迈克尔和林肯安排了交易的地点，并已知道如果交出了锡拉，所有知情人都无法活下来。

Ve finále jde všem o životy. Michael zvažuje, zda věřit starému nepříteli, který jemu a všem jeho přátelům nabízí možnost dostat se na svobodu.

Michael har en sidste konfrontation med sin mor, og modtager et tilbud om hjælp fra Kellermand, der måske er for godt til at være sandt.

Michael probeert voor eens en altijd The Company te vernietigen

Michael tries to bring down the Company once and for all.

Le général Krantz capture les frères et aggrave la situation en prenant d'autres membres de l'équipe, mais Michael réussit à s'enfuir avec Scylla.

Michael versucht, das Unternehmen ein für alle Mal zu Fall zu bringen. Nachdem der General die Brüder erwischt und den Einsatz erhöht hat, indem er mehr ihrer Verwandten entführt hat, entkommt Michael mit Scylla.

Ο στρατηγός συλλαμβάνει τα αδέλφια και δυσκολεύει την κατάσταση απάγοντας τους συγγενείς τους, αλλά ο Μάικλ κατορθώνει να δραπετεύσει με τη Σκύλλα. Ο Μάικλ σχεδιάζει την τελική απόδρασή του από τη φυλακή για να ελευθερώσει την ευάλωτη Σάρα.

למייקל מוצעת עסקה מאוייב מהעבר אך הוא לא יודע אם לבטוח בו. שרה מטפלת בלינק הגוסס אך נתקלת בהפרעה, וגם, נגלה מה קורה לחבורה אחרי 4 שנים...

A sorozat fináléjában ismerős arcok térnek vissza, hogy segítsenek Michaelnek jó kezekbe juttatni a Scyllát és ezzel egyszer s mindenkorra leszámolni a CÉG-gel, ám ez nem mindenkinek tartogat happy endet.

Alex e Lincon aspettano l'esplosione che tarda ad arrivare; Michael comunica quindi che, a causa di un possibile blocco, dovrà attivare l'innesco manualmente. T-Bag, dopo il fallimento procurato al Generale, sta per essere ucciso da quest'ultimo ma riesce fortunosamente a mettersi in contatto con Sucre, procurandosi così un'ulteriore pista da seguire. Alex riesce ad attivare manualmente la bomba che travolge Christina, protettasi tempestivamente con il corpo di Downey e, dopo aver aiutato Lincoln e scappare, i due vengono raggiunti da Michael e gli altri che li traggono in salvo. Tutto il gruppo, incluso Alex, è deciso a distruggere Scylla per chiudere definitivamente la faccenda ma prima devono occuparsi delle condizioni critiche di Lincoln. T-Bag si incontra con Sucre ma viene banalmente catturato da questi e C-Note. Michael riceve una chiamata dall'uomo misterioso di nome Paul, che altri non è che l'ex agente della Compagnia Paul Kellerman ancora in vita, da cui riceve la proposta di consegnargli Scylla per ottenere la totale libertà di tutte le persone coinvolte. Don Self non è morto ma ha perso gran parte delle facoltà motorie rimanendo pressoché un vegetale e viene ancora interrogato dagli agenti governativi, a cui non riferisce però nulla. Alex e Sara si addentrano nell'ospedale, mentre Michael e Lincoln rimangono fuori, per rubare delle medicazioni per salvare il ferito; Alex, cercando di salvare Sara viene arrestato dagli agenti governativi a guardia di Don Self e trasferito in centrale. Aspettata Sara uscita dall'ospedale, il gruppo viene però catturato dagli agenti della Compagnia e condotto dal Generale che, per farsi consegnare Scylla, ha degli uomini pronti ad uccidere Sofia e lo dimostra facendo vedere delle immagini in diretta; Il gruppo viene salvato da Sucre e C-Note, che avevano ricevuto la posizione dell'appartamento torturando T-Bag, che convincono inoltre Michael a non uccidere il Generale ma a legarlo semplicemente ed andarsene. Michael decide di consegnare Scylla a Kellerman ma Christina, ancora in vita, irrompe nel magazzino in cui il gruppo è nascosto e ruba il prezioso oggetto; Michael la ferma in tempo ma, mentre è cosciente di realizzare il suo primo omicidio volontario, la pistola si inceppa e la donna decide di vendicarsi del figlio. Sara spara alla madre del compagno alle spalle uccidendola, ma questa lascia inavvertitamente partire un proiettile che colpisce il figlio alla spalla. Alex viene interrogato dagli agenti governativi a cui decidere di rivelare, senza essere creduto, quello che avrebbe voluto dire al procuratore prima di essere incastrato da Mark. Durante la fuga, Sucre viene arrestato dalla polizia ed interrogato dagli stessi agenti di Alex, a cui rivela le stesse informazioni dell'ex agente dell'FBI, non venendo a sua volta creduto. Michael si incontra con Kellerman ed un emissario delle Nazioni Unite; Il ragazzo, non convinto, consegna ai due Scylla come aveva fatto con Don Self, ovvero incompleta, suscitando rabbia ed impazienza nell'emissario. Kellerman fa ragionare Michael che gli consegna dunque anche la parte mancante e riceve la bella notizia che ormai tutto è finito e nel giro di poche ore potranno riavere le loro vite. Michael, Sara, Lincoln, Sucre, C-Note ed Alex si incontrano con Kellerman e firmano gli agognati documenti per il rilascio e la libertà; L'uomo rassicura i presenti che i loro cari sono al sicuro e li lascia liberi di decidere cosa fare con T-Bag che, ovviamente, può tornarsene in prigione. Il Generale viene arrestato dall'FBI proprio prima di riuscire a scappare. Michael e Sara festeggiano finalmente sulla spiaggia e progettano la loro vita da genitori ma all'uomo inizia nuovamente a scendere del sangue dal naso.

Sono passati quattro anni e le normali vite degli "Otto di Fox River" e del resto del gruppo procedono tranquille. Alex si è finalmente fidanzato con Felicia Lang ma rimane in contatto con l'ex moglie Pam. Lincoln e Sofia, ormai fidanzati, hanno aperto un negozio di articoli sportivi sulla spiaggia e discutono del percorso universitario di LJ. Sucre vive sereno con Maricruz e la bambina. Don Self viene accudito in un ricovero specializzato. C-Note ha una bella villetta ed un lavoro onesto, senza più sorveglianza continua. Kellerman è diventato deputato degli Stati Uniti d'America e punta alla Casa Bianca; L'uomo viene però avvicinato dalla vedova di Danny, suo ex compagno ucciso proprio da lui, che gli dimostra la sua disapprovazione. Il Generale passa, agonizzante, i suoi ultimi momenti sulla sedia elettrica. T-Bag è tornato a comandare a Fox River dove scopre inoltre che la Gate ha, beffardamente, utilizzato una frase di un suo discorso come slogan della compagnia. Sara ha avuto il bambino che ha chiamato Michael, in memoria del padre e proprio come ha fatto Lincoln. Sara, Michael Jr, Lincoln, Sucre ed Alex si incontrano per commemorare Michael sulla sua tomba sulla spiaggia, spentosi l'11/04/2005 a 31 anni. Come epitaffio sono riportate le voci "Marito, Padre, Fratello, Zio, Amico - Sii il cambiamento che vuoi vedere nel mondo".

ついに長年にわたる因縁に決着をつける時が来た！将軍とクリスティーナ、スキュラはどちらの手に!?瀕死のリンカーンは助かるのか！Tバッグ、スクレ、マホーン、セルフそれぞれの決着とは？そして、サラとマイケルに未来はあるのか……

새라와 마혼은 링컨 치료를 위해 병원에 잠입하지만, 마혼이 FBI에게 체포당하고, 새라와 마이클, 링컨도 장군의 수하들에게 끌려간다. 장군은 소피아를 인질로 실라를 내놓으라고 협박한다. 링컨의 상태가 점점 나빠지고, 꼼짝없이 붙잡힌 상황에서 수크레와 씨노트가 나타나 이들을 구해 준다.

Podczas gdy Mahone znajduje się w pułapce Christiny, Sucre i C-Note usiłują wydobyć od T-Baga informację o miejscu pobytu braci. Michael postanawia zniszczyć Scyllę. Nieoczekiwanie otrzymuje pomoc od Paula Kellermana. W międzyczasie Self ostatecznie odmawia pomocy agentom FBI. Akcje odbicia Lincolna i Sary dochodzą zaś ostatecznie do skutku...

Quando o general captura os irmãos e sobe a fasquia ao raptar mais familiares, Michael foge com Scylla.

Michael faz sua última tentativa de destruir a Companhia.

Generalul îi prinde pe cei doi frați și mărește miza răpindu-le și mai multe rude, dar Michael fuge cu tot cu dispozitivul Scylla.

Вся оставшаяся команда вместе с Полом подписывает документы на освобождение. В конце Линк, Сукре, Махоуни, Сара и сын Майкла и Сары встречаются у могилы Майкла, чтобы в последний раз попрощаться с человеком, который на протяжении всего побега пытался помочь всем и каждому.

Caras conocidas vuelven a ayudar a Michael en su intento por derrotar a la Compañia de una vez por todas.

Generalen har fångat bröderna och höjt insatserna genom att röva bort fler av deras släktingar när Michael flyr med Scylla.

Sau khi đại tướng tóm được hai anh em và tăng thêm phần kịch tính bằng cách bắt cóc thêm người thân của họ, Michael đã trốn thoát cùng với Scylla.