Rita Repulsa's twisted family members Rito Revolto and Master Vile join forces with Lord Zedd and Rita to step up their plan to conquer Earth. Learning the mystical arts of the ninja from the sage Ninjor, the Power Rangers battle on with magical martial arts abilities against the greatest threat of their lives.

Lorsque l'équipe perd ses pouvoirs en combattant Rito, le frère de Rita, les Rangers partent en quête du Temple du Pouvoir, où Ninjor, créateur des Médaillons, leur donnent de nouveaux pouvoirs Ninjas ainsi que les NinjaZords, rejoints plus tard par les ShogunZords.

Au milieu de cette saison, à son tour, Kimberly quitte l'équipe pour son entraînement à la Coupe du Monde de Gymnastique. Elle donne ses pouvoirs à Katherine de manière temporaire, ainsi elle devient la nouvelle Ranger Rose. Peu de temps après, Master Vile, le père de Rita et Rito, débarque sur Terre avec le Cristal d'Armaguedon. Il parvient à inverser le cours du temps et à transformer les Rangers en enfants, dépourvus de pouvoirs.

בעונה הזו, הפאוור ריינג'ר האדום וחבריו נעזרים בכישורי לוחמת נינג'ה כדי להביס איגוד רשע שבראשו עומד מאסטר ווייל.

丽达女王的弟弟里多来月球投靠她，但显然乍德爵士并不欢迎这个可笑的骷髅头，于是里多便送上了自己的“见面礼”——当天使丛林中学排球队和石峡谷中学排球队的比赛正在进行的时候，他突然降临地球，并在战斗中把恐龙战队的六架雷神佐德全部毁灭，恐龙战队又一次失去了佐德。

当队员们陷入失去战斗机器以及对地球安危的担忧之中时，佐藤鼓励队员们打起精神，并告诉大家有一位传奇式的守护神守卫着强大的忍者超能量，他可以帮助恐龙战队恢复战斗力。他被称为大忍者，具有强烈的武士精神，长年守卫着安放着忍者超能量的超能神庙。然而，当队员们长途跋涉历尽艰险终于见到大忍者时，大忍者却表示并不愿意帮助他们。但通过队员们的言行，大忍者认可了队员们正直善良的心，于是便将忍者超能量和忍者佐德交给了六名队员。从此，新的恐龙战队诞生了。后来，金伯莉因为要参加盆地体操锦标赛而选择离开，她将粉色能量币交给了来自澳洲的金发姑娘凯特。

然而好景不长，队员们虽然相继得到了新能量和新佐德，另一个恶魔的降临再次使恐龙战队失去战斗力，他就是怪杰老妖。他用死亡光球将队员们变成了小孩，使队员们再次失去了变身能量。无奈，佐藤只好临时从水之星召唤了五名外星战士暂时守卫地球，同时让队员们去寻找希奥水晶以恢复原样。

W tym sezonie Czerwony Power Ranger i jego ekipa wykorzystują umiejętności walki w stylu ninja, aby rozbić koalicję zła pod wodzą Mistrza Zła.

Esta temporada apresenta o Power Ranger Vermelho e seu grupo usando habilidades de combate ninja para se defenderem de uma coalizão do mal, liderada por Master Vile.

Rito Revolto, el hermano de Rita, llega a Angel Grove, y aprovechando una avería en los Thunderzords, los destruye, acabando con los poderes de los Power Rangers. Para poder seguir defendiendo la Tierra, los Rangers acuden al legendario Templo Perdido, donde conocen a Ninjor, que les entregará nuevos poderes Ninja, así como los Ninjazords. Rito se une a las filas de Rita y Zedd, y trae con él unos nuevos guerreros pájaro llamados Tengas, y junto a los nuevos monstruos que crea el matrimonio pondrán los nuevos poderes de los Power Rangers a prueba para defender la Tierra.

Rito Revolto, el hermano de Rita, llega a Angel Grove, y aprovechando una avería en los Thunderzords, los destruye acabando con los poderes de los Power Rangers. Para ser capaces de seguir defendiendo la Tierra, los Rangers acuden al legendario Templo Perdido, donde conocen a Ninjor, que les entregará nuevos poderes Ninja, así como los Ninjazords. Rito se une a las filas de Rita y Zedd, trayendo con él unos nuevos guerreros pájaro llamados Tengas y junto a los nuevos monstruos que crea el matrimonio pondrán los nuevos poderes de los Power Rangers a prueba para defender la Tierra.

Nachdem auch Lord Zedd die Power Rangers nicht besiegen konnte, erscheint Ritas Bruder Rito Revolto und zerstört die Donnerzords der Power Rangers. Damit haben die Power Rangers ihre Verwandlungskräfte verloren. Zordon schickt sie zu Ninjor, der ihnen die neue Ninja Power überreicht. Nun verfügen die Power Rangers zum einen über Ninja-Anzüge gegen die Tengu-Krieger und zum anderen über Ranger-Anzüge, die ihren alten gleichen. Zur neuen Ninja Power gehören auch die Ninjazords, mit denen Rito, Rita und Lord Zedd zurückgedrängt werden können. Später gelingt es Finster alte Zords ausfindig zu machen. Lord Zedd will sie mit den Power Rangers als Piloten benutzen, aber die Zords wechseln jedoch auf die Seite der Power Rangers und kommen als Shogunzords zum Einsatz. Als Katherine neu in die Stadt Angel Grove kommt, beeinflusst Rita sie durch einen Zauber gegen die Power Rangers und nimmt dabei den Falkenzord und Ninjor gefangen. Als Katherine vom Zauber befreit wird, gibt ihr Kimberly ihre Pink Ranger Power, da sie sich entschlossen hat, an den Weltfestspielen in Gymnastik teilzunehmen. Zu allem Überfluss erscheint noch Rita und Ritos Vater, der Meister des Schreckens, der mit Ninjors Hilfe an den Zeo-Kristall kommen möchte. Die Power Rangers zerstören den Kristall jedoch lieber als diesen ihm zu überlassen und zerstreuen die Teilsplitter an verschiedenen Orten in verschiedenen Zeitepochen. Der Meister des Schreckens rächt sich, indem er die Erde rückwärts drehen lässt, sodass sich die Zeit zurückdreht und verwandelt die Power Rangers somit zurück in ihre Kindheit.

Die Alien Rangers (auch Aquitar Rangers genannt) kommen vom Planeten Aquitar und sind für die Power Rangers eingesprungen, nachdem diese vom Meister des Schreckens in Kinder verwandelt wurden. Nachdem sie den Meister des Schreckens vertreiben konnten und die Kinder den Zeo-Kristall und somit die normale Zeit wiederhergestellt haben, ziehen sich die Alien Rangers wieder auf ihren Planeten zurück. Inzwischen gelangen Rito und Goldar in die Kommandozentrale von Zordon und zünden eine Bombe. Dabei gelingt es ihnen den Zeo-Kristall zu stehlen und die Kommandozentrale zu zerstören. Die Handlung wird in der nächsten Staffelserie Power Rangers Zeo fortgesetzt.