머지않은 미래. 국민의 열 명 중 한 명은 휴머노이드인 세상. 스도 히카루는 휴머노이드를 전문으로 치료하는 의사이다. 모가디트라는 어둠의 의사이기도 한 스도에게, 어느 날 은밀한 의뢰가 들어온다. 불법으로 인격을 백업한 후, 아내의 몸에 이상이 생겼다는 한 남자의 진료 의뢰였다. 스도는 간호사 리사의 만류에도 의뢰인의 집으로 향하는데...
육상부의 단거리 달리기 선수인 준은 휴머노이드다. 준은 언제부턴가 아무리 노력해도 기록이 좋아지지 않자 고민에 빠진다. 휴머노이드인 자신의 몸은 애초에 사양이 정해져 있어 성장하는 데 한계가 있다는 것. 인간인 친구 마사의 성장을 보는 준의 마음은 심란하기만 하다. 한편, 스도의 오랜 친구 카오루가 스도의 병원으로 찾아오는데...
어느 날 스도의 병원으로 망가진 곰 인형 로봇을 든 소년이 찾아온다. 소년 켄지의 엄마는 로봇에게 지나치게 의존하는 아들을 걱정하며 둘을 떼어놓으려고 한다. 한편, 시즈카는 연인 로봇 조와 7년째 함께 지내왔다. 인간보다 성실하고 다정한 조는 시즈카에게 특별한 존재다. 인간 남자 친구가 생긴 시즈카는 괴로워하며 조에게 이별을 통보하지만...
리사, 노자키, 히데, 레온. 네 사람은 각자 다른 고민을 안고 있다. 고등학생 노자키는 좋아하는 사사키의 모습을 한 게임 캐릭터를 만든다. 급기야 게임 캐릭터와 데이트까지 즐기는 노자키. 가상과 현실을 구분하라는 스도의 충고에도 결국 게임에 푹 빠져버리고 만다. 어느 날 '진짜' 사사키가 노자키에게 뜻밖의 제안을 하는데...
휴머노이드 소년 유타는 피아노에 뛰어난 재능이 있지만 감정을 잘 컨트롤하지 못하는 탓에 학교생활에 어려움을 겪는다. 유타의 엄마는 결국 아들을 데리고 스도의 병원을 방문한다. 한편, 원인 모를 불면증과 악몽에 시달리던 마츠무라 역시 스도에게 진찰을 받는다. 마츠무라의 전뇌를 검사해 본 스도는 옛 지인을 찾아가는데...
다양한 분야에 활용되는 산업 AI는 어느새 인간의 생활에 깊숙하게 파고들었다. AI를 탑재한 로봇이 인간과 함께 지내며 필요한 지식과 기술을 습득하기도 한다. 전통 기술을 기록하기 위해 대장간으로 간 로봇 '배우다 군'. 사람과 소통하는 법을 배우기 위해 초등학교로 간 로봇 '파마 군'. 두 로봇은 놀라운 학습 능력을 발휘하는데...
전뇌에 큰 손상을 입은 한 노인. 손녀의 노랫소리로 잠시나마 감정을 되찾는 그의 사연이 미담이 된다. 하지만 이것을 탐탁지 않게 여기는 인권 단체 직원이 노인과 가족들을 스도의 병원으로 데려온다. 한편, 고객 응대 업무를 담당하는 휴머노이드 남성도 스도의 병원을 찾는다. '인간'의 사과만을 요구하는 고객들 때문에 스트레스를 받고 있는데...
리사는 밸런타인데이를 맞아 스도에게 선물할 초콜릿케이크를 만든다. 서툴지만 정성스럽게 만든 케이크로 마음을 전하는 리사에게 스도도 나름대로 고마움을 표현한다. 어느 날 리사의 친구 레온이 스도의 병원을 찾는다. 갑작스러운 방문에 걱정이 된 리사는 이유를 묻지만, 레온은 좀처럼 대답해 주려 하지 않는데...
어린이를 위한 단체에서 활동하는 타구치. 최근 아이들 사이에서 큰 인기를 끌고 있는 애니메이션 때문에 걱정이 이만저만이 아니다. 결국 타구치는 이 불건전한 애니메이션을 만드는 크리에이터와 담판을 짓기로 한다. 한편, 한 청년이 초등학교의 선생님으로 일하게 된다. AI를 배제하고 사람에 의한 교육을 강조하는 학교의 독특한 방침에 적응해 보려 하지만...
한 여성이 살해되는 사건이 발생한다. 체포된 용의자는 휴머노이드 고혼기 테츠야. 촉망받는 신의과 의사였다. 스도는 취조받는 용의자의 전뇌를 모니터링해 달라는 부탁을 받는다. 한편, 초고도 AI를 신성시하고 사후 세계를 주장하는 '스피리추얼'이 큰 인기를 끈다. 교주 테시가와라의 뒤를 캐던 기자인 나카노가 스도의 병원으로 찾아오는데...
투 피라는 여성이 리사에게 찾아와 자신을 동생이라고 소개한다. 어릴 때 헤어진 리사의 아빠가 인도에서 입양한 딸이었다. 투 피는 당분간 리사의 집에서 지내게 되고, 리사는 투 피에게 왠지 모를 친근감을 느낀다. 한편, 스도는 프로젝트의 심사 멤버가 되어 달라는 미치의 부탁을 거절한다. 미치는 스도를 설득하기 위해 뜻밖의 거래를 제안하는데...
스도는 자신에게 거래를 제안한 미치를 만나러 간다. 미치는 로비디아에 가면 복제된 인격을 찾을 가능성이 높다고 알려 준다. 내전 중인 위험천만한 나라 로비디아. 목숨을 잃을 수도 있는 상황이지만, 스도는 어머니의 인격을 찾기 위해 떠나기로 결심한다. 리사는 스도에게 갑작스러운 작별 통보를 받고 슬픔에 잠기는데...
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