Wir befinden uns in Tokio im Jahre 1969. Die Erde wird von den sogenannten »Eindringlingen« angegriffen. Glücklicherweise weiß aber die Öffentlichkeit davon nichts, denn eine Geheimorganisation mit dem Namen A.E.G.I.S versucht die Invasion mit allen möglichen Mitteln zu stoppen. Als Ukiya Shun gerade auf seinem Weg zu Schule ist, beobachtet er einen Kampf zwischen einem jungen Mädchen und einem Eindringling. Er versucht ihr zu helfen und dabei entdeckt er, dass er, genau wie das Mädchen, die Fähigkeit hat, sogenannte »Tore« zu erschaffen. Diese Fähigkeit ist sonst nur noch ganz wenigen anderen Menschen vergönnt. Weil diese Menschen so selten sind, wird Ukiya von A.E.G.I.S rekrutiert.

1969年，人类获得了名为科学的伟大之力。一方面，为了破坏而进行军备扩充，另一方面，为了生产而迈进经济发展，人类处于矛盾之中。就像抓住了其矛盾般，未知的敌人“侵略者”出现了。为了对抗侵略者，人类在背地秘密组成了地球防卫机构AEGIS。在联合国的指挥下，他们作为地球防卫的最后防线，集结了一群拥有特殊能力的战士“捍卫者”。

一天，极其平凡的高中生浮矢瞬，其沉睡中的捍卫者能力被AEGIS发现了。然后，她被任命为特殊游击队队长。在少年的能力苏醒之时，新的战斗故事开始了。

為了搶奪地球防衛機構AEGIS所開發的新武器「閘門引擎」，人類的敵人「侵略者」發動了猛烈的攻擊。擁有特殊能力的「捍衛者」生澤琉璃子雖然一直奮勇作戰，卻仍然在侵略者壓倒性的攻擊下陷入困境。令人意外的是，最後救她脫困的竟是一個非常普通的高中生，浮矢瞬；而且他還是琉璃子的青梅竹馬...。

'인베이더'라는 수수께끼의 생명체와 싸우는 소년 소녀를 그린 애니메이션

En 1969, Japón está en el centro de un gran auge económico. Eso no significa que todo vaya bien, sin embargo. Unos seres misteriosos, llamados "invasores", se están infiltrando en Japón a un ritmo alarmante. La Organización de Defensa Terrestre AEGIS tiene un arma secreta para combatir a los invasores. Ikisawa Izuniko, es una estudiante que puede abrir una puerta dimensional a otro mundo y traer poderes sobrenaturales devastadores de allí. Un día, en una misión rutinaria, los sensores de AEGIS detectan una gran Puerta en la zona. Es Ukia Shun, un muchacho perdido que no es consciente de su tremendo poder.

En 1969, le Japon est en pleine croissance économique, on découvre que le pays est menacé par des extra-terrestres, infiltrés parmi la population. L'AEGIS, une organisation secrète est alors chargée de lutter contre ces envahisseurs. Pour cela ils emploient des "Gate Keepers", individus possédant un pouvoir psychique permettant d'ouvrir des portails inter-dimensionnels.

Tokio, 1969. De aarde wordt aangevallen door de 'Invaders'. Het publiek is zich hiervan niet bewust, maar bij de geheime organisatie, A.E.G.I.S., is de dreiging bekend, en het is aan hen en hun speciaal uitgeruste 'Gate Keepers' om deze invasie te stoppen.

Tokyo, 1969. Earth is under attack from the "Invaders." The public is unaware of this but to the secret organization, A.E.G.I.S., the threat is known, and it is up them and their special powered "Gate Keepers" to stop this invasion.

A história se passa em 1969, um período em que o Japão está passando por um desenvolvimento econômico e social intensa após o fim da Segunda Guerra Mundial, em 1945. Sem o conhecimento dos seres humanos, seres alienígenas de outra dimensão, chamados de "Invaders" (インベーダー, Invēdā?), surgem com o plano de dominar o mundo, enviando diversos agentes para causar estragos nas cidades, transformando as pessoas em lacaios dos robóticos. Na tentativa de deter os Invaders e defender o planeta, uma organização de elite altamente secreta chamada Alien Exterminating Global Intercept System (lit. Sistema Glboal de Interceptação e Exterminação de Aliens; A.E.G.I.S), foi criada com financiamento do governo. Eles contam com a capacidade dos "Gate Keepers", que têm o poder de abrir portões dimensionais através de uma energia paranormal que dá a eles superpoderes. Estes superpoderes são as únicas coisas que tem efeito sob os Invaders

Токио, 1969. Земля находится под нападением "Захватчиков". К счастью, общественность не сознает это. Но для организации, A.E.G.I.S, угроза очень реальна, и это - они, кто остановит это вторжение. Однажды по пути к средней школе, Ukiya, наблюдает сражение между молодой девочкой и группой Захватчиков. Он заканчивает тем, что помог ей и обнаруживает, что он также как и девочка обладает способностью вызывать "врата" которой одарены только несколько людей. В результате Ukiya присоединяется к A.E.G.I.S, чтобы защитить город, прилагая все усилия.