Lincoln Burrows je v cele smrti a má být popraven za vraždu, o níž je jeho mladší bratr Michael přesvědčen, že ji nespáchal. Bez dalších možností a času, který se krátí, podnikne Michael drastická opatření, aby byl uvězněn se svým bratrem.

Zatímco napětí mezi dvěma znepřátelenými gangy se vymyká kontrole, Lincolnova nevina je zpochybněna.

Čas letí a Michael musí požádat o pomoc svého spoluvězně Sucreho, aby mu pomohl provést svůj propracovaný plán útěku. Ale Sucre s tím nechce mít nic společného a požádá o přeložení do jiné cely. Michaelův nový spoluvězeň je ještě horší, než se zdá.

Michael si obstarává chemikálie, jež se budou hodit při útěku. Haywire začíná být fascinován pohledem na Michaelovo rozsáhlé tetování. Veronika si v pátrání na pomoc přibírá další právní pomoc.

Zatímco Kellerman a Hale tlačí na Michaelův transfer, Michael to vidí na odklad, a testuje první část plánu na útěk. Veronika s Nikem analyzují videonahrávku, jež svědčí proti Lincolnovi. O tutéž nahrávku má ale zájem i někdo další.

Fígl, pomocí kterého se Michael pokouší získat čas tím, že vyvolá zostřenou izolaci na celém křídle, nakonec vyústí ve vzpouru značného rozsahu. Nick přesvědčí Veroniku, že jí opravdu chce pomoci, a Kellerman najímá vězně, který má Lincolna zabít.

Během vzpoury Michael zachrání Sáru. Vrah se pokouší zabít Lincolna, a Bellick rozmlouvá Popeovi, aby jednal s guvernérem. Veronika s Nickem letí do Washingtonu DC, aby vypátrali, kdo vlastně fungoval jako tipař.

Michael se snaží vykoumat, jak se prokopat do budovy s odpočívárnou bachařů. Kellerman s Halem se pokusí zabít Veroniku a Eldžeje, a T-Bag se pokouší zbavit se odpovědnosti za vraždu Boba.

T-Bag sice o jednoho svého otroka přichází, kontaktuje ale hned dalšího. Kellerman s Halem pokračují ve sledování Eldžeje, snažícího se spojit se s Veronikou, aby mu pomohla. Abruzziho neschopnost splnit požadavky gangsterů ohrožuje plán útěku.

Je třeba znovuzískat kontrolu nad pracovním komandem, jinak šance na útěk padá. Abruzzi proto přesvědčí Michaela, aby Falzonovi prozradil, kde najde Fibonacciho. Zatímco Nickovi s Veronikou nejde na rozum, kam se poděly Steadmanovy prachy, viceprezidentka si přivádí spřízněnou duši z FBI, aby se ujal úkolu po Kellermanovi a Haleovi.

Quinn terorizuje Veroniku, Nicka, i Eldžeje. Michael si vyrábí zařízení, které mu má pomoci zjistit, kolik času budou mít na útěk. Westmoreland se nakonec rozhodne, že se k uprchlíkům přece jen přidá.

Napětí narůstá poté, co Lincoln Michaela upozorní, že někdo ze skupiny bude muset zůstat. Michaelovi se daří dobu potřebnou k útěku pod ošetřovnu zkracovat. Abruzzi ale hrozí, že T-Baga zabije, pokud se ho skupina nedokáže nezbavit jinak.

S blížící se Lincolnovou popravou Michael dává do pohybu únikový plán; Kellerman se střetne s Halem. Veronika v médiích uveřejní fakta, jež možná dokážou Lincolnovu nevinu.

Michael se pokusí Lincolnovu popravu oddálit tím, že vyřadí z provozu elektrické křeslo – leč neúspěšně. Veronika s Nikem dál shánějí příkaz k exhumaci pozůstatků Terence Steadmana, Lincolnův čas se nachyluje.

Lincoln, který si myslí, že se při popravě setká s otcem, dostává dvoutýdenní odklad. Soudce totiž nařídil exhumaci ostatků Terence Steadmana. Sucre se nabízí, že Michaelovi pomůže vyzkoušet jinou trasu komplikovaným kanalizačním systémem, vedoucím pod ošetřovnu.

Na retrospektivních záběrech je vidět, jak se Michael, Lincoln, Sucre, C-Note a T-Bag ocitli ve věznici Fox River a také jak tam sehnala místo Sára.

Michael skončí na samotce a málem se zoufalstvím utrápí. Sucre musí nějak překrýt díru v odpočívárně bachařů, a to dřív, než ji objeví pozvaní kladeči koberců. Eldžej zjišťuje, kde je Kellerman.

Zatímco Michael se na psychiatrii Haywirea pokouší přimět, aby si vzpomněl, jak vypadal chybějící kus jeho tetování, ostatní členové pracovního komanda mají co dělat, aby Bellickovi zabránili ve vydražení neobsazené cely po Michaelovi a Sucrovi.

Michael se pokouší vymyslet, jak od Sáry získat klíč od ošetřovny. Lincoln se dovídá, jakou roli hrál otec v událostech, jež mu zničily život. Tweener se zoufale snaží dostat se z dosahu Avocada, který ho trvale zneužívá.

Otvor je prozrazen, a tak musejí si vězni musejí večer dát pauzu. Lincolna teď sledují 24 hodin denně, tak s ním Michael nejspíš nebude moci počítat. Vynáší tedy svou poslední kartu – provede drastický tah proti řediteli věznice.

Michael donutí Popa vydat vysílačkou rozkaz k odeslání Lincolna ze samovazby na ošetřovnu. Po tomto ho sváže, omráčí a schová ve skříni. Spiklenci si oddychnou, když vidí, že se Michael vrátil. Nastane čas, kdy se otvírají mříže a všichni spiklenci se shromáždí v Michaelově cele. Těsně před svým odchodem musí všichni skrýt C-Nota, kterému od černošského gangu hrozí smrt za zmlácení jejich šéfa. Poté nastává cesta skrz potrubí na ošetřovnu. Cestou je třeba znovu zneškodnit Bellicka, kterému se podařilo se trochu rozvázat a hlavně strhnout si pásku z úst. Teď ve snaze, aby ho někdo našel, dělá v podzemí kravál. Spiklenci se dostanou v pořádku až na ošetřovnu, tady zneškodní Lincolnův doprovod a skrze dveře, které se nakonec doktorka vrátila odemknout, se dostanou k oknu, za nimž je kabel el. vedení a toužebná svoboda. Ke zděšení všech přítomných se tady ke skupině se připojuje Haywire.

Skupina na svém útěku použije dodávku, kterou zde zanechali Abruzziho lidé. Právě při nastupování do vozu se pomocí malé lsti podaří skupině zbavit Haywira. Tomu se na blízké farmě podaří ukrást kolo a relativně bezpečně prchá sám. V dodávce dojde k prvnímu konfliktu mezi Abruzzim a T-Bagem. Abruzzi vytáhne schovanou zbraň zpoza sedadla. Ještě než si však stačí cokoliv s T-Bagem vyřídit, ten se pomocí pout, které ukradl jednomu z dozorců, připoutá k Michaelovi.