Kỹ sư kết cấu Michael Scofield tự mình tìm cách để bị tống vào tù nhằm lên kế hoạch vượt ngục cho anh trai, một tù nhân lĩnh án tử hình nói rằng mình đã bị vu oan.

Michael cố gắng có được hai vật dụng: một loại thuốc sẽ giúp anh có kết quả xét nghiệm tiểu đường dương tính và một đinh ốc lớn để dùng trong kế hoạch tẩu thoát của mình.

Michael gặp phải vấn đề khi đưa Abruzzi và Sucre vào kế hoạch của mình. Trong khi đó, Lincoln xem xét việc yêu cầu để 1 thành viên gia đình có mặt trong vụ hành hình anh.

Michael có được một số hóa chất ăn da để dùng trong kế hoạch tẩu thoát của mình. Sau đó, Tửng, bạn tù mới của anh, trở nên mê mẩn hình xăm của Michael.

Trong khi Kellerman và Hale thúc đẩy việc chuyển trại của Michael, anh trì hoãn việc đó để thử nghiệm phần đầu tiên trong kế hoạch tẩu thoát của mình.

Kế hoạch nhằm có thêm thời gian bằng cách thúc đẩy giới nghiêm khu giam của Michael dẫn đến bạo động khắp nhà tù. Trong khi đó, Kellerman thuê một tù nhân giết Lincoln.

Trong cuộc bạo động ở nhà tù, Michael giải cứu Sara, kẻ ám sát cố gắng giết Lincoln và Bellick qua mặt Pope nói chuyện với thống đốc.

Khi Michael cố gắng tìm ra cách chui vào một tòa nhà có phòng nghỉ của quản giáo, Kellerman và Hale cố gắng giết Veronica và LJ.

Để lấy lại quyền kiểm soát nhóm làm việc và khôi phục cơ hội tẩu thoát của họ, Abruzzi thuyết phục Michael nói với Falzone nơi anh ta có thể tìm thấy Fibonacci.

Michael chế tạo một thiết bị để giúp xác định nhóm của anh sẽ có bao nhiêu thời gian để tẩu thoát và Westmoreland gia nhập nhóm vượt ngục.

Lincoln cảnh báo Michael rằng ai đó trong nhóm sẽ phải ở lại phía sau. Sau đó, Abruzzi đe dọa sẽ giết T-Bag nếu ông ta không rút lui khỏi nhóm.

Khi gần tới ngày hành hình Lincoln, Michael bắt đầu thực hiện kế hoạch. Trong khi đó, Kellerman đối chất với Hale và Veronica đưa ra thông báo trước truyền thông.

Khi Michael cố gắng trì hoãn việc hành hình Lincoln bằng cách thay đổi hệ thống dây điện của ghế điện, Veronica và Nick cố gắng khai quật thi thể của Steadman.

Lincoln được hoãn xử tử khi một thẩm phán ra lệnh khai quật thi thể Steadman và Sucre nhờ vả một người để giúp Michael kiểm tra một tuyến đường mới đến bệnh xá.

Các đoạn hồi tưởng làm sáng tỏ lý do tại sao các tù nhân Michael, Lincoln, Sucre, Trăm Đô và T-Bag phải ngồi nhà đá và duyên cớ nào mà Sara lại làm việc ở đó.

Michael bị tống vào phòng biệt giam. Trong khi đó, Sucre bị bỏ lại để che lỗ tẩu thoát trong phòng nghỉ của quản ngục.

Khi Michael cố gắng nhờ Tửng nhớ lại mảnh hình xăm bị mất, các thành viên khác trong nhóm phải ngăn Bellick bán đấu giá buồng giam của Michael và Sucre.

Michael cố gắng tìm ra cách lấy chìa khóa bệnh xá từ Sara. Trong khi đó, Lincoln biết được về vai trò của cha mình trong các sự kiện hủy hoại cuộc đời anh.

Lỗ tẩu thoát bị phát hiện, do đó cả nhóm phải tiến hành vượt ngục. Nhưng Lincoln đang bị giám sát 24/24, nên anh có thể phải bị bỏ lại phía sau.

Sau khi Michael buộc Pope phải chuyển Lincoln đến bệnh xá của nhà tù, nhóm vượt ngục đã tìm cách an toàn để đến được văn phòng không khóa của Sara.

Phát hiện cuộc vượt ngục, Bellick chỉ huy một cuộc truy lùng nhóm tù nhân vượt ngục trên quy mô lớn khi phó tổng thống có một màn thể hiện quyền lực gây sốc.