Våre fire helter opplever å bli sendt tvers gjennom universet til planeten D’Hoonnib og havner midt oppi politibråk. De blir venner med Fugitoiden, a.k.a. Professor Honeycutt, som blir forfulgt av de røffe militærstyrkene til General Blanque. Turtles lærer om den merkelige alienverden de har havnet i, og om Professor Honeycutts bakgrunn. Han har utviklet en teleportasjonsinnretning, og det er derfor soldatene jakter på ham. Professor Honeycutt, eller Fugitoiden, kan være våre venners eneste håp hvis de skal komme seg hjem igjen.

Pa planeten D'Hoonnib møt er Turtles Fugitoiden, alias Professor Honeycutt. Han blir forfulgt av de røffe militærstyrkene til General Blanque som er ute etter Fugitoidens teleportasjonosoppfinnelse. våre helter og Honeycutt håper å skaffe transport bort fra D'Hoonnib og besøker en t vilsom klubb, men blir snart oppdaget.

Triceratons tar Turtles til fange og viI bruke dem i forhandlinger for å tvinge Fugitoiden til a bygge teleportasjonsinnretningen. I fengselet møter Turtles alle slags merkelige skapninger, blant annet Rynokk, som Raph banker i en slasskamp, bare fora havne i isolat .

Velkommen til en stappfull Tr i-sports Arena med jublende blodtørstige Tricetarons som hungrer etter

nådeløse kamper. Herfra kommer ingen gladiatorer levende. vår fire helter er blitt dømt t il a bli

gladiatorer i en hensynsløs "vinn eller dø" -konkurranse.

Turtles har klart seg gjennom fengselsoppholdet. De har klart seg gjennom gladiatorkampene. Og nå som Professor Honeycutt (Fugitoiden) er med dem igjen og med øverste leder som verdifullt gissel, står Turtles overfor sin største utfordring så langt, nemlig å komme seg hjem. Det gjør ikke saken bedre at D’Hoonibians er i hælene på dem. Midt i kampen mellom Triceratons og D’Hoonibians må Turtles beskytte Fugitoiden lenge nok til at han får laget teleportalen. Det er bare ett problem. Han har egentlig aldri testet den før.

Etter å ha returnert fra et heftig eventyr i rommet, havner Turtles i hovedkvarteret til de samme aliensa som teleporterte dem gjennom galaksen. De oppdager en gammel venn, får nye allierte og reiser tilbake i tiden. Der finner de ut ting om sin egen opprinnelse de ikke ante om. Kan det bli mer vilt enn dette? Vel, vi kjenner jo Turtles, så? ja.

Turtles og Splinter har tatt en liten tur til minneland ved hjelp av Utroms høyteknologiske virtual reality innetning og får oppleve Utroms krasjlanding på Jorden og livet i det føydale Japan. Problemet er bare at virkeligheten ikke lenger er virtuell, takket være Baxter Stockman, eller det som er igjen av ham. Våre helter finner ut at denne computergenererte drømmen er mer som et forferdelig mareritt, uten særlig sjanse til å våkne levende.

Turtles og Splinter unnslipper Utroms høyteknologiske virtual reality innetning, bare for å finne ut at Shredder og soldatene hans venter. Det blir nok en høydramatisk kamp for livet mellom våre helter og Shredder. Men klarer Turtles og Splinter å komme seg unna før hele TCRI-bygningen sprenges i fillebiter?

Våre helter tar en liten tur til Caseys bestemors bondegård for å slappe av, men ender opp med en tur til minneland. Hvert minne er hjemsøkt av samme figur, nemlig Shredder. Det virker som om Shredder har spilt en stor rolle i livene deres, kanskje for stor? Og det merkeligste er at han kanskje spiller en rolle i deres opprinnelse.

Ultimate Ninja har kommet tvers over den Interdimensjonale galaksen for å beseire Shredder og vinne ære og berømmelse. Problemet er bare at Leonardo allerede har beseiret Shredder. Derfor vil den Utimate Ninja nå ta Leo ...

Turtles havner i bråk med en mikroskopis fiende når det bisarre Nanomonsteret returnerer for en omkamp. Når tekno-marerittet av en robot hjelper sin kriminelle "pappa" ut fra fengsel og går berserk, blir Turtles nødt til å stoppe den.

Turtles oppdager at de ikke er alene i kloakken. Den grønne gørra som muterte dem for mange år siden, fikk også et annet offer, nemlig Leather Head. Vil Leather Head bli en verdifull alliert eller en formidabel fiende?

Turtles vender tilbake til den eldgamle underjordiske byen de oppdaget i "Notater fra Undergrunnen", bare for å finne ut at byen er forlatt, at krystallmånekraften er borte og at alle menneskene er forvandlet til monstere.

Nå som Shredder er borte, er det fritt frem for alle slags underjordiske fraksjoner og det bryter ut en gjengkrig som truer med å ødelegge hele byen. Hva kan våre fire grønne helter gjøre for å stoppe en by i krig?

Turtles er midt i en eskalerende gjengkrig mellom restene av Foot, Purple Dragons og mafiaen. Vil Turtles overleve den dødelige kampen? Ja, vil byen overleve den dødelige kampen?

Turtles har labbene fulle med å bekjempe mafiaen, Purple Dragons og restene av Foot. De har slått seg sammen med Karai, som var Shredders høyre hånd. Kan de stole på henne?

Med den nye Shellsuben, blir Hudson River, Turtles nye eventyrland. Søpla i elva blir faktisk farligere enn livet i byen, når Turtles treffer på sitt gamle nemesis Søppelmannen.

Casey Jones digger å spille Super Slam Hockey. Men når den legendariske Galden Puck blir stjålet blir ikke Casey særlig blid. Turtles føler at Casey trenger bistand, og hjelper ham på sporet av Galden Puck og skurkene som stjal den.

Shredder er tilbake, uthvilt, reparert, og med nye krefter. Han har en ny plan for verdensherredømme. Men det første han vil gjøre er å utrydde Turtles. Nye ideer, gamle vaner. Turtles må dø!

Shredder kontrollerer en gjeng FootMechs og har sendt en robot-Splinter for å finne og utrydde Turtles. Våre helter bekjemper roboten og sporer den tilbake til Shredder. De tar med seg sitt 250 kilo tunge trumfkort, nemlig Zog, en Triceratonkriger forlatt på jorden. Men vil denne usannsynlige allierte være nok til å redde våre venner og stoppe Shredder? Og, er det et annet trumfkort med i kampen? Vil Karai forbli lojal mot Shredder selv om det strider mot hennes æresfølelse?

Turtles hjelper April med å fikse sjappa hennes og snubler over en puslekule som tilhørte faren hennes. Han forsvant på mystisk vis for et par år siden. De pusler med kulen og blir plutselig transportert til en annen dimensjon, en fæl verden med kjempeinsekter. Men vil denne reisen føre til at April finner ut hva som skjedde med faren? Vil hun få en avklaring? Eller vil hun og Turtles selv ende opp som en mystisk forsvinning.

Mikeys jakt på sjeldne tegneserier fører Turtles og Casey tilbake til Northampton. Der snubler de over en mystisk gal mann som planlegger å kidnappe alle gjenlevende medlemmer av den pensjonerte superheltgjengen kalt Rettferdighetsstyrken. Alle bevis peker mot at et tidligere medlem av gjengen står bak kidnappingene. Men har han også andre skumle ting på agendaen?

Hvert tredje år forsvinner Splinter på mystisk vis og forlater sine fire gutter hjemme. Han vil ikke si hvor han drar. Uten at han vet det, følger de grønne nysgjerrigperene etter. Plutselig er de i en ny dimensjon og midt oppi en slags kvalifiseringskamp til noe som kalles Nexuskampen. Jeg tror Turtles stiller det samme spørsmålet som vi gjør: Hva i grønnskollingers navn er det som foregår?

Turtles er midt i en interdimensjonal turnering og oppdager en side med Splinter de aldri har visst om. For mange år siden vant Splinter turneringen ved å bekjempe en ond kriger ved navn Lord Drako. Og våre fire venner skal snart oppdage at Splinters fortid vil treffe dem midt i trynet!

Nexuskampen fortsetter. Leonardo er blitt forgiftet og ligger bevisstløs og kjemper for livet. Splinter er urettmessig satt i fangenskap for mordforsøk på Daimyo. Det ser ut som den Ultimate Ninja og Lord Drakos plan vil lykkes. Dette kan fort bety slutten for våre helter...