Episódios 20
Terra de ninguém
Duas naves-colmeia Wraith capturaram o Dr. McKay e Ronon e seguem em direção a Terra. Resta ao Major Sheppard resgatá-los e descobrir uma maneira de impedir que os Wraith transformem o planeta em uma fonte de alimentação.
Ler MaisO bastardo
Depois de transformar a tripulação de uma nave-colmeia Wraith em humanos, a equipe Atlantis precisa decidir seu destino. Enquanto isso, a Dra. Weir se vê diante da análise detalhada de Richard Woolsey e o I.O.A.
Ler MaisIrresistivel
Um homem de outro mundo causa um efeito incomum na equipe Atlantis, que passa a se comportar de forma estranha. Os poucos membros da equipe que não foram afetados terão de descobrir a causa do problema.
Ler MaisA descendência
A Dra. Weiner acompanha a equipe de Sheppard em uma missão até uma civilização avançada que teve uma relação com Atlantis no passado. Com isso, eles descobrem uma ligação com uma descoberta feita previamente na cidade.
Ler MaisO mundo real
A Dra. Weir acorda em um sanatório fora de Washington D.C. e é informada que Atlantis e o Programa Stargate só existem em sua imaginação.
Ler MaisMcKay e a Sra. Miller
Rodney volta à Terra para visitar sua irmã Jeannie.
Ler MaisO retorno
Enquanto testam um mecanismo do portão estelar que irá permitir que a viagem entre Atlantis e a Terra seja realizada em cerca de 30 minutos (a ponte intergaláctica McKay-Carter), McKay, Sheppard e a equipe descobrem uma antiga nave viajando quase na velocidade da luz. Quando a Dra. Weir conversa com os viajantes, ela fica surpresa por eles pedirem que os membros da expedição deixem a cidade de Atlantis.
Ler MaisO retorno, parte 2
A missão do major-general Jack O'Neil de defender Atlantis falha quando ele e Richard Woolsey são feitos prisioneiros durante um ataque dos replicantes na cidade. A equipe de Sheppard, a Dra. Weir e o Dr. Carson roubam um Saltador de Possas do Comando Stargate na Terra e voltam à galáxia Pegasus com um plano para retornar Atlantis.
Ler MaisIrresponsavel
Enquanto investiga relatos sofre um "super-herói" em outro planeta, a equipe do coronel Sheppard se depara com dois velhos conhecidos.
Ler MaisSuper Rodney
Ao desativar sistemas desnecessários em Atlantis, McKay é atingido por uma antiga e estranha máquina. Ele começa a ter superpoderes, mas as coisas nunca são como parecem e Rodney e a equipe precisam lutar contra suas mutações para salvar sua vida
Ler MaisPrimeiro ataque
O coronel Abe Ellis chega a Atlantis com uma nova nave terráquea, a Apollo, e uma nova missão. A Dra. Weir tem dúvidas quanto a missão, acreditando que ela pode iniciar uma guerra com um inimigo muito poderoso. Quando a missão dá errada, Wier precisa tomar uma atitude radical para salvar Atlantis.
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