhane aclara el malentendido pero Andros no lo quiere entender. Después los Rangers son atrapados por Darkonda y Zhane trata de salvarlos pero se encuentra con Ecliptor y lucha con él hasta que lo derrota en la batalla y ayuda a sus amigos, pero en medio de la batalla los poderes de Zhane desaparecen sin explicación alguna, finalmente Andros acepta que exagero y Zhane lo perdona, volviendo hacer amigos y nuevamente hace el intento con Ashley de invitarla a salir, obteniendo buenos resultados.

Un diagnóstico de Alpha 6 revela que Zhane tiene solamente un rato limitado de permanecer transformado, pero Andros y Cassie lo espían sin querer creyendo que tiene poco tiempo de vida, Astronema deduce esto y lanza a un monstruo para explotar esta debilidad de Zhane, pero logra salvarse gracias a que le devolvio energía a su Digimorpher.

Cuando Astronema es atacada por uno de sus propios monstruos, Zhane viene a su rescate y al hallazgo que los dos están atraídos fuertemente uno al otro, ambos planean una cita la cual Zhane pospone para ayudar a sus amigos de un ataque monstruoso, Zhane llega tarde a la cita y Astronema se enfada con él, terminando mal.

Los Rangers investigan interpretaciones de un planeta y encuentran que los rebeldes de KO-35 han fijado un campo allí. Darkonda está entre ellos, disfrazado como un oficial, que intenta poner a la gente contra los Rangers, al final Zhane decide quedarse a protegerlos.

Durante una batalla contra el nuevo monstruo de Astronema, el camaleón, Carlos daña accidentalmente a Cassie, dándole dudas serias sobre si es digno de ser un Power Ranger. Carlos se encuentra con Adam y le cuenta lo sucedido, Adam lo entrena para recuperar su confianza, en un principio Carlos se rinde fácilmente y toma la decisión de dejar de ser un Ranger, en ese momento llega el camaleón a atacarlo y sin sus poderes no puede, Adam lo ayuda pero las cosas se complican, no tiene otra opción más que transformarse en el Black Power Ranger de nuevo, pero no es una buena opción ya que la moneda de poder del Mastodonte fue destruida con las otras, si Adam la usaba en una sola mutación podría dañarlo, sin embargo se arriesgó, Carlos al ver que Adam no podía contra el camaleón decide volver a ser Ranger, gracias a eso recupera su confianza, Carlos y Adam con los demás Rangers acaban con el camaleón.

Mientras los Rangers luchan en Angel Grove, se arranca el collar de Astronema. Andros lo encuentra y descubre un cuadro de él y su hermana de niños, significando que Astronema es su hermana perdida Karone.

Astronema ahora sabe su pasado verdadero y se pregunta independientemente si ella debe ser malvada. Ella se reúne con Andros en KO-35 y ensambla su lado, se va con él a la Megaship.

Astronema dirige a los Rangers al planeta donde Zordon está prisionero. Resulta ser una trampa de Dark Spectro para capturar a los Rangers, al final Astronema decide salvar a su hermano y a los demás Rangers, teniendo la confianza de todos ellos.

Dark Spectro quiere a Astronema de regreso, y logra esto enviando un asteroide a la Tierra, mientras los Rangers tratan de detenerlo, Astronema se infiltra a la Fortaleza Espacial para cambiar el curso, pero llega Ecliptor y la convierte en mala de nuevo.

Los Rangers detuvieron el asteroide con la ayuda de Zhane que regresó con su nuevo Megazord el Mega Volador, Andros y Zhane se dirigen a recuperar a Karone pero al llegar descubren que nuevamente se volvió Astronema y la tienen otra vez de enemiga.

Cinco impostores están dando rienda a estrago a través de Angel Grove como los Power Rangers. Los Rangers verdaderos los enfrentan, y se revelan ser los Psycho Rangers, máquinas maníacas enviadas por Astronema. Los Psycho leen las mentes de los Rangers, absorbiendo sus técnicas de lucha y datos de sus armas.

Una niña llamada Silvy descubre que Carlos es un Ranger cuando ella encuentra fotos de él mutando en una cabina. Ella utiliza las fotos para chantajearlo en pasar tiempo con ella, al final Carlos comprende las razones por las que Silvy lo hacia pasar tiempo con él, ella tenía un hermano que murió y ambos soñaban con ser Astronautas.

Ashley y Cassie tienen una pelea sobre hacer tareas en la Megaship. Psycho Yellow y Pink capturan a Ashley, lo cual hace que Cassie se sienta mal y quiera recuperarla, al final la recuperan y tanto Ashley como Cassie hacen las paces y derrotan a Psycho Pink.

T.J. idea una manera de derrotar los Psycho Rangers. Puesto que los diseñan para luchar con su color respectivo de Ranger, todos los Rangers se disfrazan de Blue Ranger y para confundirlos más, Zhane llega como Psycho Silver, al final derrotan a Psycho Blue.

Los Psycho Rangers recorren la ciudad en busca de los Rangers de carácter civil, mediante el reconocimiento de voz. Cassie está en la ciudad, y debe permanecer en silencio para no ser encontrada.

Los Psycho Rangers han robado el Mega Viajero. Para regresarlo los Power Rangers lanzan un ataque de sorpresa contra los Psychos.

Mientras busca a Zordon en un planeta extraterrestre, Andros rescata a una pequeña criatura alienígena que fue esclavizada por un monstruo llamado Jakarac. Jakarac quiere su cautivo de regreso, y los Rangers deben derrotarlo para defender la libertad de la criatura.

Astronema desarrolla una máquina que transforma la materia en tarjetas. Los fantasmas de los Psycho Rangers lo utilizan al revés, restaurándose a nuestro plano físico.

Ecliptor accede a la Astro Megaship y crea un nexo que evite que los Rangers entren, Ecliptor aumenta sus energías y lucha contra los Rangers, al final de la batalla, el Delta Megazord es destruido.

Cuando Andros y Ashley estaban en la ciudad de noche, son atacados por un humvee siniestro, posteriormente captura a Carlos, Cassie y T.J., los teletransporta en el medio de ninguna parte, Andros y Ashley tratan de buscarlos y dan con ellos, el humvee se hace grande y pelea contra el Mega Viajero, pero es destruido cuando derrotan al humvee.

Dark Spectro pide a todos los villanos en el Universo que comiencen con la destrucción de diferentes mundos, Divatox ataca Aquitar y a los Alien Rangers, Rita Repulsa y Lord Zedd atacan Triforia y a Trey el Gold Ranger, El Imperio de las Maquinas atacan Eltar y al Phantom Ranger y al Centurión Azul, y finalmente Astronema ataca la Tierra, los Rangers tratan de detenerla pero al final son derrotados ya que toda la ciudad esta invadida de varios Phiranhatrons y Quantrons, Darkonda quiere destruir a Dark Spectro pero los dos terminan destruyéndose el uno con el otro terminando con todas las vidas de Darkonda y haciendo a Astronema la nueva soberana del mal y el inicio de la destrucción.

Todos los habitantes de la Tierra piensan que los Rangers los han abandonado, Andros entra a bordo de la Fortaleza Espacial para intentar y hacer a Astronema buena otra vez, pero terminan en una pelea en la cual Astronema muere asesinada accidentalmente por Andros, en la Tierra Ashley, Cassie, Carlos, T.J. y Zhane revelan su identidad para salvarla y los habitantes de la Tierra los ayudan a combatir a las fuerzas del mal. Zordon le pide a Andros que rompa su tubo de energía, eso lanza una onda de energía que destruye y purifica a las fuerzas malvadas que atacan, Andros regresa a la tierra llorando por haberle hecho daño a su hermana, con una lágrima de Andros que cae sobre Astronema vuelve a la vida como Karone reuniéndolos a ambos nuevamente. Los Rangers planean regresar a la tierra, Ashley le pide a Andros que vaya con ellos, él se niega al principio, pero después comprendió que necesitaba estar con sus amigos, así que va con ellos, Zhane y Karone también se unen al viaje, comenzando una nueva vida todos juntos.