Now locked up in a Panamanian prison known as Sona, Michael, T-Bag, Bellick, and Mahone try to find a way out. Much to their devastation, they soon find out that the prison has been abandoned by the authorities because of the immense threat from the vile inmates. Michael seeks for an inmate named Whistler in the prison sewers. As Lincoln is puzzled by Sara's sudden disappearance, he learns that LJ has gotten into some trouble. He also tries to recover the 5 million dollars.

Майкъл се състезава с Махоун кой първи ще намери Уистлър. Навън, Линкълн попада на стар приятел и завързва ново запознанство. Ти Бег си проправя път към приближените хора на Лечеро. Междувременно затворниците бленуват за вода, след като казанът с наличната се разсипва по случайност.

Решен да говори със Сара, Майкъл принуждава Ти Бег да го снабди с единствения телефон в Сона. Мистерията около Уистлър се изяснява, след като разговаря с Махоун, а Белик си създава враг, опитвайки се да обуе нещо на краката си. Отвън, Линкълн прави отчаян опит да спаси Сара и Ел Джей, който ще му доведе неприятности.

След като опитът му да освободи Ел Джей и Сара се оказва неуспешен, Линкълн получава смъроносно предупреждение от Компанията. Майкъл измисля наелектризиращ план за бягство от Сона докато Махоун е преследван от лице от миналото.

Постъпването на нов затворник в Сона изкарва извън контрол Уистлър и повишава подозрителността на Майкъл. Отвън Линкълн планира измъкване със София когато Сюзан премества срока за бягство напред.

Когато затворник е намерен мъртъв, Уистлър става главния заподозрян и Майкъл трябва да докаже невинността му, за да го опази жив. Майкъл заповядва да му бъдат представени доказателства от Сюзън, че Сара е жива, иначе отменя бягството на Линкълн и София наблюдават сутрешните обиколки на пазачите.

Everything goes wrong for Michael as he tries to create a diversion.

Lincoln tries to outsmart Susan who has his son. Sucre offers his assistance to Lincoln.

По време на изслушването поискано от правителството на Съединените Щати относно Компанията, Махоун се отклонява доста, главно към собствената си история, Майкъл и Линкълн са заклещени в мрежата на конспирацията. Обратно в Сона, Генерал Завала приписва два скорошни опита за бягство на Майкъл. Когато Майкъл отказва да каже кой е виновен за експлозията, той го заплашва, за да се опита да разбере истината, но Майкъл не отстъпва.

Майкъл се оказва в самостоятелен затвор и трябва да се измъкне с говорене от там. Неговият събеседник е новия командващ офицер на Сона. Междувременно Сюзън Би намира начин да държи Линк мотивиран. Ланг има подарък на сбогуване за Махоун. Сукре прави друга доставка за Сона и Сюзън Би му прави предложение. Т-Бег прави предложение на Уистлър и София го конфронтира.

Lechero's demotion devastates Michael's breakout plan as Sammy takes reigns at Sona. T-Bag forces Bellick to fight in a fight where the odds are stacked heavily against him. Lincoln and Sucre have some surprise fireworks set for Susan.

Майкъл е принуден да направи бягството още същата вечер, по-бързо от планираното, заради проливен дъжд. Друг затворник се присъединява кът бягството. Ти-Бег и Лечеро се обединяват заедно, докато Белик се опитва да направи съюз с Махоун. Линкълн и Сукре помагат на бегълците, като спират тока и светлините на Сона.

Момента, който го чакахме цял сезон най сетне настъпи Но дали за всички ще свърши благоприятно това бягство, дали всички ще избягат за тези 30 секунди? Четирима бягат от Сона, един плаща за бягството.

Майк и Линк са на път за срещата си в Панама със Сюзън, но без Уистлър. Махоун чака за назначение в Панамската кръчма. Сукре завършва в "Сона", за разлика от МакГрейди, който не се връща там.Стар познат ще се появи в епизода.